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🧬 biology

Complete POR ablation in human adrenal cells reveals steroidogenic rerouting and variant-dependent loss of cytochrome P450 support

En utilisant CRISPR/Cas9 pour générer une inactivation complète de POR dans des cellules humaines surrénaliennes et rénales, cette étude révèle que bien que la stéroïdogenèse canonique soit bloquée, une synthèse de DHEA à faible niveau persiste via des voies alternatives, et que des variants spécifiques associés à des maladies comme P228L présentent des déficits fonctionnels distincts et sélectifs pour l'enzyme, qui sont mieux caractérisés sous un contrôle réglementaire endogène.

Amit Pandey, Anna Matveeva, Jibira Yakubu, Therina du Toit2026-07-28
🧬 biology

Published benchmark AUROC does not predict generalisation: an independent evaluation of protein solubility predictors on native and heterologous E. coli proteins

Cette étude démontre que les AUROC de référence publiées sont de mauvais prédicteurs de la performance de généralisation d'un modèle de solubilité des protéines sur des distributions indépendantes, révélant que les modèles d'apprentissage profond de pointe peuvent sous-performer par rapport à des bases simples et interprétables lorsqu'ils sont appliqués en dehors de leurs domaines d'entraînement spécifiques.

Jakob Oeschey2026-07-28
🧬 biology

Acetate, a short-chain fatty acid, inhibits Coxiella burnetii replication via direct bacteriostatic effect and through vacuolar modulation and host cell perturbations

Cette étude démontre que l'acide gras à chaîne courte acétate inhibe la réplication de *Coxiella burnetii par une combinaison d'effets bactériostatiques directs, de la perturbation de la niche intracellulaire acide via l'élévation du pH vacuolaire et la réduction de la taille, et d'une reprogrammation large des voies de transcription des cellules hôtes.

Yazen Germukly, Ashley Davis, Brooke A. Hall, Vijitha D. Kantety, Alexandria Q. Sandelin, Dhritiman Samanta2026-07-28
🧬 biology

Participant-Level Validation Reveals Optimistic Performance in Repeated-Measure NIPT Modeling: A Reproducibility Study

Cette étude démontre que les modèles de NIPT à mesures répétées présentent souvent une performance gonflée en raison d'une fuite de données au niveau du participant dans la validation croisée standard par enregistrement, nécessitant l'adoption d'une validation groupée par participant pour garantir une généralisation robuste avant l'application clinique.

Renjie Jin2026-07-28
🧬 biology

Transcriptional benchmarking of human monocyte-derived microglia-like cells and iPSC-derived microglia reveals distinct immune-alert and homeostatic programmes

Cette étude évalue systématiquement les profils transcriptionnels et fonctionnels de divers modèles de microglie humaine, révélant que si les microglies dérivées d'iPSC imitent au mieux les états cérébraux homéostatiques et que les cellules dérivées de monocytes conservent des signatures d'alerte immunitaire, les conditions de culture en 3D peuvent partiellement faire évoluer les cellules dérivées de monocytes vers un phénotype plus adapté au tissu malgré leurs origines distinctes.

Hazel Quek, Fazeleh Etebar, Carla Cuní-López, Jamie R. Kutasovic, Romal Stewart, Yi Chieh Lim, Tara L. Roberts, Anthony (…)2026-07-28
🧬 biology

Regulatory Integration, Multistability, and Organizational-State Transitions in Biological Systems

Cette étude propose un cadre bioévo-cybernétique démontrant que l'augmentation de l'intégration réglementaire pousse les systèmes biologiques vers la multistabilité et des transitions d'états organisationnels par le biais d'une restructuration du paysage d'attracteurs, un principe théorique soutenu empiriquement par une augmentation monotone des estimations d'intégration réglementaire à travers le gradient évolutif des procaryotes aux humains.

Zuchang Pei2026-07-28
🧬 biology

Computational Screening of 1,348 FDA-Approved Drugs as Potential BACE1 Inhibitors for Alzheimer's Disease Drug Repurposing

Cette étude présente un criblage computationnel exhaustif de 1 348 médicaments approuvés par la FDA contre la structure de BACE1 prédite par AlphaFold2, identifiant les antiviraux de l'hépatite C, particulièrement le Paritaprévir, comme de nouveaux candidats puissants pour le repositionnement de médicaments contre la maladie d'Alzheimer.

Rayan Rathi2026-07-28
🧬 biology

Ultrafine amorphous silica induces chronic lung epithelial cell stress and pro-fibrotic reprogramming in a particle size‑ and exposure duration‑dependent manner

Cette étude démontre que l'exposition chronique à de faibles doses de silice amorphe ultrafine induit un stress cellulaire persistant et une reprogrammation profibrotique dans les cellules épithéliales pulmonaires de manière dépendante de la taille des particules et de la durée, remettant en question l'hypothèse selon laquelle la silice amorphe est une alternative sûre à la silice cristalline.

Ellen Donohoe, Sakthi Priya Selvamani, Vivek Dharwal, Thomas R. O’Neil, Richard Zelei, Andrew N. Harman, Sharyn Gaskin (…)2026-07-28
🧬 biology

Integrated Multi-Omics and Network-Based Identification of Prognostic Cell-Cycle Hub Genes in Lung cancer

Cette étude intègre des analyses multi-omiques et de réseaux de données transcriptomiques du cancer du poumon pour identifier quatre gènes pivots liés au cycle cellulaire (CDK1, CCNB1, CCNA2 et TOP2A) qui présentent des altérations génétiques significatives, sont corrélés à l'infiltration des cellules immunitaires et servent de biomarqueurs pronostiques robustes associés à une faible survie des patients.

Saba Ehsan, Anupriya Chaudhary, Divya Mishra, Supriya Maurya, Mohan P. Singh2026-07-28