Distinct virus-specific regulation of RNA synthesis across genome segments by thogotovirus polymerases: insights from Oz virus and Dhori virus

Cette étude démontre que la régulation de la synthèse d'ARN par les polymérases des thogotovirus varie selon le virus et le segment génomique, car la séquence de la double hélice distale module l'activité du promoteur chez le virus Oz mais pas chez le virus Dhori, permettant ainsi de classer ces virus en deux groupes distincts.

Rakib, T. M., Mashimo, R., Akter, L. + 4 more2026-04-01🦠 microbiology

Pseudogenization of the cntQ permease confers distinct yersinopine-metal uptake selectivity in Yersinia species

Cette étude révèle que la pseudogénisation du gène *cntQ* chez *Yersinia pestis* a reconfiguré la spécificité d'acquisition des métaux du système cnt, passant de l'absorption du fer chez *Y. pseudotuberculosis* à celle du zinc, illustrant ainsi comment la réduction génomique peut remodeler la physiologie bactérienne.

Laffont, C., Pradel, E., Ouerdane, L. + 8 more2026-03-31🦠 microbiology

DcaP-Family Porins are Required for Carboxylic Acid Utilization and Infection in Acinetobacter baumannii

Cette étude démontre que les porines de la famille DcaP chez *Acinetobacter baumannii* sont essentielles à l'utilisation d'acides carboxyliques comme sources de carbone et à la virulence lors d'infections systémiques, validant ainsi leur potentiel en tant que cibles thérapeutiques malgré leur redondance fonctionnelle.

Noel, H., Kesav, N. R., Winkelman, J. + 1 more2026-03-31🦠 microbiology

The switch from bacterial phosphorus mineralization to arbuscular mycorrhiza in root hairless wheat during crop development

Cette étude révèle que le blé, y compris le mutant sans poils racinaires, effectue une transition temporelle de la nutrition phosphorée médiée par des bactéries vers une dépendance accrue aux champignons mycorhiziens à arbuscules au cours de son développement, les champignons compensant ainsi l'absence de poils racinaires.

Herms, C., Tsang, I., Bak, F. + 8 more2026-03-31🦠 microbiology

Antimicrobial Combination Effects at Sub-inhibitory Doses do not Reliably Predict Effects at Inhibitory Concentrations

Cette étude démontre que les interactions médicamenteuses antibactériennes mesurées à des doses sous-inhibitrices ne prédisent pas de manière fiable leur comportement à des concentrations inhibitrices cliniquement pertinentes, car la nature de l'interaction (synergie ou antagonisme) varie en fonction de la concentration et du ratio de mélange.

Muetter, M., Angst, D. C., Regoes, R. R. + 1 more2026-03-31🦠 microbiology

Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome

Grâce à un séquençage Nanopore de haute profondeur et à l'assembleur myloasm, cette étude a permis de reconstruire sans curation manuelle 488 génomes complets d'un microbiome estuarien, révélant la coexistence de structures de population radicalement différentes au sein d'une même échantillon, notamment une diversité extrême chez *Pelagibacter* et une quasi-monotypie chez HIMB114.

Lui, L. M., Nielsen, T.2026-03-31🦠 microbiology

Body-wrapping anterior flagella drive ultrafast swimming in bacterial zoospores

Cette étude révèle que les zoospores d'*Actinoplanes missouriensis* atteignent une vitesse de nage ultra-rapide (environ 500 longueurs de corps par seconde) grâce à un faisceau de flagelles antérieurs enveloppant le corps qui tournent de manière synchronisée, établissant ainsi un nouveau principe de locomotion basé sur l'organisation supramoléculaire plutôt que sur la vitesse du moteur.

Uemura, N. A., Ishida, T., Sowa, Y. + 4 more2026-03-31🦠 microbiology

A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids

Cette étude présente PInc, un cadre de classification des plasmides bactériens centré sur la réplication et fondé sur les protéines d'initiation de la réplication (RIP), qui permet de reconstruire une phylogénie à grande échelle reliant près de 100 000 plasmides et de révéler leur diversité évolutive profonde au-delà des biais d'hôte traditionnels.

Nishimura, Y., Kaneko, K., Kamijo, T. + 13 more2026-03-30🦠 microbiology

A Droplet Digital PCR Assay for Quantification of Bacteriophage Viral Vector Titer and Purity.

Cette étude présente un assay optimisé par PCR digitale en gouttelettes (ddPCR) permettant une quantification précise et reproductible de la pureté et de la puissance des vecteurs viraux à base de bactériophages, surpassant les méthodes d'activité biologique traditionnelles en évitant la sous-estimation des vecteurs transgéniques.

Voorhees, P. J., Ponek, R. M., Liu, J. D. + 1 more2026-03-30🦠 microbiology

Structural modeling reveals the mechanism of motor ATPase coordination during type IV pilus retraction

En combinant modélisation computationnelle et validation expérimentale, cette étude révèle que l'interaction entre les ATPases motrices PilT et PilU, en particulier via le C-terminal de PilU, est un mécanisme conservé essentiel à la rétraction coordonnée et puissante des pili de type IV chez diverses bactéries.

Teipen, A. E., Holt, J. D., Lynch, D. L. + 5 more2026-03-30🦠 microbiology

Synergistic interactions of mobile genetic elements shape the stepwise evolution of multidrug-resistant plasmids

Cette étude propose un cadre évolutif « 3I » intégrant les intégrons, IS26 et ISCR pour expliquer comment leurs interactions synergiques conduisent à l'accumulation progressive de gènes de résistance aux antibiotiques sur les plasmides multirésistants, offrant ainsi de nouveaux marqueurs génétiques pour la surveillance.

Mao, Y., Zhang, G., Han, Z. + 3 more2026-03-30🦠 microbiology

A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles

Cet article présente un cadre d'apprentissage automatique utilisant les profils du locus rfb pour prédire avec précision les sérogroupes de *Leptospira* pathogènes, offrant une alternative évolutive aux tests sérologiques traditionnels et introduisant le concept de « séroclasse » pour une classification génomique plus robuste.

de Carvalo Ferreira Filho, E., Melo Arruda, P., Cabral Afonso Ferreira, L. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

A set of constitutive promoters with graded strengths for gene expression in diverse cyanobacterial strains

Cette étude présente la caractérisation d'une bibliothèque de promoteurs constitutifs orthogonaux aux forces graduées, dérivés du promoteur synthétique PconII d'E. coli, qui fonctionnent de manière fiable dans diverses souches de cyanobactéries modèles et non modèles, offrant ainsi des outils génétiques essentiels pour l'ingénierie métabolique et la production de bioproduits renouvelables.

Trieu, K., Bishe, B., Taton, A. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage

L'étude démontre que l'assai métagénomique optimisé ONETest PathoGenome, évalué sur plusieurs cohortes de liquides de lavage bronchoalvéolaire, améliore significativement la détection des pathogènes des voies respiratoires inférieures par rapport aux cultures conventionnelles, offrant une sensibilité élevée, une spécificité de 99 % et un délai de résultat inférieur à 24 heures.

Massoumi Alamouti, S., Nguyen, H. D., Daneshpajouh, H. + 9 more2026-03-30🦠 microbiology