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Cette étude présente la première enquête systématique des virus dans les fumerolles géothermiques d'Hawaï, révélant une diversité virale inédite avec deux nouveaux ordres de Caudoviricetes, une dominance de Microviridae et des gènes métaboliques suggérant une adaptation virale aux conditions extrêmes.
Cette étude démontre que l'expression aberrante de provirus HIV-1 défectueux, via un promoteur intragénique de l'enveloppe, déclenche une réponse inflammatoire chronique chez les patients infectés en activant la voie de détection immunitaire MDA5 dans les cellules myéloïdes.
Cette étude révèle que le système de détection du quorum *agr* chez *Staphylococcus aureus* régule la biogenèse des vésicules extracellulaires en réponse à la disponibilité des nutriments, établissant un lien entre l'état métabolique bactérien et la production de vésicules.
Cette étude révèle que la bactérie environnementale Massilia sp. sécrète l'intermédiaire de biosynthèse de la leucine 4MOP, qui favorise la croissance de Leptospira interrogans en fournissant de l'acétyl-CoA, offrant ainsi un nouvel éclairage sur les interactions métaboliques clés pour la persistance environnementale de ce pathogène.
Cette étude exploratoire révèle que la croissance invasive de la souche de levure vinicole AWRI 796 est principalement déterminée par des facteurs génétiques et environnementaux, le sulfure de sodium ayant un effet facilitateur sous conditions de limitation azotée, bien que cette réponse soit modulée par les conditions de pré-culture et le moment du lavage des plaques.
Cette étude de métagénomique démontre que la cohabitation entre chiens et propriétaires en Chine favorise un transfert horizontal de gènes, conduisant à une convergence fonctionnelle et à un enrichissement des gènes de résistance aux antibiotiques dans le microbiome oral humain.
Cette étude démontre que l'exposition chronique à des concentrations non létales de *Vibrio coralliilyticus* permet de « vacciner » les coraux en conditionnant leur microbiome et en modulant leur expression génique, renforçant ainsi leur résistance au blanchissement induit par la chaleur et le stress pathogène.
Cette étude identifie une nouvelle protéine de liaison aux porphyrines (FqPBP) chez *Flavobacterium quisquiliarum* capable de perturber indépendamment les biofilms de *Pseudomonas aeruginosa* en séquestrant les porphyrines, offrant ainsi une nouvelle stratégie thérapeutique ciblant l'homéostasie du fer.
Cette étude démontre que l'acide D-gluconique, un dérivé oxydé du glucose accumulé lors de l'inflammation intestinale, constitue une source nutritionnelle clé permettant à Salmonella Typhimurium de proliférer et de persister dans l'intestin, tant au cours des infections aiguës que chroniques.
Cette étude présente la découverte de GZNL-2016, un nouvel inhibiteur de la protéase papaine-like du SARS-CoV-2 à base de quinoline, conçu grâce à une stratégie d'intelligence artificielle et démontrant une forte efficacité antivirale in vivo ainsi qu'une résistance aux variants mutés.
En construisant une base de données pangenome personnalisée pour le microbiome vaginal, cette étude révèle que des gènes accessoires spécifiques de *Lactobacillus crispatus*, tels qu'un système toxine-antitoxine et des gènes dérivés de phages, sont associés à la dysplasie cervicale, soulignant ainsi l'importance de la variation intraspécifique dans la santé reproductive.
Les virus grippaux H5N1 bovins ont acquis des mutations spécifiques de l'hémagglutinine (D104G et V147M) leur permettant de se lier efficacement aux récepteurs NeuGc abondants dans les tissus bovins, ce qui favorise leur adaptation aux vaches tout en limitant pour l'instant le risque zoonotique immédiat.
Cette étude caractérise de nouvelles séquences d'ACE2 chez des chauves-souris *Rhinolophus* africaines et identifie les déterminants moléculaires, notamment aux positions 31 et 41, qui régulent l'entrée des sarbecovirus afro-eurasien en révélant des différences de susceptibilité entre les espèces *R. simulator* et *R. blasii*.
Cette étude démontre que le complexe méthyltransférase spécifique au méthanol (MTA) chez *Methanosarcina acetivorans* est responsable d'effets isotopiques cinétiques carbone et hydrogène exceptionnellement élevés, qui expliquent les signatures isotopiques uniques du méthane produit à partir de méthanol et restent déterminants même à de faibles concentrations environnementales.
En combinant des analyses de mutagénèse à haut débit et une modélisation prédictive, cette étude établit une carte fonctionnelle des éléments cis-régulateurs du VIH qui révèle une vaste variabilité transcriptionnelle au sein et entre les clades, les isolats et les individus, pilotée par des configurations spécifiques de facteurs de transcription.
Cette étude génomique épidémiologique menée à Bristol démontre l'existence de liens phylogénétiques étroits entre les *E. coli* antibiotico-résistants présents dans la viande crue et les aliments pour chiens crus, et ceux causant des infections humaines, justifiant un renforcement des normes microbiologiques pour les aliments pour animaux crus et une meilleure communication des risques.
Cette étude révèle qu'un codon stop opal conservé dans les alphavirus agit comme un mécanisme de défense multipotent en facilitant l'évasion des réponses immunitaires innées, notamment via l'interférence par ARN, chez les hôtes vertébrés et insectes.
Cette étude révèle, grâce au criblage profond de mutations, que l'épistasie spécifique à la souche et la robustesse structurale façonnent les paysages de fitness de la protéine Vif du VIH-1, permettant une adaptation initiale contre l'APOBEC3G tout en imposant des contraintes évolutives à long terme.
Cette étude révèle que la tache bactérienne des champignons de Paris est causée par un complexe multispecies de Pseudomonas, incluant l'espèce émergente P. azotoformans, ce qui remet en question le paradigme d'un pathogène unique et souligne la nécessité de stratégies de diagnostic génomiques plus larges pour assurer la durabilité de la production.
Cette étude évalue le ver du tabac (*Manduca sexta*) comme un modèle sensible et novateur pour analyser la virulence de *Pseudomonas aeruginosa*, démontrant que les produits sécrétés par la bactérie sont essentiels à la pathogenèse et que ce hôte offre une meilleure résolution des dynamiques d'infection que la fausse teigne de la cire.