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Grâce à un séquençage Nanopore de haute profondeur et à l'assembleur myloasm, cette étude a permis de reconstruire sans curation manuelle 488 génomes complets d'un microbiome estuarien, révélant la coexistence de structures de population radicalement différentes au sein d'une même échantillon, notamment une diversité extrême chez *Pelagibacter* et une quasi-monotypie chez HIMB114.
Cette étude révèle que les zoospores d'*Actinoplanes missouriensis* atteignent une vitesse de nage ultra-rapide (environ 500 longueurs de corps par seconde) grâce à un faisceau de flagelles antérieurs enveloppant le corps qui tournent de manière synchronisée, établissant ainsi un nouveau principe de locomotion basé sur l'organisation supramoléculaire plutôt que sur la vitesse du moteur.
Cette étude propose la description de *Gardnerella fastidiominuta* sp. nov., une nouvelle espèce bactérienne isolée du microbiome urinaire féminin, caractérisée par une approche taxonomique polyphasique combinant des analyses phylogénétiques, génomiques et phénotypiques.
Cette étude présente PInc, un cadre de classification des plasmides bactériens centré sur la réplication et fondé sur les protéines d'initiation de la réplication (RIP), qui permet de reconstruire une phylogénie à grande échelle reliant près de 100 000 plasmides et de révéler leur diversité évolutive profonde au-delà des biais d'hôte traditionnels.
Cette étude démontre que la méthylation de la base nucléique du 5-méthyl-3'-dUTP permet non seulement une terminaison efficace de la chaîne par la RdRp du SARS-CoV-2, mais confère également une résistance significative à l'exonucléase de correction nsp14-nsp10, en identifiant ce composé comme un candidat antiviral prometteur.
Cette étude présente un assay optimisé par PCR digitale en gouttelettes (ddPCR) permettant une quantification précise et reproductible de la pureté et de la puissance des vecteurs viraux à base de bactériophages, surpassant les méthodes d'activité biologique traditionnelles en évitant la sous-estimation des vecteurs transgéniques.
En combinant modélisation computationnelle et validation expérimentale, cette étude révèle que l'interaction entre les ATPases motrices PilT et PilU, en particulier via le C-terminal de PilU, est un mécanisme conservé essentiel à la rétraction coordonnée et puissante des pili de type IV chez diverses bactéries.
Cette étude propose un cadre évolutif « 3I » intégrant les intégrons, IS26 et ISCR pour expliquer comment leurs interactions synergiques conduisent à l'accumulation progressive de gènes de résistance aux antibiotiques sur les plasmides multirésistants, offrant ainsi de nouveaux marqueurs génétiques pour la surveillance.
En utilisant le blé comme modèle, cette étude révèle que l'ajout de biochar modifie les exsudats racinaires pour restructurer le microbiome de la rhizosphère en favorisant des bactéries bénéfiques, ce qui améliore la croissance des plantes et réduit les émissions de gaz à effet de serre.
Cet article présente un cadre d'apprentissage automatique utilisant les profils du locus rfb pour prédire avec précision les sérogroupes de *Leptospira* pathogènes, offrant une alternative évolutive aux tests sérologiques traditionnels et introduisant le concept de « séroclasse » pour une classification génomique plus robuste.
Cette étude démontre que la souche BALB/cJRJ femelle de 5 à 6 semaines constitue le modèle murin le plus fiable pour étudier la progression chronique de l'infection à *Mycobacterium abscessus*, car elle présente une infection plus durable et une variabilité réduite indépendamment du sexe et de l'âge.
Cette étude présente la caractérisation d'une bibliothèque de promoteurs constitutifs orthogonaux aux forces graduées, dérivés du promoteur synthétique PconII d'E. coli, qui fonctionnent de manière fiable dans diverses souches de cyanobactéries modèles et non modèles, offrant ainsi des outils génétiques essentiels pour l'ingénierie métabolique et la production de bioproduits renouvelables.
L'étude démontre que l'assai métagénomique optimisé ONETest PathoGenome, évalué sur plusieurs cohortes de liquides de lavage bronchoalvéolaire, améliore significativement la détection des pathogènes des voies respiratoires inférieures par rapport aux cultures conventionnelles, offrant une sensibilité élevée, une spécificité de 99 % et un délai de résultat inférieur à 24 heures.
Cette étude caractérise des isolats de *Lactobacillus* provenant de femmes sud-africaines et identifie les souches de *L. crispatus* comme les candidates les plus prometteuses pour le développement d'un biothérapeutique vivant adapté à la population locale afin de prévenir la vaginose bactérienne et le VIH.
Cette étude révèle que la structure cristalline de la flagelline d'E. coli Nissle 1917, caractérisée par un domaine hypervariable et un lien étendu, est essentielle à la motilité bactérienne dans des environnements spécifiques mais n'influence pas la reconnaissance par le récepteur immunitaire TLR5.
Cette étude démontre que la protéine cellulaire DDX3X régule le cycle de réplication du virus Zika dans les cellules microgliales humaines en favorisant la synthèse des protéines virales tout en interférant avec la synthèse de l'ARN viral, révélant ainsi un mécanisme spécifique d'interaction hôte-pathogène qui en fait une cible thérapeutique potentielle.
Cette étude démontre que les bactéries commensales de l'intestin humain régulent la croissance de *Clostridium perfringens* et modulent l'expression de sa toxine {theta} dirigée contre l'hôte, soulignant ainsi le potentiel de la modulation du microbiome pour prévenir les infections.
Cette étude démontre que des microbiotes intestinaux humains personnalisés peuvent sélectionner des souches de *Klebsiella pneumoniae* résistantes aux carbapénèmes via une compétition pour le glycérol, un processus médié par des mutations dans le régulateur GlyR qui confèrent un avantage compétitif conditionnel.
Cette étude démontre qu'un vaccin vivant atténué défectif pour la protéine NS1, développé à partir d'un virus H5N1 d'origine bovine, est sûr et induit une réponse immunitaire protectrice robuste chez la souris contre les souches hautement pathogènes émergentes.
Cet article décrit la première isolation d'un virus géant infectant des chrysophytes, le ChrysoHV, dont le génome révèle l'acquisition unique d'une rhodopsine de type protéorhodopsine et d'autres gènes bactériens, soutenant l'hypothèse d'un transfert horizontal de gènes entre prédateurs protistes et leurs proies.