replicateFest: An R Package and Shiny App for Analysis of T Cell Receptor Repertoire Data from the Functional Expansion
L'article présente replicateFest, un package R et une application web Shiny conçus pour analyser les données de répertoire de récepteurs de cellules T issues d'essais de l'expansion fonctionnelle de cellules T spécifiques (FEST) en employant des modèles statistiques qui tiennent compte des réplicats biologiques et techniques afin d'identifier de manière robuste les clonotypes antigéniques-spécifiques.