🧬 biology

Provenance-aware observations of mitochondrial organization

Cet article introduit l'« armosis », un cadre quantitatif mesurant la réduction progressive des entités biologiques théoriquement possibles à travers les niveaux organisationnels, et démontre son application à l'aide d'un graphe de connaissances sensible à la provenance des génomes mitochondriaux humains pour révéler l'augmentation des contraintes, des codons jusqu'à la chaîne de transport d'électrons complète.

David A Stumpf2026-07-29
🧬 biology

ResNet50 Features for Colon Histopathology: What Transfer Learning Actually Delivers

Cet article évalue l'efficacité des caractéristiques de ResNet50 gelées pour l'histopathologie du côlon, concluant que si l'apprentissage par transfert permet d'obtenir une précision de détection quasi parfaite et un regroupement biologiquement plausible, il n'élimine pas le besoin critique de normalisation de la coloration, de validation externe et d'explicabilité pour remédier aux risques potentiels de fuite de données et de biais.

Samjhana Shakya2026-07-29
🧬 biology

Epigenetic Age Estimates in Blood Shift by Decades with Cell Population: A Within-Donor Variance Partition Across Two Platforms and Two Study Designs

Cette étude démontre que les estimations de l'âge épigénétique dans le sang varient de plusieurs décennies selon la population cellulaire spécifique analysée, une variation suffisamment importante pour dominer les signaux biologiques et fausser les comparaisons entre études, établissant ainsi la composition cellulaire comme une variable méthodologique critique qui nécessite un signalement normalisé.

Frederic Scheer2026-07-29
🧬 biology

AI Driven Analysis of Canola Rhizosphere Microbiome: Diversity, Core Microbiome, and Machine Learning Classification

Cette étude analyse le microbiome de la rhizosphère du canola en utilisant le séquençage de l'ARNr 16S de 8 701 échantillons pour caractériser la diversité et identifier un microbiome central, afin de développer un classifieur de type Forêt Aléatoire hautement précis basé sur les caractéristiques des ASV pour prédire l'état de santé de la plante.

Zariab Ahmed, Amina Shoukat Amina Shoukat, Saqib Hussain Hadri, Abdullah Tariq Abdullah Tariq2026-07-29
🧬 biology

Reorganization of lateral orbitofrontal neuronal ensembles underlies pain-related impairment of delayed gratification

Cette étude démontre que la douleur inflammatoire chronique altère la gratification différée chez les rats en réorganisant les ensembles fonctionnels des neurones du cortex orbitofrontal latéral, plutôt qu'en réduisant simplement leur activité globale, perturbant ainsi le codage de population des associations temps-récompense.

Mariana Cerqueira-Nunes, Clara Monteiro, Vasco Galhardo, Helder Cardoso-Cruz2026-07-29
🧬 biology

Identification and analysis of immune-related risk genes associated with sepsis through RNA sequencing and single-cell localization techniques

Cette étude identifie et valide S100A8, S100A9 et S100A12 comme des gènes de risque liés à l'immunité significativement surrégulés chez les patients atteints de sepsis, démontrant leur expression prédominante dans les macrophages et leur implication potentielle dans la voie de signalisation PI3K-Akt grâce à l'intégration du séquençage de l'ARN, de la bioinformatique, de la méta-analyse et de la vérification expérimentale.

Hongying Cao, Wei Chen, Peng Tang, Yingchun Hu, Youyu Lan2026-07-29
🧬 biology

Quantum Valence Constants and Structural Stability in DNA: The 10-5-6-5 Numerical Isomorphism as a Biological Ledger

Cet article propose un cadre théorique appelé « Biothéologie Quantitative » qui affirme qu'une séquence numérique spécifique (10-5-6-5), dérivée de constantes de liaison de valence et d'une analyse d'orbitales quantiques, représente une constante mathématique divine essentielle à la stabilité thermodynamique et à l'intégrité structurelle de l'ADN.

Carlos Alberto Zuniga Gonzalez2026-07-29
🧬 biology

Phylogenomic and multi-omics analysis of Agarivorans sp. D1326 uncovers an agarolytic pathway involving rare GH118 β‑agarase

Cette étude caractérise la bactérie marine *Agarivorans* sp. D1326 par des analyses phylogénomiques et multi-omiques afin d'élucider un réseau agarolytique complet piloté par une rare β-agarase GH118 et des voies enzymatiques extracellulaires et intracellulaires coordonnées pour une dégradation efficace de l'agar.

Tao Li, Cong Liu, Chengwei Wu, Boyu Zhang, Ziwei Wang, Yueyue Zhao, Wenbin Gu, Zilin Liu, Fanling Meng, Jingjing Shanggu (…)2026-07-29
🧬 biology

Bloominess defines an ecological axis of sporadic dominance that shapes antimicrobial resistance dynamics in the microbiome

Cette étude introduit la « bloominess », une nouvelle métrique quantifiant la dominance sporadique dans les microbiomes, pour démontrer que le comportement écologique des taxons — spécifiquement leur tendance à des expansions extrêmes occasionnelles — est un facteur critique façonnant la dynamique de la résistance aux antimicrobiens au-delà du simple contenu génique.

Melanie Hay, Bhoomika Joshi, Khushbu Rana, Ankit Hinsu, Rameshchandra Pandit, Kelyn Seow, Androniki Psifidi, Richard Sta (…)2026-07-28