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Cette étude démontre que les réponses au stress chez trois pathogènes bactériens humains réduisent la corrélation entre les niveaux d'ARNm et de protéines, révélant ainsi l'importance cruciale des mécanismes de régulation post-transcriptionnelle pour l'adaptation et la survie bactérienne lors de l'infection.
Cette étude analyse la circulation et l'évolution génomique des souches de coronavirus bovin respiratoire (BCoV) aux États-Unis entre 2020 et 2025, révélant une prévalence élevée chez les jeunes veaux, la dominance du génotype GIIb et l'accumulation de substitutions d'acides aminés potentiellement fonctionnelles.
Cette étude démontre l'efficacité d'une approche métagénomique rapide pour surveiller les microbiomes de l'air et des surfaces dans un hôpital britannique, révélant la présence de pathogènes critiques, de gènes de résistance aux antibiotiques et de facteurs de virulence dans des zones à haut risque, ce qui souligne l'importance de ces méthodes pour prévenir les infections nosocomiales.
Cette étude caractérise l'adaptation protéomique globale de *Pseudogymnoascus destructans* sous stress cuivrique, en identifiant des changements significatifs dans l'acquisition du cuivre, la gestion du stress oxydatif et le métabolisme mitochondrial, tout en validant des anticorps pour détecter ces réponses par Western blot.
Cette étude démontre que la dissociation entre l'abondance et l'activité des bactéries sulfuriques dans les lacs méromictiques est régie par le type d'infection virale, où les bactéries pourpres sont associées à des virus tempérés tandis que les bactéries vertes subissent des infections lytiques.
Cette étude rapporte la première isolation de *Candida auris* en Antarctique, révélant des phénotypes adaptés au froid et une affinité pour le nylon, tout en démontrant que le phénotype « mutateur » de cette espèce favorise son évolution rapide, l'émergence de multiples clades génétiques et le développement de résistances aux antifongiques.
Cette étude démontre que le locus scs chez *Stenotrophomonas maltophilia* agit comme un déterminant contextuel de l'adhésion et de la virulence, dont l'impact fonctionnel se révèle principalement lorsqu'il est combiné à d'autres systèmes pilaires ou flagellaires dans des environnements pertinents pour l'infection.
Cette étude révèle que le microbiome du phoronide *Phoronopsis harmeri* et de son tube, distincts et moins diversifiés que ceux des sédiments environnants, est dominé par des bactéries impliquées dans le cycle du soufre, suggérant un rôle potentiel de ces communautés dans la défense chimique de l'hôte et les processus biogéochimiques marins.
Cette étude présente une ressource génomique inédite comprenant des génomes bactériens et viraux assemblés à partir de métagénomiques de la zostère marine (*Zostera marina*), révélant un rôle potentiel des phages dans le cycle du carbone et offrant une base pour explorer les interactions bactéries-virus dans les écosystèmes d'herbiers marins.
Cette étude présente le génome hautement complet et streamliné de *Colletotrichum* sp. CLE4, un champignon associé à la zostère marine, révélant des adaptations évolutives spécifiques à son environnement marin et suggérant un mode de vie hémibiotrophe.
Cette étude présente la récupération de cinq génomes assemblés à partir de métagénomes (MAGs) d'eucaryotes, dont un champignon chytride novel de l'ordre des Lobulomycetales, à partir de feuilles de l'herbe de mer *Zostera marina*, révélant ainsi de nouvelles lignées génomiques et des gènes potentiels liés aux interactions symbiotiques dans cet écosystème marin.
Cette étude démontre que la kinase histidine PdtaS de *Mycobacterium tuberculosis* est inhibée par le cuivre et le monoxyde d'azote via la suppression de sa dimérisation, révélant un mécanisme de détection de signaux chimiques diversifiés par régulation de l'oligomérisation plutôt que par activation directe.
Cette étude utilise une approche intégrative combinant la bioinformatique et l'apprentissage automatique pour identifier des îlots de pathogénicité chez *Fusobacterium nucleatum* et formuler l'hypothèse d'un mécanisme reliant l'acquisition du fer à la promotion du cancer via le stress oxydatif et la voie Hippo.
Cette étude démontre que les protéines de liaison aux substrats de la sous-famille PBP2 constituent le principal système de reconnaissance des sidérophores chez les bactéries Gram-positives, révélant des mécanismes de régulation transcriptionnelle coordonnée distincts de ceux observés chez les bactéries Gram-négatives.
Cette étude identifie la kinase NEK4 de Plasmodium berghei comme un régulateur clé qui, en s'accumulant au centre organisateur des microtubules peu après la fécondation, couple le début de la méiose à la morphogenèse du zygote en contrôlant la duplication du MTOC, la formation des microtubules et la régulation transcriptionnelle et phosphoprotéique nécessaire au développement du parasite.
Cette étude propose une pipeline computationnelle basée sur l'analyse des dérivées temporelles et du clustering non supervisé pour quantifier les effets d'inoculum et les dynamiques transitoires de *Pseudomonas aeruginosa* sous antibiotiques, permettant ainsi de dépasser les métriques de sensibilité traditionnelles comme la CMI.
Cette étude, la plus vaste à ce jour sur les communautés microbiennes des olives de table, révèle que le mode de préparation (traitement alcalin ou fermentation naturelle) est le facteur structurant principal, masquant les signatures spécifiques aux variétés et soulignant le potentiel de développement de cultures starters personnalisées.
Cette étude identifie et valide des peptides antimicrobiens dérivés du microbiote intestinal humain, notamment amp21 et amp6, qui perturbent efficacement les biofilms de *Pseudomonas aeruginosa* en ciblant spécifiquement leurs protéines lectines LecA et LecB, tout en démontrant une faible toxicité et une efficacité accrue via des peptides ultracourts dérivés.
Cette étude de la cohorte Lifelines NEXT caractérise l'origine, la dynamique et les facteurs influençant le virome intestinal chez les mères et leurs nourrissons, révélant notamment que la diversité virale accrue est associée aux allergies alimentaires et que la persistance virale à long terme est favorisée par des mécanismes génétiques spécifiques.
Cet article critique la conclusion de Hariharan et al. selon laquelle les particules interférentes thérapeutiques (TIP) seraient inefficaces, en démontrant que leurs données observationnelles post-hoc ne constituent pas un test valide de l'efficacité thérapeutique, que les mesures de R0 présentées sont incohérentes avec la dynamique virale, et que des mécanismes alternatifs suffisent à expliquer les observations.