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Genomic analysis of Klebsiella pneumoniae causing community-acquired respiratory deaths among Zambian infants and children using targeted RNA-probe hybridization-capture metagenomics

Cette étude génomique menée au Zambia révèle que des souches de *Klebsiella pneumoniae* multirésistantes et potentiellement hypervirulentes, détectées par séquençage métagénomique ciblé sur ARN, sont responsables de décès respiratoires communautaires chez des enfants, signalant un changement épidémiologique préoccupant qui nécessite une investigation urgente en Afrique subsaharienne.

Lindstedt, K., Wheelock, A., Samutela, M. + 25 more2026-04-15🦠 microbiology

Regional adaptation to mosquito vectors shapes Plasmodium falciparum populations

Cette étude démontre que la compatibilité entre le parasite *Plasmodium falciparum* et les moustiques vecteurs est un trait polygénique façonné par une adaptation régionale, où des variations alléliques spécifiques dans des protéines d'invasion du midgut (telles que CTRP et WARP) modulent la transmission en fonction de la composition des communautés de vecteurs locaux.

Loesbanluechai, D., Sollelis, L., Armstrong, M. + 15 more2026-04-14🦠 microbiology

Baseline microbiomes of the pillar coral Dendrogyra cylindrus reveal novel taxa and regional differences

Cette étude caractérise les microbiomes de base du corail pilier *Dendrogyra cylindrus* au Belize et à Curaçao, révélant des taxons bactériens novateurs, des différences régionales dans les souches dominantes et l'importance de ces lignées microbiennes uniques pour la santé du corail et les efforts de restauration.

Cauvin, A., Carne, L., Marhaver, K. L. + 5 more2026-04-14🦠 microbiology

Mixtures that Matter: Correlation Patterns in Antibacterial and Cytotoxic Activities of Five Hop Isolates

Cette étude évalue les corrélations entre l'activité antibactérienne et cytotoxique de cinq isolats de houblon, révélant que leurs interactions varient selon l'organisme cible et mettant en évidence que les combinaisons d'humulone et de lupulone offrent le meilleur équilibre entre efficacité antimicrobienne et sécurité pour le développement d'additifs phyto-géniques.

Kober, L., von Karger, L., Castiglione, K.2026-04-14🦠 microbiology

Body temperature drives azole tolerance in Candida albicans by hindering the autophagic degradation of Erg11

Cette étude révèle que la température corporelle humaine (37°C) favorise la tolérance de *Candida albicans* aux azoles en inhibant l'autophagie via un dysfonctionnement mitochondrial, ce qui empêche la dégradation de la cible Erg11 et suggère que la promotion de cette dégradation pourrait améliorer l'efficacité des antifongiques.

Feng, Y., Zhen, C., Li, W. + 5 more2026-04-12🦠 microbiology

Tracking active heterotrophic microbial communities in the Guaymas Basin deep biosphere with BONCAT-FACS

Cette étude optimise la méthode BONCAT-FACS pour révéler que des communautés microbiennes hétérotrophes, dominées par des Gammaproteobacteria, des Bacilli, des Deinococci et des Alphaproteobacteria, restent métaboliquement actives jusqu'à 154 mètres sous le plancher océanique du bassin de Guaymas, où elles contribuent au cycle de la matière organique hydrothermale grâce à des voies métaboliques incluant le métabolisme du C1 et la fermentation.

Montgomery, A., Nupp, S., Gray, C. + 3 more2026-04-12🦠 microbiology

Structural determinants of endopilus assembly, stability and functional specificity in bacterial type II secretion

Cette étude combine des analyses structurales, mutagéniques et biophysiques des endopili des systèmes de sécrétion de type II Out et Pul pour révéler comment de subtiles variations de séquence dans ces nanomachines conservées déterminent leur stabilité et leur spécificité fonctionnelle vis-à-vis de leurs niches écologiques respectives.

Lejeune, M., Ivashchenko, S., Dazzoni, R. + 9 more2026-04-12🦠 microbiology

Bacterial Signatures and Community Structure in the Phyllosphere of Eugenia uniflora: Developmental Dynamics and Core Microbiome in Myrtaceae

Cette étude caractérise la dynamique développementale et la structure du microbiome bactérien de la phyllosphère d'*Eugenia uniflora*, révélant des différences significatives entre les arbres jeunes et matures ainsi qu'un noyau microbien partagé au sein de la famille des Myrtacées.

