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🧬 biologie

Exploration of Low-Abundance Tundrisphaera and Tissue 3-Hydroxybutyric Acid (β-HB) in Gastric Cancer Lymphovascular Invasion: A Multi- Cohort Multi-Omics Study with Clearly Defined Evidence Boundaries

Cette étude multi-omique identifie une relation inverse significative entre la bactérie à faible abondance *Tundrisphaera* et un taux élevé de 3-hydroxybutyrate (β-HB) tissulaire dans l'invasion lymphovasculaire du cancer gastrique, tout en notant que le signal métabolique manque de signification à l'échelle du génome et que le candidat microbien n'a été détecté qu'en appliquant des critères de sélection assouplis.

Jiayang Gong, Qin Wang, Zhe Wang, Yun Shi, Minlan Ren, Tingting Li, Dong Wang, Gang Li, Rui Peng2026-11-04
🧬 biologie

Comparative multi-omics of host genome, metabolome and associated rhizosphere microbiota across karst-endemic and widespread Rhododendron species

Cette étude intègre des analyses multi-omiques pour révéler que le *Rhododendron bailiense*, endémique des zones karstiques, persiste dans des habitats pauvres en phosphore et riches en calcium grâce à une stratégie coordonnée impliquant l'expansion des gènes du métabolisme secondaire, la production de métabolites foliaires spécifiques et le recrutement d'un microbiome rhizosphérique distinctif spécialisé dans la mobilisation du phosphore et le cycle des minéraux.

Sulin Wen, Yuxin Leng, Hulan Yao, Kui Zhou, Yi Min, Lei Peng, Jing Ou, Guang Qiao, Xiaopeng Wen, Guijie Ding2026-11-04
🧬 biologie

Distinct transcriptomic programs and proximal AKT activation associated with AKT1 E17K and PIK3CA hotspot mutations in HR-positive/HER2-negative breast cancer Running title: Molecular differences between AKT1- and PIK3CA-mutant breast cancer

Cette étude démontre que bien que les mutations hot-spot AKT1 E17K et PIK3CA dans le cancer du sein HR-positif/HER2-négatif soient mutuellement exclusives et souvent regroupées, elles pilotent des programmes transcriptomiques distincts et présentent une activation proximale préférentielle d'AKT sans activation uniforme de mTOR en aval, indiquant qu'elles représentent des états moléculaires non équivalents.

Qin Zhang, Hong Liu2026-11-04
🧬 biologie

The Temporal Validity of Taxonomic Entailments in Evolving Biomedical Ontologies

Cette étude quantifie la validité temporelle des implications taxonomiques à travers huit ontologies biomédicales sur 16 ans, révélant que les connaissances dérivées expirent à un taux significatif largement indétectable par les signaux de dépréciation standards, nécessitant ainsi une redérivation fréquente ou une vérification des chemins de justification pour maintenir l'intégrité du système.

Elena Udrescu, Alexandru Udrescu, Mihai Bîzoi, Ana-Maria Suduc2026-11-04
🧬 biologie

Coordinated Promoter Methylation and METTL3–YTHDF2 m6A-Dependent Decay Define a Tumor-Suppressive ZNF677 Program with Independent Prognostic Value in Oral Squamous Cell Carcinoma

Cette étude identifie ZNF677 comme un gène suppresseur de tumeur dans le carcinome épidermoïde buccal qui est réprimé par une méthylation coordonnée de l'ADN du promoteur et par la dégradation de l'm6A médiée par METTL3–YTHDF2, son expression plus élevée servant de prédicteur indépendant d'une amélioration de la survie des patients.

Zebiao Zhang, Yanru Chen, Ying Zhang, Liangliang Zhuang, Liuyi Zhang, Yang Zhang2026-11-04
🧬 biologie

Increased Intracellular Zn²⁺ Levels Suppress Ca²⁺-Dependent Cytotoxicity in Rat Thymocytes

Cette étude démontre qu'une augmentation des taux de Zn²⁺ intracellulaire supprime la cytotoxicité dépendante du Ca²⁺ induite par l'A23187 dans les thymocytes de rat en inhibant l'élévation du Ca²⁺ intracellulaire et l'hyperpolarisation membranaire, agissant ainsi comme un régulateur négatif de la mort cellulaire de phase précoce.

Masamichi Ae, Yasuyuki Izutani, Akihiro Yoshie, Noriko Takashima, Norio Kamemura2026-11-04
🧬 biologie

Barcoding the green macroalgae (Ulvophyceae) from the Alagoas coast: new records and an updated checklist

Cette étude utilise le codage à barres de l'ADN pour réévaluer la diversité des Ulvophyceae le long de la côte d'Alagoas, révélant une diversité cryptique significative et de nouveaux enregistrements géographiques qui doublent presque le nombre d'espèces connues pour la région et soulignent les limites de l'identification basée sur la morphologie.

Jhullyrson Osman Ferreira de Brito, Victor Andrei Rodrigues Carneiro, Valéria Cassano, Watson Arantes Gama2026-11-04
🧬 biologie

Silica-challenged macrophage secretome drives distinct alveolar and bronchial epithelial-fibroblast crosstalk: a multicellular preclinical modelling approach

Cette étude démontre que le sécrétome de macrophages stimulés par la silice induit des réponses fibrotiques et inflammatoires distinctes et spécifiques au type cellulaire lors des interactions entre les épithéliums alvéolaires et les fibroblastes bronchiques, soulignant la supériorité des modèles de co-culture 3D multicellulaires sur les systèmes 2D traditionnels ou animaux pour l'étude de la pathogenèse de la silicose et le criblage de thérapeutiques.

Sakthi Priya Selvamani, Ling Zhuang, Ben Johnson, Ellen Donohoe, Huaikai Shi, Richard Zelei, Vivek Dharwal, Maaike Kockx (…)2026-11-04
🧬 biologie

An Icariin-Informed Nine-Gene Transcriptomic Signature Identifies Mesenchymal–Stromal Recurrence Risk in Resected Colorectal Cancer: External Validation and Single-Cell Localization

Cette étude identifie et valide de manière externe une signature transcriptomique de neuf gènes dérivée de cibles de l'icariine qui stratifie le risque de récidive mésenchymateuse-stromale dans le cancer colorectal réséqué, offrant une prédiction du risque relatif améliorée par rapport aux facteurs cliniques standards malgré la nécessité d'une confirmation expérimentale prospective.

Fei Zuo, Jiapan Yan, Mingni Jiang, Tianping Luo2026-11-04
🧬 biologie

Assessing Cryptosporidium presence in pet owned and introduced non-native freshwater turtles in the UK

Une étude portant sur 77 tortues d'eau douce du Royaume-Uni a révélé un taux élevé de détection par PCR de *Cryptosporidium*, mais n'a confirmé que deux cas zoonotiques spécifiques (*C. parvum* et *C. ryanae*), suggérant un risque de transmission globalement faible malgré le potentiel de pollution par des agents pathogènes issus de l'abandon d'animaux de compagnie.

Suzie M. Simpson, Kalliopi Pantzi, Richard A. Griffiths, Anastasios D. Tsaousis2026-11-04