Technological folie à deux: Feedback Loops Between AI Chatbots and Mental Illness

Cet article met en évidence les risques émergents de déstabilisation des croyances et de dépendance chez les personnes souffrant de troubles mentaux résultant d'interactions avec des chatbots IA, appelant à une réponse coordonnée entre la pratique clinique, le développement de l'IA et les cadres réglementaires pour atténuer ces boucles de rétroaction dangereuses.

Sebastian Dohnány, Zeb Kurth-Nelson, Eleanor Spens, Lennart Luettgau, Alastair Reid, Iason Gabriel, Christopher Summerfield, Murray Shanahan, Matthew M NourThu, 12 Ma🧬 q-bio

Multi-factor modeling of chlorophyll-a in South China's subtropical reservoirs using long-term monitoring data for quantitative analysis

En se basant sur des données de surveillance à long terme (2020-2024) de trois réservoirs du Guangdong, cette étude démontre que l'azote total est le principal facteur limitant la prolifération du chlorophylle-a dans ces écosystèmes subtropicaux et développe un modèle hydro-écologique dynamique qui révèle l'effet synergique des températures supérieures à 25 °C et des nutriments sur la croissance des algues.

Haizhao Guan, Yiyuan Niu, Chuanjin Zu, Ju KangThu, 12 Ma🧬 q-bio

Trade-offs between structural richness and communication efficiency in music network representations

Cette étude démontre que le choix des encodages de caractéristiques dans les représentations en réseau de la musique crée un compromis fondamental entre la richesse structurelle et l'efficacité de la communication, où les représentations simples favorisent une incertitude globale élevée mais un faible erreur de modèle, tandis que les représentations complexes préservent des distinctions fines au prix d'une expansion de l'espace d'états et d'une erreur accrue, façonnant ainsi la plausibilité des attentes perceptives des auditeurs.

Lluc Bono Rosselló, Robert Jankowski, Hugues Bersini, Marián Boguñá, M. Ángeles SerranoThu, 12 Ma🧬 q-bio

pHapCompass: Probabilistic Assembly and Uncertainty Quantification of Polyploid Haplotype Phase

Le papier présente pHapCompass, un algorithme probabiliste innovant pour l'assemblage de haplotypes chez les organismes polyploïdes, qui quantifie l'incertitude d'assignation des lectures, propose un nouveau workflow de simulation réaliste et démontre des performances compétitives tout en fournissant une estimation précise de l'incertitude de phase.

Marjan Hosseini (School of Computing, University of Connecticut), Ella Veiner (School of Computing, University of Connecticut), Thomas Bergendahl (School of Computing, University of Connecticut), Tala Yasenpoor (School of Computing, University of Connecticut), Zane Smith (Department of Entomology and Plant Pathology, University of Tennessee), Margaret Staton (Department of Entomology and Plant Pathology, University of Tennessee), Derek Aguiar (School of Computing, University of Connecticut, Institute for Systems Genomics, University of Connecticut)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Single-cell directional sensing at ultra-low chemoattractant concentrations from extreme first-passage events

Cette étude démontre que les cellules peuvent inférer rapidement et précisément la direction d'une source de chimioattractant à très faible concentration en exploitant les statistiques des événements de liaison récepteur précoces, qui contiennent une information directionnelle disproportionnée par rapport aux arrivées ultérieures.

Vincent Fiorino, Sean D. Lawley, Alan E. LindsayThu, 12 Ma🧬 q-bio

SDSR: A Spectral Divide-and-Conquer Approach for Species Tree Reconstruction

Ce papier présente SDSR, une méthode évolutive de reconstruction d'arbres d'espèces basée sur une approche spectrale diviser-pour-régner qui, tout en préservant la précision, réduit considérablement le temps de calcul par rapport aux méthodes existantes.

Ortal Reshef (Hebrew University of Jerusalem), Ofer Glassman (Weizmann Institute of Science), Or Zuk (Hebrew University of Jerusalem), Yariv Aizenbud (Tel Aviv University), Boaz Nadler (Weizmann Institute of Science), Ariel Jaffe (Hebrew University of Jerusalem)Thu, 12 Ma🧬 q-bio

Discovery of a Hematopoietic Manifold in scGPT Yields a Method for Extracting Performant Algorithms from Biological Foundation Model Internals

Cette étude présente la première extraction d'un algorithme biologique compétitif et compact à partir du modèle fondamental scGPT, révélant une variété hématopoïétique interne qui, une fois isolée via une méthode d'interprétabilité mécanistique, surpasse les méthodes existantes en précision et en efficacité tout en nécessitant un nombre négligeable de paramètres à entraîner.

Ihor KendiukhovThu, 12 Ma🧬 q-bio

How to make the most of your masked language model for protein engineering

Cette étude propose une méthode d'échantillonnage flexible et efficace par recherche faisceau stochastique pour optimiser les modèles de langage masqués dans l'ingénierie des protéines, démontrant par des évaluations in silico et in vitro sur des anticorps thérapeutiques que le choix de la méthode d'échantillonnage est aussi déterminant que le modèle lui-même.

Calvin McCarter, Nick Bhattacharya, Sebastian W. Ober, Hunter ElliottThu, 12 Ma🧬 q-bio

ATP Level and Phosphorylation Free Energy Regulate Trigger-Wave Speed and Critical Nucleus Size in Cellular Biochemical Systems

Cette étude démontre que l'état énergétique intracellulaire, régi par la concentration d'ATP et l'énergie libre de phosphorylation, module non seulement la vitesse et la taille critique des noyaux de déclenchement des ondes de signalisation cellulaires, mais peut également inverser leur direction de propagation, reliant ainsi les conditions métaboliques à la dynamique spatiale des décisions cellulaires.

Jianwei Li, Kai Meng, Xuewen Shen, Fangting LiThu, 12 Ma🧬 q-bio

SNPgen: Phenotype-Supervised Genotype Representation and Synthetic Data Generation via Latent Diffusion

L'article présente SNPgen, un cadre de diffusion latente conditionnelle qui génère des données génétiques synthétiques alignées sur les phénotypes pour préserver la confidentialité tout en permettant une prédiction des maladies complexes aussi précise que les modèles entraînés sur des données réelles.

Andrea Lampis, Michela Carlotta Massi, Nicola Pirastu, Francesca Ieva, Matteo Matteucci, Emanuele Di AngelantonioThu, 12 Ma🧬 q-bio

Macroscopic Dominance from Microscopic Extremes: Symmetry Breaking in Spatial Competition

Ce papier présente un modèle stochastique de compétition pour les ressources démontrant que si la rupture de symétrie initiale est régie par les statistiques des valeurs extrêmes des temps de premier passage, une interaction non réciproque est strictement nécessaire pour stabiliser la domination macroscopique contre les fluctuations locales.

Stuti Guha, Shawn D. Ryan, Bhargav R. KaramchedThu, 12 Ma🧬 q-bio