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🧬 biology

Structural variants contribute substantially to complex trait heritability

Cette étude introduit l'outil MiXeR-SV pour démontrer que les variants structurels, bien qu'ils ne constituent qu'une faible fraction des variants génomiques, contribuent de manière significative à l'héritabilité de nombreux traits complexes — particulièrement dans les phénotypes hématologiques, métaboliques et cancéreux — aidant ainsi à combler l'écart entre les estimations d'héritabilité basées sur les SNP et celles issues des jumeaux.

Dat Thanh Nguyen, Alexey A. Shadrin, Nadine Parker, Julian Fuhrer, Nam S. Vo, Anders M. Dale, Ole A. Andreassen, Oleksan (…)2026-08-06
🧬 biology

RECIPE bridges transcriptomics and proteomics with deep graph learning on Ribo-seq data

L'article introduit RECIPE, un cadre de réseau de neurones graphiques qui exploite les données de Ribo-seq ou transcriptomiques intégrées aux réseaux d'interactions protéine-protéine pour prédire avec précision les abondances protéiques à l'échelle du protéome, surmontant efficacement les limites des mesures protéomiques incomplètes dans les contextes tant globaux (bulk) que de cellule unique.

Jun Ding, Luying Su, Bowen Zhao, Kailu Song, Dingfeng Zou, Jingtao Wang, Ziyang Wang, Wei Liu, Xiuhui Yang, Qinghui Duan (…)2026-08-06
🧬 biology

Microbiome-to-Nigrostriatal Vulnerability Mapping Prioritizes SCFA-Linked Gut-Brain Axes in Parkinson’s Disease

L'étude introduit le cadre MiNi-PD pour hiérarchiser les axes intestin-cerveau dans la maladie de Parkinson, révélant que les métabolites liés aux acides gras à chaîne courte, particulièrement le butyrate et l'acide 3-indolepropionique, convergent sur le gène hôte IL1B au sein de la substance noire pour définir un mécanisme inflammatoire biologiquement significatif.

Nabanita Ghosh2026-08-06
🧬 biology

Proton-coupled alternating access in a versatile mycobacterial Spns drug transporter

Cette étude élucide la versatilité mécanistique du transporteur MsSpns de la mycobactérie en démontrant comment les changements de conformation induits par la protonation et des interactions distinctes avec les substrats permettent au repliement Spns d'alimenter des modes de transport opposés, facilitant à la fois l'efflux de cations hydrophiles et l'absorption de composés lipophiles.

Reza Dastvan, Samantha Gies, Kevin Jagessar, Tianqi Wu, Ian Miller, Khadijeh Dastvan2026-08-06
🧬 biology

Genome-scale molecular profiling from routine histopathology with a multimodal pathology foundation model

L'article présente Fuji, un modèle de fondation pathologique multimodal entraîné sur plus de 60 000 images de lames entières appariées à des données génomiques, qui parvient à inférer avec succès des états moléculaires à l'échelle du génome, des processus mutationnels et des résultats cliniques directement à partir de l'histologie de routine, comblant ainsi le fossé entre la morphologie tissulaire et les mécanismes moléculaires sous-jacents.

Guangyu Wang, Qing Li, Jian Sang, Yiwei Xiao, Pengzhi Zhang, Weiqing Chen, Tu Tran, Zejuan Li, Shengyu Li, Tongwu Zhang2026-08-06
🧬 biology

Cardiolipin remodeling reflects mitochondrial reprogramming in clear cell renal cell carcinoma

Cette étude révèle que le carcinome rénal à cellules claires est caractérisé par une réduction significative et un remodelage oxydatif de la cardiolipine, reflétant une déplétion mitochondriale et une régulation positive compensatoire insuffisante de l'enzyme de remodelage TAZ, ce qui met collectivement en évidence une vulnérabilité métabolique potentielle dans la maladie.

Rento Ito, Renpei Kato, Ikarashi Daiki, Shigekatsu Maekawa, Mitsugu Kanehira, Yosuke Matsushita, Yosui Nojima, Kenji Miz (…)2026-08-06
🧬 biology

MIDLPred: Ensemble Learning for Phenotype-Oriented Classification of Male Infertility Candidate Proteins from Primary Amino Acid Sequences

Cette étude introduit MIDLPred, un cadre d'apprentissage d'ensemble utilisant un réseau de neurones convolutifs unidimensionnel pour classer avec précision les protéines candidates à l'infertilité masculine en quatre catégories de phénotypes distinctes directement à partir de leurs séquences d'acides aminés primaires, aidant ainsi les chercheurs à prioriser les cibles pour des investigations plus approfondies.

Abdelhafedh BEN DAHMANE, Mustapha BENSAADA, Hamza CHEHILI, Salah eddine ALIOUANE, Mohamed Abdelhafid HAMIDECHI2026-08-05
🧬 biology

New records and phylogenetic placement of two soft coral species (Octocorallia: Malacalcyonacea: Cladiellidae) from the Gulf of Kachchh, India

Cette étude rapporte les premières observations de deux espèces de coraux mous, *Cladiella pachyclados* et *Aldersladum sodwanum*, dans le golfe de Kachchh, en Inde, en utilisant des données morphologiques et moléculaires combinées pour fournir des identifications provisoires tout en soulignant la nécessité de travaux taxonomiques intégratifs supplémentaires pour résoudre les ambiguïtés phylogénétiques et soutenir les efforts de conservation dans cet écosystème récifal extrême.

RETHNARAJ CHANDRAN, RENGAIYAN PERIASAMY, RAMASAMY SENTHIL KUMARAN, CHANDRASEKAR SURENDAR, DHRITI BANERJEE2026-08-05
🧬 biology

Initial Cell Number Regulates Microscale Community Assembly and Structure

Cette étude démontre que le nombre initial de cellules dans les micro-agrégats du sol est un moteur critique de l'assemblage des communautés microbiennes, régulant la formation de biofilms, la dominance taxonomique, la diversité et les réseaux d'association d'une manière dépendante de la source de carbone.

Zhaoshuo Zhang, Chun-Hui Gao, Fangkui Wang, Jiliang Hu, Huan He, Yichao Wu, Chenchen Qu, Ke Dai, Qiaoyun Huang, Peng Cai2026-08-05
🧬 biology

Interpersonal autonomic coupling profiles distinguish social transmission from common-input synchrony

Cette étude démontre que le couplage autonome directionnel, particulièrement le couplage sympathique du leader vers le suiveur, peut distinguer la transmission à médiation sociale de la synchronie par entrée commune, révélant que l'alignement physiologique interpersonnel est dépendant du canal et du contexte.

Martina De Marinis, Andrea Gargano, Francesco Bossi, Sergio Frumento, Alejandro Callara, Enzo Scilingo, Alberto Greco2026-08-05