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Population genomics of transcontinental grapevines reveals divergent evolutionary trajectories and cis-regulatory mechanisms underlying cold adaptation

Cette étude intègre la génomique des populations transcontinentales et la validation fonctionnelle pour révéler que les trajectoires évolutives divergentes de l'adaptation au froid chez la vigne sont pilotées par les régimes thermiques hivernaux, spécifiquement via un mécanisme de régulation cis, où *vvi-miR169g* régule négativement la tolérance au froid en clivant les transcrits de *NF-YA*.

Yue Song, Lujia Wang, Lipeng Zhang, Mingzheng Han, Yuanxu Teng, Junpeng Li, Zhen Zhang, Dongying Fan, Yuanyuan Xu, Chenl (…)2026-08-25

🧬 biology

Molecular, phenotypic, and genomic characterization of UPEC/EAEC hybrid Escherichia coli strains isolated from urinary tract infections in Northeastern Brazil

Cette étude caractérise les profils moléculaires, phénotypiques et génomiques de souches hybrides d'Escherichia coli UPEC/EAEC génétiquement diverses isolées d'infections urinaires dans le nord-est du Brésil, révélant leur circulation généralisée, leurs traits de virulence hétérogènes et leurs trajectoires évolutives complexes.

Dayara Oliveira Silva, Flayane Chagas Oliveira, Luis Felipe Bezerra Lino, Ana Elisa Silva Alves, Rafhaella Nogueira Dell (…)2026-08-25

🧬 biology

Genomic Insights into Multidrug Resistance, Virulence, and Phage Defense in Poultry-Derived Shigella sonnei from Bangladesh

Cette étude présente la première caractérisation génomique d'une souche de *Shigella sonnei* multirésistante et virulente isolée de la volaille au Bangladesh, révélant un potentiel élevé de transfert horizontal de gènes de résistance et soulignant la nécessité urgente d'une approche « One Health » pour surveiller la résistance aux antimicrobiens à l'interface homme-animal-environnement.

Fahim Ibna Md. Bin Mos, Nizam Uddin, Shahina Akter, Tanjina Akhtar Banu, Mousona Islam, Barna Goswami, Showti Raheel Nas (…)2026-08-25

🧬 biology

Characterization of Parrot Bornavirus-4 Infection in Immortalized and Primary Cell Lines

Cette étude caractérise la réplication du parrot bornavirus-4 (PaBV-4) in vitro, démontrant que son spectre d'hôtes est principalement déterminé par la permissivité cellulaire plutôt que par une adaptation virale rapide, et révélant une forte interférence entre le PaBV-4 et les orthobornavirus apparentés lors de l'infection.

Antonius El-Khoury, Praveen Akmeemana, Igor R. Santos, Phuc H. Pham, Brandon N. Lillie, Sarah K. Wootton, Leonardo Susta2026-08-25

🧬 biology

ATF2 drives macrophage-mediated anti-PD-1 resistance by coupling KAT3A-dependent H3K18 lactylation with CCL2 transcription in hepatocellular carcinoma

Cette étude identifie l'ATF2 comme un moteur critique de la résistance à l'anti-PD-1 dans le carcinome hépatocellulaire en recrutant des macrophages de type M2 via un mécanisme de lactylation de H3K18 dépendant de KAT3A qui amplifie la transcription de CCL2, établissant ainsi un nouvel axe thérapeutique pour surmonter l'échec de l'immunothérapie.

Yucheng Hou, Conghuan Shen, Changjie Yang, Fangqi Ma, Ensi Ma, Hongyuan Xue, Chao Sun, Li Li, Jianhua Li, ruipeng song (…)2026-08-25

🧬 biology

Statistical and machine learning inference for depletion risk assessment in a stochastic harvesting model with weak Allee effects

Cette étude évalue la performance du quasi-maximum de vraisemblance gaussien, de la régression polynomiale parcimonieuse, des réseaux de neurones hétéroscédastiques et d'un modèle hybride mécaniciste-neuronal pour estimer la dynamique de récolte stochastique avec des effets Allee faibles, constatant que bien que le quasi-maximum de vraisemblance soit le plus précis et le plus efficace sous une spécification de modèle correcte, toutes les méthodes peinent à estimer le paramètre d'Allee faible à partir de données parcimonieuses de faible biomasse, ce qui conduit à des évaluations de risque divergentes pour la gestion des pêcheries à mesure que la pression de pêche approche des limites de persistance.

Nuno M. Brites2026-08-25

🧬 biology

A GPU-native, differentiable fiber simulator reveals a species-dependent selectivity penalty in reduced-order peripheral-nerve models

Les auteurs ont développé jaxon, un simulateur natif du GPU, rapide et différentiable, qui révèle que les modèles standards de fibre unique surestiment considérablement la sélectivité de la stimulation dans les nerfs périphériques humains en raison de la taille importante des fascicules, une divergence qui peut être corrigée en validant les conceptions sur des populations de fibres complètes.

Max Haberbusch, David Lung2026-08-25

🧬 biology

Genomic inbreeding coefficient predicts extinction risk

Cette méta-analyse de plus de 1 000 populations à travers 454 espèces démontre que le coefficient de consanguinité génomique (FROH) est un prédicteur significatif du risque d'extinction, des niveaux de FROH plus élevés étant corrélés à un statut de menace plus important, particulièrement chez les espèces présentant des traits de cycle de vie lents.

Yangfan Chen, Xi Wang, Sizhe Hu, Hongbo Wang, Juha Merilä2026-08-25

🧬 biology

Correlation Analysis of 21-Gene Recurrence Score with Gene Pathway Expression and Clinicopathological Features in Hormone Receptor-Positive Early-Stage Breast Cancer

Cette étude d'une cohorte chinoise démontre que, dans le cancer du sein précoce à récepteurs hormonaux positifs et HER2 négatif, le score de récurrence de 21 gènes est principalement piloté par les activités des voies moléculaires — spécifiquement les scores d'invasion et de groupe œstrogénique — qui expliquent une variance significativement plus élevée que les facteurs clinicopathologiques traditionnels, le grade histologique étant l'unique prédicteur clinique indépendant.

Heng Liu, Xin Tang, Xiunan Li2026-08-25

🧬 biology

Sex- and age-dependent energetic dysfunction in LRRK2 G2019S Parkinson’s model revealed by structural analysis of RGC dendritic architecture and metabolic profiling of optic nerve

Cette étude révèle que les souris mâles et femelles LRRK2 G2019S présentent des différences liées au sexe et à l'âge dans la dégénérescence structurelle des cellules ganglionnaires de la rétine et les profils métaboliques du nerf optique, les mâles montrant des déficits plus précoces qui convergent finalement avec ceux des femelles vers un point final pathologique partagé, offrant ainsi des biomarqueurs potentiels pour la stadification précoce de la maladie de Parkinson.

Gloria Cimaglia, James R. Tribble, Pete A. Williams, James E. Morgan, Marcela Votruba, Dayne Beccano-Kelly2026-08-25

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