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🧬 biology

Basal expression predicts context-specific drug responses only where they are reproducible: a leakage-safe 47-line LOCO benchmark on Tahoe-100M

Ce benchmark pré-enregistré et protégé contre les fuites démontre que la capacité de l'expression du transcriptome basal à prédire les réponses médicamenteuses contextuelles est fondamentalement limitée par la faible reproductibilité du signal cible, la prédiction significative n'émergeant que pour un petit sous-ensemble de médicaments où la réponse résiduelle est suffisamment fiable.

Huazhang Shen2026-09-01
🧬 biology

HADIA-KB: Evidence-Preserving Digital Knowledge Infrastructure for Jharkhand’s Traditional Rice Beer

HADIA-KB est une infrastructure de connaissances numériques préservant les preuves qui agrège et cartographie les données scientifiques et culturelles fragmentées sur la bière de riz traditionnelle du Jharkhand en un graphe reproductible et sourcé, mettant explicitement en évidence les lacunes de documentation et les variations régionales plutôt que de consolider diverses traditions en un récit unique.

Mohammad Amir Khusru Amir2026-09-01✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

GRP: A Representation-Aware Effective Geometry of Protein State Space

Cet article introduit GRP, un cadre inspiré de la relativité générale qui modélise les espaces d'états protéiques comme des variétés géométriques sensibles aux coordonnées afin d'identifier des invariants stables reliant les représentations de l'IA aux contraintes biologiques, démontrant qu'un petit nombre de modes dominants capture la majeure partie de la variance conformationnelle et que les chemins biologiques structurés présentent des propriétés de transport distinctes par rapport aux modèles nuls.

Chuanyang Liu2026-09-01
🧬 biology

Chromosome-level genome of the white jade snail reveals conserved genomic architecture and functional divergence from wild Achatina fulica

Cette étude présente le premier assemblage de génome au niveau chromosomique de l'escargot jade blanc d'élevage, révélant sa relation phylogénétique étroite et sa synténie conservée avec l'escargot géant d'Afrique sauvage (*Achatina fulica*) tout en mettant en évidence des divergences fonctionnelles dans les voies métaboliques et de réponse au stress associées à la domestication.

Hai Liu2026-09-01
🧬 biology

Illiosentis furcatus (Acanthocephala: Leptorhynchoididae): Morphological study, molecular characterization, and phylogenetic analysis justify reinstatement of Tegorhynchus cetratus

Cette étude combine l'examen morphologique et l'analyse phylogénétique moléculaire pour démontrer qu'*Illiosentis cetratus* est génétiquement distincte des autres espèces d'*Illiosentis*, justifiant ainsi le rétablissement du genre *Tegorhynchus* pour cette espèce.

Kaitlynn M. Stewart, Kristina M. Hill-Spanik, Eric J. McElroy, Isaure de Buron2026-09-01
🧬 biology

Dopaminergic Degeneration and GBA Mutation Status Predict Prior–Sensory Arbitration Disruption in Parkinson's Disease: A Multimodal Computational Framework

Cette étude computationnelle multimodale de l'ensemble de données PPMI suggère que les hallucinations de la maladie de Parkinson découlent d'une perturbation progressive de l'arbitrage entre les preuves sensorielles et les attentes préalables, caractérisée par une sensibilité sensorielle réduite et des fausses alarmes induites par le bruit qui sont fortement prédites par la dégénérescence dopaminergique et le statut de mutation du gène GBA, malgré des limites significatives dans l'estimation précise du paramètre d'arbitrage central à partir de données comportementales de visite unique.

Khanh-Dung Tran2026-09-01
🧬 biology

Intracavity Nuclear Elastography

Cet article introduit l'élastographie nucléaire intracavitaire, une plateforme de détection non linéaire qui intègre des cellules vivantes dans un laser à microcavité pour amplifier les infimes déformations nucléaires induites par les ultrasons via la dynamique de bifurcation, atteignant une sensibilité plus de 120 fois supérieure aux méthodes conventionnelles pour la cartographie quantitative et non invasive de la mécanique nucléaire et le phénotypage cellulaire multidimensionnel.

Chaoyang Gong, Zhonghao Li, Zhihan Cai, Guifeng Li, Guoquan Wang, Yue Zhao, Xi Yang, Yuan Gong, Hong Zhang, Yang Luo, Ta (…)2026-09-01
🧬 biology

Machine Learning–Based Classification of Cancer Using Promoter-Associated 5-Hydroxymethylcytosine Signatures in Cell-Free DNA

Cette étude démontre qu'un cadre d'apprentissage automatique utilisant des signatures de 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC) associées aux promoteurs à partir de l'ADN libre de cellules peut distinguer efficacement et avec précision les échantillons cancéreux des échantillons sains, offrant ainsi une stratégie non invasive prometteuse pour la détection précoce du cancer et l'oncologie de précision.

Tisha Sehrawat2026-09-01
🧬 biology

An epigenetically stabilized regulatory state underlies stable glioblastoma invasion

Cette étude démontre que l'invasion du glioblastome peut être maintenue en tant qu'état de régulation stable et intrinsèque à la cellule, piloté par un remodelage épigénétique coordonné et des réseaux de facteurs de transcription (spécifiquement ATF4 et MYC/MAX), ce qui stratifie de manière significative la survie des patients et offre des cibles thérapeutiques potentielles.

Ann-Christin Hau, Tanja Buhlmann, Sophie Schreiner, Camille Cialini, Vera Laub, Petr Nazarov, Arnaud Muller, Kimia Kafi (…)2026-09-01
🧬 biology

Gut Microbiome Composition of Wild and Captive Black Capuchin Monkeys (Sapajus nigritus)

Cette étude démontre que la composition du microbiote intestinal et le potentiel fonctionnel prédit des capucins noirs sauvages et captifs diffèrent significativement, les individus en captivité présentant une richesse microbienne plus grande et des profils taxonomiques et métaboliques distincts, probablement induits par des différences de régime alimentaire, d'environnement et de conditions d'élevage.

Tiela Trapp Grassotti, Cecile Jacry, Manuela Gamarra Cassol, Michele Bertoni Mann, Aline Alves Scarpellini Campos, Jever (…)2026-09-01