🧬 Category

q-bio

4127 articles

🧬 biology

Long-read RNA-seq resolves isoform-level and context-specific regulatory architecture of complex traits in cattle

Cette étude exploite des données de séquençage d'ARN à lectures longues à l'échelle de la population et des données multi-omiques provenant de 432 vaches laitières pour construire un atlas transcriptionnel bovin complet, révélant des milliers de nouveaux isoformes et de variants de régulation spécifiques au contexte qui améliorent significativement la résolution de la génétique des traits complexes et comblent le fossé de la « régulation manquante » laissé par les méthodes traditionnelles de lectures courtes.

Lingzhao Fang, Weijie Zheng, Qi Zhang, Jinfeng He, Xiaoning Zhu, Mian Gong, Houcheng Li, Lin Liu, Jianbin Li, Zhu Ma, Bo (…)2026-08-31
🧬 biology

Valorization of Shrimp Shell Waste: Crude Protease-Assisted Astaxanthin Extraction Using Bacillus cereus XT-1 and Functional Gene Analysis

Cette étude démontre que *Bacillus cereus* XT-1, qui régule à la hausse le gène *nprC* pour produire une protéase neutre clé de 35 kDa, sert d'agent biologique efficace et écologique pour l'extraction d'astaxanthine à haut rendement et stable à partir de déchets de carapaces de crevettes avec une activité antioxydante accrue.

Xiaoxi Zeng, Lan Yu, Cheng Zhang, Keting Lei, Xuan Li, Yongjian Shao, Lingzhi Chen, Yang Fang, Jie Liu, Liang Ma2026-08-30
🧬 biology

Symbiodiniaceae shifts in the corals Acropora cf. solitaryensis and A. aff. divaricata at the climate-driven poleward margin

Cette étude démontre que, bien que les populations en expansion d' *Acropora cf. solitaryensis* et d' *A. aff. divaricata* à leur marge polaire induite par le climat maintiennent une diversité génétique de l'hôte et une connectivité élevées, elles présentent des assemblages de Symbiodiniaceae distincts caractérisés par un passage de symbiotes de la radiation C3 à la radiation C1, probablement piloté par des températures d'eau de mer plus basses.

Nina Yasuda, Akifumi Shimura, Masumi Kamata, Hiroki Taninaka, Kenji Takata, Takashi Nakamura, Akira Iguchi, Takehisa Yam (…)2026-08-30
🧬 biology

Sexual evolution in plants: genetic network co-option and reproductive innovation

Cette revue propose un cadre évolutif intégratif démontrant comment la reproduction sexuée des plantes, originaire des algues vertes ancestrales il y a plus d'un milliard d'années, s'est diversifiée à travers les lignées terrestres par la cooptation, la duplication et le recâblage itératifs de modules génétiques conservés tels que les facteurs de transcription MADS-box et les systèmes hormonaux.

Vladimir Brukhin2026-08-30
🧬 biology

A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data

Cet article propose un cadre de sélection de caractéristiques en deux étapes qui combine un filtrage rigide basé sur la variance avec XGBoost afin de réduire 61 millions de SNP à un sous-ensemble de taille gérable sur le plan computationnel, permettant ainsi une prédiction efficace de l'origine géographique par apprentissage automatique sur des ensembles de données génomiques à grande échelle sans exigences de ressources prohibitives.

Jinhyun Kim, Seungjun Lee, Daewon Lee, Seo Woo Song, Cheolheon Park, Huiran Yeom2026-08-30
🧬 biology

Cognitive appraisal and visual discomfort in severe trypophobia in a cognitive computational case study

Cette étude de cas cognitivo-computationnelle démontre que la trypophobie sévère ne provient pas uniquement de propriétés visuelles de bas niveau, mais d'un processus intégratif où les déclencheurs visuels initiaux sont amplifiés par des évaluations cognitives descendantes liées aux menaces de maladie et de contamination.

Pouya Mokari Amjad, Ramina Bakhtiari Haftlang2026-08-29
🧬 biology

Type IV Collagen-Enriched 3D Extracellular Matrix Niche Enhances Proliferation and Preserves Phenotype in Primary Mouse Hepatocytes

Cette étude démontre qu'une niche de matrice extracellulaire 3D enrichie en collagène de type IV préserve efficacement le phénotype mature et la prolifération stable des hépatocytes primaires de souris sur de longues périodes de culture, tout en empêchant la métaplasie biliaire typiquement induite par des substrats conventionnels comme le Matrigel.

Yusuke Murasawa2026-08-29
🧬 biology

Preclinical evaluation of a novel multiplex ddPCR assay for detecting tetracycline resistance and differentiating Ureaplasma species

Cette étude a développé et validé un essai ddPCR multiplex hautement sensible, spécifique et reproductible, capable de quantifier simultanément les gènes de résistance à la tétracycline (tetM et int-Tn) et de différencier Ureaplasma urealyticum de Ureaplasma parvum afin de guider les stratégies de traitement clinique optimales.

Lihong Zhao, Yuanyuan Jiang, Yulong Zong, Ruiying Li, Hui Zhang, Jin Wang, Zhe Li2026-08-29
🧬 biology

Locus-resolved reconstruction of the pig UGT family reveals an isoform-collapse artifact in frozen ESM-2 retrieval

Cette étude reconstruit la famille de gènes UGT du porc pour révéler que, bien que les plongements ESM-2 gelés améliorent le classement de certaines isoformes protéiques, ils ne surpassent pas les méthodes traditionnelles de recherche de séquences pour la récupération de gènes supplémentaires une fois l'évaluation standardisée au niveau du locus, exposant ainsi un artefact de résolution d'isoforme dans les évaluations précédentes.

Xiaotong Zhao¹, Hua Chang², Zhuoyu Zhao¹, Xun Xiang¹2026-08-29
🧬 biology

Balancing Protein Expression and Minicell Yield in E. coliNissle 1917 via RBS Engineering

Cette étude démontre que l'ingénierie de la force du site de liaison au ribosome (RBS) chez les minicellules d'*E. coli* Nissle 1917 permet d'équilibrer précisément les niveaux d'expression des protéines recombinantes et le rendement en minicellules, révélant que si une expression plus élevée réduit la production en raison de la charge métabolique, les minicellules offrent un environnement supérieur pour maintenir la solubilité des protéines.

Yao Ruan, Honglei Xie, Yan Niu, Tian Liu, Xi Shen, Mingxia Zhang, Shengping Lei, Jun Yu2026-08-29