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🧬 biology

Emergence of novel begomovirus species through recombination in chilli leaf curl disease epidemics in southern India

Cette étude identifie deux nouvelles espèces de begomovirus, le virus de la feuille enroulée du piment de Dindigul et le virus de la feuille enroulée du piment de Karur, aux côtés de souches établies, comme les agents causaux d'épidémies graves de la maladie de l'enroulement des feuilles du piment dans le sud de l'Inde, révélant des événements de recombinaison étendus et une forte sélection purificatrice qui stimulent l'évolution rapide de ces complexes viraux.

E. Santhoshinii, Shamarao Jahagirdar, Krishnaraj P.U., Kambrekar D.N., Pragadeesh Ayyamuthu Rajarathinam Uma, Gurudatta (…)2026-09-16
🧬 biology

GeneResolver: A Traceable Hybrid Multi-Agent Pipeline for Etiology-Aware Gene Prioritization

GeneResolver est un pipeline hybride multi-agents traçable et respectueux de la vie privée qui améliore le diagnostic des maladies rares en classant d'abord l'étiologie du cas pour orienter les preuves de manière appropriée, surpassant ainsi les outils existants tant sur les critères phénotypiques seuls que sur les critères combinés phénotype-génomique.

Ivana Vichentijevikj, Kostadin Mishev, Monika Simjanoska Misheva2026-09-16
🧬 biology

MDD-Explorer: A Multi-scale Visual Evolution Framework for Dynamic Functional Connectivity in Depression

MDD-Explorer est un cadre d'analyse visuelle multi-échelle qui intègre une modélisation de transition d'état non supervisée à des visualisations interactives pour aider les cliniciens à identifier et à interpréter les modèles de connectivité fonctionnelle dynamiques associés au trouble dépressif majeur dans des ensembles de données IRMf à grande échelle.

Shusheng Li, Ziyang Cheng, Liang Chen, Haoran Xu2026-09-16
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Neonatal Meconium Microbiota and Its Possible Association with Allergy in Two-Year Follow-up: A Pilot Study

Cette étude pilote a utilisé le séquençage de nouvelle génération du méconium néonatal pour démontrer qu'une diversité microbienne plus faible et des changements de composition spécifiques, tels que des rapports *Diaphorobacter*/*Clostridioides* altérés, sont associés au développement ultérieur d'allergies alimentaires lors d'un suivi de deux ans.

Çiğdem Eda BALKAN BOZLAK, Tuğba Nur KUTLU BEŞEREN, Ahmet YILMAZ2026-09-16
🧬 biology

SETDB1 Loss Dysregulates Translation-Related Pathways and Autism-Associated Gene Networks in Mouse Embryonic Stem Cells

Cette étude démontre que la perte du régulateur épigénétique SETDB1 dans les cellules souches embryonnaires de souris déclenche la mort cellulaire et la perte de pluripotence en dérégulant les voies liées à la traduction et en modifiant significativement l'expression d'un réseau de gènes associés à l'autisme de haute confiance.

Lixia Dong, Yuanyuan Chen, Cuizhen Zhu2026-09-16
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Grassland species loss over the past decade in a highly fragmented landscape with an extinction debt

Un nouveau relevage des communautés végétales de prairies dans un paysage fragmenté japonais sur une décennie révèle que la perte significative d'espèces et le désassemblage des communautés sont pilotés à la fois par la destruction récente des habitats et par des changements paysagers historiques persistant sous forme de dette d'extinction, ces effets décalés variant selon l'échelle spatiale et le groupe fonctionnel des plantes, ce qui souligne la nécessité d'une restauration proactive parallèlement à la conservation des habitats.

TOMOYO F. KOYANAGI, ASUKA KOYAMA2026-09-16
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In vivo base editing rescues hearing in humanized MPZL2 mice within a structure-dependent therapeutic window

Cette étude démontre que l'édition de bases in vivo peut restaurer efficacement l'audition dans un modèle de souris humanisé de la DFNB111, même après la maturation cochléaire, à condition que l'architecture des cellules de Deiters demeure intacte, établissant ainsi l'intégrité structurelle plutôt que l'âge chronologique comme le déterminant critique de la fenêtre thérapeutique.

Sang-Yeon Lee, Sangsu Bae, Sohyang Jeong, Byeong-Hee Kang, Won Hoon Choi, Yeji Choi, Hansol Koo, Woo Seok Byun, Yejin Yu (…)2026-09-16
🧬 biology

Uncovering the landscape of functional transition and plasticity in the tumor microenvironment

En analysant l'adénocarcinome pulmonaire et le cancer colorectal, cette étude cartographie le paysage de la plasticité fonctionnelle au sein du microenvironnement tumoral, révélant des états myéloïdes transitoires spécifiques à la tumeur associés à l'immunosuppression et une convergence généralisée de types cellulaires divers vers des états fonctionnels similaires.

Riddhiman Dhar, Subhasis Datta, Rakesh Mandal, Sohom Basak2026-09-16
🧬 biology

Can Machine Learning Identify Meaningful Patterns in DNA Sequences? A Computational Study of DNA Motifs Associated with Transcription-Factor Binding

Cette étude computationnelle indépendante démontre que les classifieurs d'apprentissage automatique, particulièrement la Forêt Aléatoire (Random Forest), peuvent distinguer efficacement les séquences d'ADN associées à CTCF de fonds de dinucléotides mélangés en utilisant des caractéristiques de fréquence de k-mers courts, établissant ainsi un flux de travail de bout en bout transparent et reproductible pour l'intégration de la biologie moléculaire avec l'apprentissage automatique appliqué.

Hafsa Asmatullah2026-09-16
🧬 biology

Metazoan-wide phylogenomics supports the emergence of recognisable canonical prostanoid-receptor family structure across the vertebrate transition

Cette étude phylogénomique à l'échelle des métazoaires démontre que la structure canonique en huit familles des récepteurs aux prostanoides est une innovation spécifique aux vertébrés, révélant que les homologues de non-vertébrés précédemment proposés sont en réalité des lignées de récepteurs distinctes dont la similitude apparente avec les récepteurs EP4 des vertébrés découle d'une proximité phylogénétique plutôt que d'une véritable orthologie.

Sebastiano Scibelli2026-09-16