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🧬 biology

An Acinetobacter baumannii acyltransferase represses pilin production to maintain energy homeostasis and overcome nutritional immunity

L'étude identifie l'acyltransférase AimS d'*Acinetobacter baumannii* comme un facteur critique pour surmonter l'immunité nutritionnelle de l'hôte en réprimant la production de pili et la formation de biofilm via le régulateur CsuR, préservant ainsi l'ATP cellulaire pour maintenir l'homéostasie énergétique et assurer la fitness bactérienne lors d'une infection respiratoire.

Eric Skaar, Dillon Kunkle, Owen Burroughs, Christopher Corcoran2026-06-30
🧬 biology

A Network-Control Approach to Seizure Intervention via Adjoint Optimal Control

Cet article propose un système de stimulation cérébrale profonde en boucle fermée qui utilise un modèle de réseau de 60 régions cérébrales sous forme d'oscillateurs de Hopf, combinant un détecteur prédictif avec une stratégie de contrôle à deux niveaux (régulation linéaire-quadratique et contrôle optimal adjoint) pour prévenir avec succès les bifurcations de type crise d'épilepsie dans 100 % des simulations.

Aadi Deosthaler, Samarth Muralidhara, Yashas Anil2026-06-30
🧬 biology

Aging reprograms the functional, epigenetic, and metabolic landscape of macrophages

Cette étude révèle que le vieillissement reprogramme activement les macrophages à travers des changements coordonnés de l'épigénétique, du métabolisme et de la fonction — caractérisés par une réponse réduite aux cytokines, un métabolisme lipidique altéré et des changements phénotypiques spécifiques — plutôt que de simplement causer un déclin fonctionnel, offrant ainsi un nouveau cadre pour comprendre l'inflammaging et les maladies liées à l'âge.

Manasa Suresh, Francisco Tapia Belmonte, Bryan T. Weselman, Xintang Li, Marie Durr, Isabella Duchovny, Yanitza Gutierrez (…)2026-06-30
🧬 biology

Multi-state modeling associates proliferation genes with early estrogen receptor-positive breast cancer recurrence and survival

Cette étude utilise la modélisation multi-états pour démontrer qu'une expression élevée de gènes liés à la prolifération est significativement associée à une récidive précoce et à une mortalité ultérieure dans le cancer du sein à récepteurs d'estrogènes positifs à haut risque, tandis que la récidive tardive est liée à des voies de signalisation distinctes.

Yongzhe Wang, Christine Quinones, Irene Kang, Hope Rugo, Ernest Martinez, Victoria Seewaldt, Joanne Mortimer, Aritro Nat (…)2026-06-30
🧬 biology

Single-Cell Foundation Models in Biotechnology: A Scoping Review and Bibliometric Analysis of Multimodal AI for Cell-State, Perturbation, and Biomarker Prediction

Cette revue de portée et analyse bibliométrique de 1 042 études révèle que, bien que les modèles de fondation à cellule unique se développent rapidement dans la biotechnologie, le domaine souffre d'une reproductibilité incohérente, d'une rigueur de référence médiocre et d'un manque de ressources ouvertes, des modèles de base simples s'avérant souvent compétitifs face à des architectures complexes.

Behin Omidi, Mohammmad Mahdi Hemati Aalm, Arshia Farmahini Farahani, Amir Reza Hassan Poor Barkadehi2026-06-30
🧬 biology

Identification of Differentially Expressed Genes Related to UFMylation Modifications in Periodontitis: Integrated Insights from Transcriptomics and Clinical Experiments

Cette étude intègre l'analyse transcriptomique, l'apprentissage automatique et la validation clinique pour identifier C4A, GANAB et TUBA4A comme des biomarqueurs diagnostiques clés liés à l'Ufmylation pour la parodontite, élucidant leurs rôles dans les voies immunitaires et métaboliques et proposant des cibles thérapeutiques potentielles.

Changqing Mu, Juan Liu, Kaining Liu, Xiaofeng Huang2026-06-30
🧬 biology

Timing of menstrual cups to prevent transition from optimal to not optimal vaginal microbiome community state type: Results from a 6.5-year prospective observational cohort

Dans une étude de cohorte prospective de 6,5 ans menée auprès de collégiennes kényanes, l'utilisation de la coupe menstruelle a significativement réduit le risque de transition d'un microbiote vaginal optimal dominant en *L. crispatus* vers un état non optimal, suggérant que la fourniture de coupes avant le premier rapport sexuel est cruciale pour maintenir la santé vaginale.

Supriya Mehta2026-06-30
🧬 biology

Ethnicity-Stratified Inflammatory Phenotyping Using GMM Clustering and XGBoost Regression: A Cross-Ethnicity Nearest-Neighbour Framework for Precision CRP Estimation in NHANES 2017–2023

Cette étude utilise un cadre d'apprentissage automatique en deux étapes combinant le partitionnement GMM et la régression XGBoost sur les données NHANES 2017–2023 pour révéler que les réponses de la CRP induites par les macronutriments varient considérablement selon le phénotype métabolique et l'ethnicité, mettant en évidence un « paradoxe de la résilience aux fibres » dans les populations noires non hispaniques et préconisant une approche de nutrition de précision stratifiée.

Anshul Iyer, Vania Sharma2026-06-30
🧬 biology

EEG Signal Variance as a Biomarker for Ictal State Classification: Subject-Level Validation of a Random Forest Classifier using the University of Bonn Dataset

Cette étude démontre que la variance du signal EEG est un biomarqueur robuste pour distinguer les états ictaux et valide qu'un classifieur de type Forêt Aléatoire, entraîné sur l'ensemble de données de l'Université de Bonn avec un partitionnement strict des données par sujet pour éviter toute fuite de données, atteint une précision (96,2 %) et une sensibilité (98,3 %) élevées dans la détection des crises.

Md. Ahasanul Al Hasib Ayon2026-06-30
🧬 biology

Differential Signaling in Adaptive Immunity: Deciphering the Mechanism to Identify the Physical and Evolutionary Bases of Non‑Self

Cet article propose un cadre mécano-physique identifiant le déplacement mécanique différentiel comme la variable fondamentale permettant aux récepteurs immunitaires adaptatifs de discriminer le soi du non-soi en mesurant les écarts abrupts dans les champs de forces physiques à la résolution des acides aminés, unifiant ainsi la reconnaissance humorale et cellulaire par une cascade de décision progressive qui résout des paradoxes de longue date concernant la spécificité immunitaire.

Yasir Arafat Maassoom2026-06-30