microbiology articles | Gist.Science

Polymicrobial extracellular vesicles reduce the innate immune response of human cystic fibrosis bronchial epithelial cells

Cette étude démontre que les vésicules extracellulaires polymicrobiennes issues d'une communauté bactérienne typique de la mucoviscidose exacerbent la réponse immunitaire innée et inhibent la fonction CFTR des cellules épithéliales bronchiques humaines, même en présence du traitement modulateur Trikafta, expliquant ainsi la persistance des infections et de l'inflammation chez les patients.

Charpentier, L. A., Barnaby, R., Roche, C. + 8 more2026-04-10🦠 microbiology

Fast and reliable association discovery in large-scale microbiome studies and meta-analyses using PALM

Cet article présente PALM, un cadre de régression quasi-Poisson conçu pour permettre une découverte rapide et fiable d'associations dans les grandes études et méta-analyses du microbiome, en surmontant les défis de complexité des données pour améliorer le contrôle des faux positifs, la puissance statistique et l'efficacité computationnelle.

Wei, Z., Hong, Q., Chen, G. + 6 more2026-04-10🦠 microbiology

Antifungal and Bioactive Potential of Pleurotus ostreatus Cultivated on Agro-Waste Substrates with Molecular Identification and Functional Characterization

Cette étude démontre que la culture de *Pleurotus ostreatus* sur des substrats de déchets agricoles au Nigeria, après identification moléculaire, produit des extraits aux propriétés antifongiques et antioxydantes significatives contre des pathogènes cliniques, soulignant l'influence du substrat sur le potentiel bioactif de ce champignon.

Adetuwo, O. J., Ogundana, F. N.2026-04-10🦠 microbiology

Polyphosphate acts as an architectural regulator of carbon fixation and nucleoid structure in cyanobacteria

Cette étude révèle que le polyphosphate agit comme un régulateur architectural chez les cyanobactéries en organisant simultanément la structure du nucléotide et la disposition des carboxysomes, assurant ainsi l'intégrité de la fixation du carbone et la fitness photosynthétique.

Dudley, C. E., Foust, D. J., Savage, D. F. + 2 more2026-04-10🦠 microbiology

Modification-aware AI enables terminal chemical modifications for peptide design and discovers potent antimicrobials

Cette étude présente Termini, un cadre d'intelligence artificielle générative capable de concevoir des peptides antimicrobiens avec des modifications terminales spécifiques, ayant permis de découvrir des candidats thérapeutiques puissants et efficaces à la fois in vitro et in vivo.

Xu, J., Torres, M. D. T., Li, C. + 4 more2026-04-10🦠 microbiology

Biological Synthesis of Silver Nanoparticles with Aqueous Extract of Azadirachta indica Leaf and Its Antimicrobial Activity on Uropathogenic MDR and ESBL Producing Escherichia coli.

Cette étude démontre que la biosynthèse de nanoparticules d'argent à partir d'extraits de feuilles de neem (Azadirachta indica) produit des nanoparticules stables et sphériques d'environ 74 nm qui exercent une puissante activité antibactérienne contre des souches d'Escherichia coli multirésistantes tout en présentant une faible toxicité pour les cellules humaines rénales.

Das, P.2026-04-10🦠 microbiology

Gut Microbiota Mediates the Association between Diet Quality and Ectopic Adiposity: The Multiethnic Cohort Adiposity Phenotype Study

Cette étude de la cohorte Multiethnic Adiposity Phenotype démontre que la qualité du régime alimentaire influence la distribution des graisses ectopiques, notamment viscérales et hépatiques, en partie par l'intermédiaire de la modulation de la composition du microbiote intestinal, en particulier via des genres bactériens producteurs d'acides gras à chaîne courte et d'acides biliaires secondaires.

Wang, S., Hullar, M. A. J., Curtis, K. R. + 11 more2026-04-10🦠 microbiology

The IL-1 Family Controls Acute Mucosal Fungal Infection and Mucosal-Systemic Dissemination.

Cette étude démontre que la famille de l'IL-1 est essentielle pour initier la réponse immunitaire muqueuse contre *Candida albicans* en régulant les peptides antimicrobiens et les neutrophiles, empêchant ainsi la dissémination systémique et la mortalité, en particulier chez les patients neutropéniques.

Griffiths, J. S., Kempf, A., Pickering, R. J. + 12 more2026-04-10🦠 microbiology

LGTM: Gaussian Process Modulated Neural Topic Modeling for Longitudinal Microbiome

Le papier présente LGTM, un cadre de modélisation probabiliste qui combine l'apprentissage de sujets microbiens interprétables avec une modélisation longitudinale non linéaire flexible pour analyser les dynamiques complexes des communautés microbiennes en réponse aux covariables hôtes et environnementales.

Yuan, X., Arany, A., Formanek, A. + 3 more2026-04-10🦠 microbiology

Reduced precipitation alters microbial availability and redistribution of rhizosphere carbon

Une étude menée en prairie méditerranéenne révèle que la réduction des précipitations limite le mouvement du carbone racinaire vers le sol environnant, ce qui isole davantage les microhabitats et intensifie l'incorporation de ce carbone par les micro-organismes rhizosphériques ainsi que leurs interactions écologiques.

