🧬 biology

Plastid codon evolution tracks phylogeny and reveals conserved CpG and TpA depletion in Platycerium

Cette étude démontre que l'évolution des codons plastidiaux chez *Platycerium* est conjointement façonnée par une large histoire phylogénétique et des contraintes de séquence à fine échelle, révélant spécifiquement une déplétion conservée de CpG et de TpA aux limites des codons chez dix-huit espèces.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-21
🧬 biology

MicroSC: A Tiny, Performant Single-Cell Foundation Model

Le papier présente MicroSC, une famille de modèles de fondation pour cellules uniques, minuscules et performants (1,5 M – 7,7 M de paramètres), qui atteignent une quasi-parité avec des modèles enseignants beaucoup plus grands de 51 M de paramètres comme scGPT grâce à une distillation de connaissances efficace, permettant un déploiement rapide et rentable sur du matériel informatique standard tout en démontrant que l'utilité pratique des modèles actuels de cellule unique est hautement compressible.

Olivia Denvis2026-07-21
🧬 biology

Differentiable subset binding: gradient-based cross-view itemset mining for heterogeneous data

Cet article introduit le Differentiable Subset Binding (DSB), une méthode basée sur le gradient et scalable qui surmonte les limitations combinatoires de la liaison de sous-ensembles traditionnelle basée sur Apriori pour identifier efficacement les ensembles d'articles cooccurrents maximaux à travers des vues de données hétérogènes, surpassant les bases de référence existantes tant dans les tests synthétiques que dans les applications biologiques réelles.

Yayoi Natsume-Kitatani2026-07-21
🧬 biology

Automatic clustering of self-defined groups to minimize false disease associations and maximize within-group genetic similarity

Le document présente HAPLOCLUST, une méthode de regroupement à l'échelle de la population et à contrainte de taille qui groupe les individus sur la base de la similitude génétique HLA afin de minimiser les fausses associations de maladies et de maximiser l'homogénéité intra-groupe, offrant ainsi une alternative robuste aux classifications ethniques autodéclarées pour améliorer la compatibilité de transplantation et les études génétiques.

Sapir Israeli, Martin Maiers, Sigal Manor, Bracha Zisser, Yoram Louzoun2026-07-21
🧬 biology

Generating and navigating single cell dynamics via a geodesic bridge between nonlinear transcriptional and linear latent manifolds

GeoBridge est un nouveau cadre qui modélise la dynamique cellulaire sous forme de trajectoires géodésiques au sein d'un espace métrique riemannien appris afin de permettre la reconstruction de programmes transcriptionnels continus et robustes au bruit, ainsi que la navigation contrôlée entre des états cellulaires distincts à partir de données de séquençage d'ARN unicellulaire éparses et non appariées.

Luonan Chen, Junchao Zhu, Zhenyi Zhang, Yuhao Sun, Hao Dai, Wen Han, Peijie Zhou2026-07-21
🧬 biology

Sex-Specific Exploration Patterns and Noradrenergic Modulation in Object Recognition Memory: Role of the Perirhinal Cortex

Cette étude démontre que la modulation noradrénergique de la mémoire de reconnaissance d'objets via les récepteurs β2-adrénergiques dans le cortex périrhinal facilite la formation de la mémoire chez les souris femelles par des mécanismes basés sur la familiarité, tandis que les mâles présentent des réponses distinctes et dépendantes du stimulus, soulignant des différences sexuelles critiques dans la base neurale de la mémoire.

Lorena Roselló-Jiménez, Raúl Pastor, Marta Miquel, Laura Font2026-07-21
🧬 biology

CD271+ Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes Promote Angiogenesis via miR-124-3p Mediated PGF Targeting

Cette étude démontre que les exosomes dérivés de cellules souches mésenchymateuses du cordon ombilical CD271+ favorisent l'angiogenèse dans l'endométriose en délivrant le miR-124-3p, qui cible et supprime directement le PGF pour améliorer la migration et la formation de tubes des cellules endothéliales.

Jing Zhu, Yujie Hang, Nianchun Shan, Chun Zhang2026-07-20