🧬 biology

YAPAT — An Open-Source Platform for Active and Weakly Supervised Annotation of Passive Acoustic Monitoring Data

YAPAT est une plateforme open-source basée sur le web qui rationalise l'annotation à grande échelle de données de surveillance acoustique passive en intégrant un étiquetage fondé sur l'ontologie, un apprentissage actif multi-étiquettes et des mécanismes de démarrage à froid doubles afin de réduire l'effort de l'expert et de produire des ensembles de données de haute qualité et interopérables.

Thiago S. Gouvêa, Rida Saghir, Prathmesh P. Doddanawar, Novruz Mammadli, Pratik P. Sitapara, Hannes Kath, Daniel Sonntag2026-07-31
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Mu Rhythm Suppression during Immersive, Live, and 2D Observation of Karate Kata: An EEG Study

Cette étude EEG démontre que l'observation en réalité virtuelle immersive d'un Kata de karaté complexe provoque une suppression du rythme mu central significativement plus grande chez les novices par rapport à l'observation en direct et à la vidéo 2D, suggérant le potentiel supérieur de la RV immersive pour engager les systèmes sensorimoteurs dans la recherche sur l'entraînement moteur et la réadaptation.

Sheida S. Hashemi, Javad Rasti, Mohammad R. Yazdchi2026-07-31
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Synthetic Phenotype Assisted Linear Mixed Models Improve Proteome-Wide Genetic Discovery in Incomplete Biobank Data

L'article présente Syn-PALM, un cadre de modèle mixte linéaire robuste et évolutif qui exploite des données protéomiques synthétiques prédites par apprentissage automatique pour améliorer considérablement la puissance statistique et la découverte génétique dans les études d'association pangénomique malgré une absence de données substantielle dans les ensembles de données de biobanques.

Xihong Lin, Haoyu Yang, Ruoyu Wang, Shuang Song2026-07-30
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Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions

L'article introduit l'Interaction-Token Structural Alignment (ITSA), un cadre interprétable qui convertit les structures protéiques en jetons d'interaction biochimique au niveau des résidus pour un alignement local, démontrant son efficacité à capturer la similitude au niveau des familles et à préserver le contexte mécanistique là où les méthodes traditionnelles axées sur la géométrie échouent.

Samanyu Kulkarni, Ranjita Thapa2026-07-30
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Transforming MRI volumes with Space-Filling Curves reveals Multifractal Signatures of Ageing and Dementia Progression

Cette étude introduit l'analyse par courbe de remplissage d'espace multifractale (MFSCA) pour démontrer que l'organisation spatiale des structures cérébrales, telle que mesurée par la multifractalité dans les données d'IRM, se détériore progressivement, passant d'un état complexe et hétérogène à un état plus simple et homogène avec l'avancement de l'âge et de la progression de la démence.

Marta Lotka, Jacek Grela, Zbigniew Drogosz, Jeremi K Ochab, Paweł Oświęcimka2026-07-30
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Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

Cette étude intègre des données transcriptomiques à l'échelle de la cellule unique et globales pour identifier cinq biomarqueurs liés à l'ubiquitination (MYC, TLR7, CX3CR1, PER1 et GADD45B) impliqués dans la pathogenèse de l'arthrose, révélant leur enrichissement dans la voie TNF-alpha/NF-kappaB, leur association avec des populations de cellules immunitaires spécifiques, ainsi qu'une expression élevée dans les fibroblastes synoviaux, offrant ainsi de nouvelles cibles thérapeutiques pour la maladie.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
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Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

Cette étude démontre que le cal transformé de *Panax vietnamensis* induit par *Agrobacterium rhizogenes* sert d'alternative stable, sans hormones et hautement productive aux racines transformées pour la production in vitro durable de la saponine rare majonoside R2, particulièrement lorsqu'elle est améliorée par l'élicitation au MeJA.

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
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Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

Cette étude introduit un système de coordonnées nucléaires à enregistrement de polarité qui normalise la géométrie nucléaire pour révéler des classes topologiques discrètes et reproductibles de l'organisation chromosomique dans les cellules souches mésenchymateuses humaines, démontrant que les contraintes mécaniques et de polarité dictent des comportements spatiaux asymétriques et spécifiques aux homologues.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
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BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

Cette étude révèle qu'une expression élevée de BMP9 favorise la progression du carcinome hépatocellulaire en promouvant la lactylation de CKS1B-K4, ce qui renforce l'interaction de CKS1B avec CDK1–3 et facilite la dégradation de p27 pour accélérer la progression du cycle cellulaire.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30