🧬 biology

Predicting Microbiologically Influenced Corrosion Risk from Quorum Sensing Biofilm Community Features: A Random Forest-SHAP Approach

Cette étude introduit un cadre d'apprentissage automatique Random Forest-SHAP qui prédit avec succès le risque de corrosion microbiologiquement influencée en intégrant de nouvelles caractéristiques de la communauté de biofilm liées au quorum sensing aux paramètres environnementaux et microbiens traditionnels, atteignant un score F1 de 0,762 et démontrant la valeur prédictive des signaux de communication bactérienne dans l'évaluation de la corrosion.

Bipul Bhattarai, Naina Maharajan, Sulav Dahal2026-07-01
🧬 biology

AI-Based Pipeline for Vascularization Detection in Histological Images; low-cost solution Using Moderate Computing Resources

Cet article présente un pipeline d'IA à faible coût et convivial qui combine un traitement d'image simple avec une méthode de recherche de similitude interactive et auto-apprenante pour permettre aux pathologistes de détecter rapidement et précisément la vascularisation dans les images histologiques en utilisant des ressources informatiques modestes et un étiquetage manuel minimal.

Jan Žídek, Bretislav Lipový, Veronika Pavliňáková, Martin Knoz, Jakub Holoubek, David Izsák, Vladimir Váňa, Jan Herudek (…)2026-07-01
🧬 biology

Ecological Inference Is Structured Empirical Risk Minimization: Generalization Across Space, Nested Units, and Niche Support

Cet article soutient que l'échec fréquent des modèles géographiques à se généraliser d'un site à l'autre provient d'une inadéquation fondamentale de l'estimand dans les données d'enquête imbriquées, démontrant que l'inférence écologique est structurellement équivalente à la minimisation du risque empirique sous généralisation de domaine et exigeant une validation par échantillon de test au niveau de la population plutôt qu'une validation croisée standard au niveau individuel pour assurer un transfert spatial fiable.

R. Craig Stillwell2026-07-01
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BioGPT-ClinVar: Parameter-Efficient Fine-Tuning of a Biomedical LLM for Genomic Variant Interpretation

Cette étude présente BioGPT-ClinVar, un cadre de réglage fin efficace en paramètres utilisant l'adaptation de bas rang (LoRA) pour adapter le modèle BioGPT de 150 millions de paramètres à l'interprétation des variants génomiques, démontrant une convergence efficace sur un ensemble de données ClinVar organisé tout en fournissant un pipeline open-source et reproductible pour de futures applications cliniques et de surveillance.

Sepideh Moafi2026-07-01
🧬 biology

Trained quantum Kolmogorov--Arnold networks can dequantize, and a discrete-logarithm encoding need not: a measurement-based map of where quantum advantage can live

Cet article démontre que, bien que les réseaux de Kolmogorov–Arnold quantiques entraînés soient souvent simulables classiquement via des réseaux de tenseurs à faible dimension de liaison, un véritable avantage quantique peut être préservé et rendu entraînable en employant des encodages de logarithme discret qui intègrent une dureté de type théorie des nombres sans succomber aux plateaux stériles.

Hikaru Wakaura2026-07-01
🧬 biology

Xkr regulates phosphatidylserine transport via ER-PM contact sites to promote apoptotic cell clearance

Cette étude révèle que la scramblase lipidique Xkr de Drosophila favorise l'élimination des cellules apoptotiques en interagissant avec dORP9 au niveau des sites de contact entre le RE et la membrane plasmique pour faciliter le transport non vésiculaire de la phosphatidylsérine vers la surface cellulaire, servant ainsi de voie alternative indépendante des caspases pour l'exposition du signal « eat me ».

Qian Zheng, Xinyu Ma, Fuqiao Liu, Tong Xiao, Lei Yuan, Qing Yan, Hui Wang, Hui Xiao2026-07-01
🧬 biology

Analysis of Human Physiology in Simulated Lunar and Martian Hypogravity With and Without Virtual Reality

Cette étude démontre que l'hypogravité simulée réduit la demande cardiovasculaire lors de la marche tandis que la réalité virtuelle module les réponses physiologiques en retardant l'augmentation de la fréquence cardiaque, confirmant ainsi la sécurité et l'efficacité de la combinaison des tapis de course AlterG avec la VR pour préparer les équipages aux futures missions lunaires et martiennes.

Rosirene Pantaleão Gessinger, Juliana Silva Herbert, João de Carvalho Castro, Joana Figueira Godinho, Adrian Alberto Fer (…)2026-07-01
🧬 biology

Intrasexual competition modulates heatwave effects on male reproduction in Drosophila prolongata

Contrairement aux attentes, cette étude révèle qu'une compétition intrasexuelle intense atténue partiellement l'impact négatif des vagues de chaleur sur la production reproductive mâle chez *Drosophila prolongata*, probablement par le biais d'une augmentation compensatoire de l'investissement reproductif, soulignant le rôle critique des stress environnementaux interactifs dans le façonnement des réponses de la faune sauvage au changement climatique.

Shivanshi Gupta, Gayatri Raina, Marta Cortés Mediavilla, Tom Ratz2026-07-01
🧬 biology

Tracing the Evolution and Circulation of Measles Virus in Africa

Cette étude utilise l'analyse phylodynamique de 336 souches du virus de la rougeole pour révéler que la transmission en Afrique est pilotée par la mobilité humaine et des introductions fréquentes en provenance d'Asie, caractérisée par une circulation cryptique prolongée qui souligne le besoin urgent d'une surveillance et d'une vaccination accrues pour prévenir la propagation mondiale.

Nidia Trovao, Sana Tamim, Herve Kadjo, Samiah Kanwar, Anna Salafsky, Olayinka Okoh, Marius Adagba, Yakoura Ouattara, Ven (…)2026-07-01