Zeba, N., Estera-Molina, K. Y., Jian, S. + 8 more2026-04-10🦠 microbiology

A conserved peptidase governs glucose homeostasis in Bacteroides

Cette étude révèle qu'une peptidase M16 conservée chez *Bacteroides* régule l'homéostasie du glucose en contrôlant l'activité du régulateur transcriptionnel Cur via la voie des pentoses phosphates oxydatifs, établissant ainsi un mécanisme spécifique par lequel l'abondance de glucose dans l'hôte affecte la fitness des bactéries commensales.

Townsend, G. E., Verma, K., Kabonick, S. G. + 3 more2026-04-10🦠 microbiology

A structure-guided pipeline yields peptide inhibitors that disarm fungal peptidase-driven virulence and resistance

Cette étude présente une pipeline guidée par la structure qui conçoit des inhibiteurs peptidiques ciblant des peptidases virulentes de *Cryptococcus neoformans*, désarmant ainsi le pathogène pour permettre son élimination par le système immunitaire sans nuire aux cellules hôtes ni favoriser la résistance.

Gutierrez-Gongora, D., Hambly, J., Chan, N. + 14 more2026-04-10🦠 microbiology

Continental-scale multi-omics reveals a distinct microbial-viral biome in sandy beach ecosystems structured by tidal zonation

Cette étude multi-omiques à l'échelle continentale révèle que les plages de sable constituent un biome microbien et viral distinct, structuré par la zonation tidale et caractérisé par une exceptionnelle nouveauté génomique et des capacités métaboliques uniques pour la transformation des hydrocarbures et des plastiques.

Dong, X., Cai, F., Han, Y. + 14 more2026-04-10🦠 microbiology

Development of host-mimicking legume-based media for robust induction of sporulation in soybean-associated Cercospora species

Cette étude présente le développement de milieux de culture à base de légumineuses qui, en mimant les conditions de l'hôte, induisent une sporulation plus robuste et fiable chez les espèces de *Cercospora* associées au soja par rapport aux milieux artificiels traditionnels.

Lee, N., Yang, J., Kwon, Y. + 4 more2026-04-10🦠 microbiology

A pooled screening approach reveals bacterial chemoreceptors for short-chain carboxylic acids

Cette étude présente une méthode de criblage par pool qui a permis d'identifier chez les espèces de *Pseudomonas* une nouvelle famille de chimiorécepteurs capables de détecter spécifiquement les acides carboxyliques à chaîne courte (C3), révélant ainsi les mécanismes structuraux sous-jacents à cette reconnaissance ligand-récepteur.

Oka, H., Mai, D., Yu, S. + 7 more2026-04-10🦠 microbiology

A Syntenic Pangenome of Gardnerella Reveals Novel Plasmids and Phage, Taxonomic Boundaries, and Species-Level Stratification of Metabolic and Virulence Potential

Cette étude propose un cadre taxonomique unifié pour le genre *Gardnerella* en identifiant 21 lignées (11 espèces et 15 sous-espèces) grâce à une analyse pangenomique syntenique de 312 génomes, révélant ainsi de nouveaux plasmides cryptiques, des facteurs de virulence et des métabolismes spécifiques à chaque espèce pour mieux comprendre et traiter la vaginose bactérienne.

Bouzek, H., Zepeda Rivera, M., Srinivasan, S. + 10 more2026-04-09🦠 microbiology

Azospirillum brasilense and tomato exudate or cytidine increases phytopathogen resistance and modulates phyllosphere/rhizosphere

Cette étude démontre que l'association d'*Azospirillum brasilense* Sp7 avec le cytidine ou l'exsudat de tomate renforce la résistance des tomates au pathogène *Pseudomonas syringae* en modulant la composition microbienne du phyllosphère et de la rhizosphère, sans pour autant réduire la charge bactérienne dans les feuilles.

Tagoe, J., Ojha, B., Horne, S. M. + 1 more2026-04-09🦠 microbiology

Rumen transfaunation between low- and high-methane-yielding dairy cows reveals asymmetric microbiome reconstitution patterns: a pilot study

Cette étude pilote démontre que, malgré un échange complet de contenu ruminal entre des vaches laitières à faible et à forte émission de méthane, les facteurs de l'hôte influencent la réconstitution du microbiome et le maintien du phénotype d'émission, les vaches à faible émission retrouvant leur flore native tandis que celles à forte émission conservent une flore de donneur tout en continuant à émettre beaucoup de méthane.

Niu, P., Kobel, C., Aho, V. T. E. + 6 more2026-04-09🦠 microbiology

Synbiotic Yogurt with Lactobacillus plantarum and Stevia rebaudiana: Physicochemical, Microbiological, and Functional Evaluation

Cette étude démontre que l'enrichissement du yaourt avec *Lactobacillus plantarum* et un extrait de *Stevia rebaudiana* permet de développer un produit synbiotique fonctionnel aux propriétés antioxydantes, nutritionnelles et sensorielles améliorées.

Dhakal, P., Lama, S., Chaudhary, P.2026-04-09🦠 microbiology

Functional Divergence and Conservation in the QueC Protein Family (PF06508): From tRNA Modification to Anti-Phage Defense

Cette étude révèle comment la super-famille de protéines QueC (PF06508), initialement connue pour la biosynthèse de dérivés de la 7-déazaguanine, a évolué pour acquérir de nouvelles fonctions, notamment des rôles dans la défense anti-phage, grâce à une analyse combinée des réseaux de similarité de séquences et des voisinages génomiques.

Libby, K. M., Benda, R., de Crecy-Lagard, V. + 1 more2026-04-09🦠 microbiology

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