Cadavid Sanchez, I. C., Esquen, D., Margis, R. + 1 more2026-04-12🦠 microbiology

Adaptation of the freshwater anaerobic methanotroph 'Ca. Methanoperedens vercellensis' to low pH levels reveals membrane lipid remodelling

Cette étude démontre que l'archée méthanotrophe anaérobie d'eau douce 'Ca. Methanoperedens vercellensis' s'adapte aux faibles pH (jusqu'à 5,65) grâce à un remodelage de ses lipides membranaires, lui permettant de maintenir son activité d'oxydation du méthane dans les écosystèmes acides.

Tlaskal, V., Egas, R. A., Wang, W. + 6 more2026-04-12🦠 microbiology

Characterization of household microbiomes from three unique cities around the world

Cette étude utilise le métagénomique par séquençage shotgun pour caractériser les microbiomes de dix maisons dans trois villes (Mysuru, Dubaï et Tucson), révélant des différences significatives de diversité bactérienne liées aux facteurs culturels et environnementaux, tout en identifiant un microbiome de base commun à toutes les habitations.

Scranton, C., Obergh, V., Goforth, M. + 10 more2026-04-12🦠 microbiology

Distinct sub-MIC kill kinetics of Cu and Ag in Escherichia coli

Cette étude démontre que, contrairement à l'argent qui provoque une élimination transitoire suivie d'une repousse des cellules survivantes, le cuivre impose une inhibition de la croissance soutenue et dose-dépendante chez *Escherichia coli* à des concentrations sub-inhibitrices, soulignant ainsi les limites des tests non cinétiques comme la CMI pour évaluer les risques de résistance.

Rosenberg, M., Umerov, S., Tear, C. M. + 1 more2026-04-11🦠 microbiology

Single-cell carbon storage dynamics drive conditional fitness in microbes

Cette étude démontre que le stockage du carbone sous forme de PHB chez *Cupriavidus necator* n'améliore pas la croissance en conditions optimales mais confère un avantage de fitness décisif lors des transitions environnementales en prolongeant la prolifération durant la famine et en accélérant la récupération, grâce à une héritage asymétrique des granules au niveau cellulaire et à une régulation homéostatique au niveau populationnel.

Huang, J., Yuan, R., Ma, Y. + 2 more2026-04-10🦠 microbiology

Mobile element-mediated carbapenem resistance in Enterobacter hormaechei in a Nigerian intensive care unit

Cette étude menée dans une unité de soins intensifs nigériane révèle que la résistance aux carbapénèmes chez *Enterobacter hormaechei* est principalement propagée par la dissémination horizontale d'un plasmide porteur d'un îlot de résistance conservé contenant le gène *blaNDM-5*, plutôt que par une épidémie clonale d'*Acinetobacter baumannii* initialement suspectée.

Mba, I. E., Odih, E. E., Adekanmbi, O. + 9 more2026-04-10🦠 microbiology

Reconstructing plant beneficial bacterial consortia by integrating dilution-to-extinction microbiome perturbation with genome-resolved synthetic ecology

En intégrant des perturbations microbiennes par dilution à l'extinction, du séquençage métagénomique et de l'écologie synthétique, cette étude reconstruit un consortium bactérien synthétique capable de reproduire la suppression des maladies fongiques chez le blé et identifie un nouveau cluster de gènes NAPAA chez *Arthrobacter* produisant des composés antifongiques.

Jing, J., Ossowicki, A., Tracanna, V. + 12 more2026-04-10🦠 microbiology

Assessment of the household antibiotic resistance gene, virulence factor genes, and pathogen profiles from three global cities

Cette étude compare la diversité des gènes de résistance aux antibiotiques, des facteurs de virulence et des profils pathogènes dans les foyers de trois villes mondiales (Mysuru, Dubaï et Tucson), révélant des différences significatives liées à la géographie et aux types de locaux, ainsi que des viromes distincts caractérisés par une prédominance de bactériophages à Mysuru et une plus grande diversité virale à Dubaï et Tucson.

Scranton, C., Obergh, V., Goforth, M. + 10 more2026-04-10🦠 microbiology