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🧬 biology

Fungal diversity in forest's soil: Moderate-term post-thinning effect of a Mediterranean mature Pinus halepensis forest.

Une étude d'une forêt de *Pinus halepensis* en Israël révèle que si un éclaircissage modéré réduit légèrement la diversité fongique totale, l'élimination complète des arbres modifie considérablement les caractéristiques du sol et fait passer les communautés fongiques d'espèces symbiotiques associées aux pins à des taxons saprotrophes et pathogènes typiques des zones non forestières.

Segula Masaphy, Noam Levi, Limor Zabari, Ezra Orlofsky2026-06-30
🧬 biology

A multi-omics dataset of the developing zebrafish intestine: longitudinal transcriptomic and microbiome profiles in wild-type and IgZ knockout models

Cette étude présente un ensemble de données multi-omiques intégrant des profils transcriptomiques et microbiens longitudinaux de poissons zèbres de type sauvage et de mutants knockout pour l'IgZ afin d'élucider le rôle développemental de l'IgZ dans la régulation de l'immunité intestinale et de l'homéostasie microbienne.

Raktakamol Pharrat, Xuyang Zhao, Zhengben Wu, Congran Bei, Yongyao Yu2026-06-30
🧬 biology

Optimization of the 5' untranslated region and codon of the mRNA vaccines

Cette étude démontre que l'optimisation systématique de la région 5' non traduite et de l'usage des codons des vaccins à ARNm améliore considérablement les niveaux d'expression et la stabilité des protéines, une stratégie validée par la conception et les tests réussis de vaccins contre la protéine F du virus respiratoire syncytial (VRS).

Qiuji Wang, Xiaorong Peng, Yaqian Zeng, Xindeng Guo, Weineng Meng, Ning Deng2026-06-30
🧬 biology

Integrative single-cell and bulk transcriptomic analysis with Shennong machine learning reveals the landscape of calmodulin associated prognostic genes in breast cancer

Cette étude intègre des analyses transcriptomiques à l'échelle de la cellule unique et globale avec l'apprentissage automatique Shennong pour identifier une signature pronostique de huit gènes liés à la calmoduline dans le cancer du sein, révélant son association avec la dynamique des cellules épithéliales, des voies de signalisation spécifiques et des cibles thérapeutiques potentielles.

Jian Chen, Wenhui Lai, Can Yang2026-06-30
🧬 biology

Transcriptomic insights into gametogenesis and steroidogenic enzyme gene regulation in Australasian snapper (Chrysophrys auratus) gonads during the reproductive cycle

Cette étude présente la première analyse du transcriptome des gonades du vivaneau australasien tout au long de son cycle de reproduction, révélant des profils d'expression génique spécifiques au sexe pour les enzymes stéroïdogènes et les processus de développement, tout en améliorant simultanément l'annotation du génome de l'espèce afin de soutenir la recherche future en aquaculture et en reproduction.

Samuel J. Modern, Matthew J. Wylie, Igor Ruza, Craig Radford, Maren Wellenreuther2026-06-30
🧬 biology

Implication of Aster-mediated transport and endocytosis in intestinal absorption and human bioavailability of fat-soluble vitamins

Cette étude démontre que les voies de transport non vésiculaire médiées par Aster et les voies endocytaires sont critiques pour l'absorption intestinale et la biodisponibilité humaine des vitamines liposolubles D et E, tandis que la vitamine A utilise une voie indépendante d'Aster.

Emmanuelle Reboul, Angélique Berthomé, Donato Vairo, Marine Chotard, Charles Desmarchelier, Mark Zumaraga, Patrick Borel (…)2026-06-30
🧬 biology

Submillimeter postmortem and in vivo diffusion and susceptibility magnetic resonance imaging to characterize cortical micro-and meso-structures

Cette étude démontre que les mesures d'IRM de diffusion et de susceptibilité, à résolution submillimétrique, postmortem et in vivo, présentent une correspondance modérée dans la caractérisation des micro- et méso-structures corticales humaines, fournissant ainsi une référence anatomique complète pour jeter un pont entre l'imagerie postmortem de haute fidélité et les applications de neuroimagerie in vivo.

Yuto Uchida, Hyeong-Geol Shin, Laura Gomez-Isaza, Juan Troncoso, Adnan Bibic, Julianna Gerold, Dongsuk Sung, Yohan Jun (…)2026-06-30
🧬 biology

The influence of Enterocytozoon hepatopenaei infection on lipid and immune pathways in Litopenaeus vannamei

Cette étude utilise des analyses transcriptomiques et métabolomiques intégrées pour révéler que l'infection par *Enterocytozoon hepatopenaei* chez *Litopenaeus vannamei* induit un retard de croissance par la suppression ribosomale et manipule le métabolisme des lipides ainsi que la signalisation immunitaire, potentiellement en détournant les ressources de synthèse des membranes de l'hôte pour la formation des spores.

Xuan Zhang, Boyao Chen, Changkao Mu, Suming Zhou, Dong Qian, Ping Zhuang, Jiong Chen, Rongrong Ma2026-06-30
🧬 biology

Genomic Characterization of a Multidrug-Resistant Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae Strain from a Dog Shelter with Prolonged Co-Amoxiclav Use

Cette étude caractérise une souche de *Klebsiella quasipneumoniae* subsp. *similipneumoniae* multirésistante isolée d'un refuge pour chiens en Malaisie ayant un historique d'utilisation prolongée d'amoxicilline-acide clavulanique, révélant un profil microbien distinct entre les échantillons fécaux et les échantillons de drainage et soulignant des lacunes critiques dans la gestion de l'antibiothérapie dans le contexte de l'approche « One Health ».

Zhen Yun Siew, Winnie Teh, Isaac Seow, Hong Soon Chin, Siew Tung Wong, Kalaiwaney Muniandy, Nur Amalina Binti Zaharudin (…)2026-06-30
🧬 biology

Long-term exposure to fluoride and tebuconazole alters gill, skin and gut microbiomes in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

L'exposition chronique à des concentrations de fluorure et de tébuconazole pertinentes pour l'environnement perturbe la diversité alpha et bêta, les réseaux de cooccurrence et la composition taxonomique des microbiomes des branchies, de la peau et de l'intestin de la truite arc-en-ciel, entraînant un enrichissement de bactéries pathogènes et antibiorésistantes qui pourraient compromettre la santé de l'hôte et la stabilité plus large de l'écosystème.

Marine Suchet, Pauline Pannetier, Morgane Danion, Thomas Braunbeck, Préscillia Alves Gomes, Jérôme Cachot, Laure Bellec2026-06-30