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🧬 biology

Proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens reveals candidate intraoperative diagnostic biomarkers for Hirschsprung disease

Cette étude a utilisé le profilage protéomique de tissus fixés en paraffine et inclus en blocs pour identifier quatre nouveaux biomarqueurs candidats (CTNNA2, EPDR1, NACAD et NCAM2) qui sont spécifiquement exprimés dans les régions ganglionnaires, offrant ainsi des outils prometteurs pour le diagnostic peropératoire de la maladie de Hirschsprung.

Shigemitsu Kojima, Ayako Yamazaki, Masahito Yoshihara, Ryo Konno, Kenichiro Konishi, Shinya Takazawa, Akira Nishi, Jun F (…)2026-08-31
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Somatic PIK3CA Mutation Status and Gene Expression in Cervical Cancer: A TCGA-CESC Reanalysis

Cette réanalyse de TCGA-CESC révèle que les mutations somatiques de PIK3CA dans le cancer du col de l'utérus sont associées à une signature transcriptionnelle large, enrichie pour les voies de la matrice extracellulaire et de l'adhésion focale plutôt que pour la signalisation canonique PI3K-AKT, tout en mettant également en évidence un enrichissement non résolu dans les processus ciliaires et flagellaires.

Emmanuel Frimpong2026-08-31
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Context-aware LLM extraction and controlled-vocabulary normalization of GEO transcriptomic sample metadata

Cet article présente un pipeline de grand modèle de langage déployable localement qui extrait et normalise les métadonnées transcriptomiques GEO non structurées en étiquettes à vocabulaire contrôlé pour le tissu, la condition et le traitement, atteignant une grande précision et surpassant de manière significative les méthodes de correspondance déterministes.

Mateusz Szczepaniak, Jonathan Wren2026-08-31
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Associations between bacteriome and chemical pollutants in indoor dust from Czech households

Cette étude analyse la poussière intérieure de 88 foyers tchèques pour révéler des associations significatives entre des genres bactériens spécifiques, tels que *Methylobacterium-Methylorubrum* et *Sphingomonas*, et divers polluants chimiques comme les HAP et les PBDE, suggérant que les interactions entre les contaminants biologiques et chimiques peuvent modifier les risques pour la santé en intérieur malgré la nécessité de recherches mécanistiques supplémentaires pour établir la causalité.

Klvanova Eva, Jan Böhm, Paula Marcinekova, Lisa Melymuk, Petr Kukacka, Petr Senk, Jakub Martinik, Petra Pribylova, Simon (…)2026-08-31
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Comprehensive Comparative Evaluation and Consensus Strategy for CRISPR/Cas9 gRNA Design Targeting the TaDREB1 Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum)

Cette étude établit une stratégie de consensus robuste pour la conception de l'ARN guide CRISPR/Cas9 chez le blé tendre en comparant cinq outils de prédiction ciblant le gène TaDREB1 afin d'identifier une séquence guide hautement fiable et de mettre en évidence les limites critiques des résultats algorithmiques actuels.

Tarek Osama Mohamed Amin, Ghufran Siddiq2026-08-31
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A Computationally De-Risked CD47 Inhibitor for Glioblastoma

Cette étude présente un pipeline de découverte de médicaments piloté par le calcul qui a identifié et conçu une nouvelle protéine de céphalopode non sécrétée par le fragment Fc, AOA_UR2_F7P_M16C, en tant qu'inhibiteur puissant et déimmunisé de CD47 présentant un haut potentiel pour le traitement du glioblastome tout en évitant la toxicité hématologique et l'immunogénicité des thérapies anticorps précédentes.

Timothy Payton2026-08-31
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Study on the mechanism of type 2 diabetes mellitus on tendon repair based on bioinformatics analysis combined with machine learning models

Cette étude intègre la randomisation mendélienne, la bioinformatique et l'apprentissage automatique pour établir un lien causal entre le diabète de type 2 et l'altération de la réparation tendineuse, identifiant MYL2, MYL3 et TTN comme des gènes pivots clés qui perturbent probablement la cicatrisation par un dysfonctionnement du cytosquelette et des altérations immunitaires médiées par les macrophages.

Shulong Sun, Hua Li, Guanghui Li, Yan Li, Liubing Yang, Yujing Cao, Ji Li2026-08-31
🧬 biology

3D µEFPocket for Multimodal Communications with Brain Organoids

Ce document présente la µEFPocket, une biointerface microfluidique conforme et ultra-mince fabriquée à partir de parylene C qui permet une stimulation chimique et électrique spatiotemporelle simultanée à haute résolution, parallèlement à l'enregistrement optique et électrique dans des organoïdes cérébraux humains, surmontant ainsi les défis de la complexité 3D pour faciliter les essais fonctionnels multimodaux et les études en boucle fermée.

Yihang Wang, Miguel Cuevas, Zhihan Zhang, Gooyoon Chung, Jingze Zhang, Yilan Yin, Qianzhi Luo, Will Lipman, Josh Henders (…)2026-08-31
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Exploration of Evolutionary Dynamics and Genomic Architecture in Acinetobacter baumannii

Cette étude intègre des analyses de pan-génome, phylogénomiques et compositionnelles pour révéler que la lignée ST2 d'*Acinetobacter baumannii*, dominante à l'échelle mondiale, repose sur une architecture de génome ouvert où les gènes de résistance aux antimicrobiens acquis par transfert horizontal sont maintenus de manière stable au sein d'îlots génomiques, soulignant la nécessité critique d'une surveillance génomique complète à travers les chromosomes, les plasmides et les phages pour lutter contre la résistance aux carbapénèmes.

Rhythm Sharma, Dinesh Lakhanpal2026-08-31