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🧬 biology

Prevotella stercorea links gut microbiome ecology to respiratory infection protection through a host-context-dependent, species-autonomous pathway

Dans une étude longitudinale menée auprès d'enfants gambiens, il est démontré que *Prevotella stercorea* protège contre les infections respiratoires aiguës par une voie autonome à l'espèce et dépendante du contexte de l'hôte, qui opère indépendamment de la richesse globale du microbiote intestinal, ses effets protecteurs et ses interactions immunitaires variant de manière significative selon l'état nutritionnel de l'enfant (WAZ).

Ogochukwu Ofordile2026-07-20
🧬 biology

Systematic benchmarking of methods to analyze RNA editing in single-cell transcriptomes

Cette étude établit un cadre systématique pour analyser l'édition de l'ARN A-vers-I dans les transcriptomes à cellule unique en évaluant diverses méthodes sur plus de 1,1 million de cellules, identifiant BCFtools avec l'annotation de brin comme le pipeline optimal, et démontrant comment ces outils révèlent des dynamiques d'édition spécifiques aux types cellulaires remodelées par des contextes pathologiques tels que le syndrome de Down et le cancer.

Meng How Tan, Yan Ting Ng2026-07-20
🧬 biology

The analysis of genetic variants in nine patients with Nemaline Myopathy: Implications for diagnosis and genetic counseling

Cette étude a analysé rétrospectivement neuf patients atteints de myopathie de Nemaline en utilisant le séquençage de l'exome entier et la bioinformatique pour identifier des variants pathogènes dans les gènes *TPM3*, *NEB* et *ACTA1*, démontrant comment l'analyse de la stabilité thermodynamique des variants faux-sens de *NEB* peut améliorer le diagnostic, le pronostic et le conseil génétique pour ce trouble génétiquement hétérogène.

Bingbo Zhou, Chuan Zhang, Xiaojuan Lin, Panpan Ma, Yupei Wang, Lei Zheng, Shengju Hao, Ling Hui, Yunfei Bai2026-07-20
🧬 biology

Z-DNA-induced genomic instability in the human pangenome

En exploitant le séquençage à lectures longues et le pangénome humain, cette étude démontre que les séquences formant de l'ADN-Z sont fortement contraintes, enrichies dans des régions répétitives auparavant non résolues, et agissent comme des moteurs significatifs d'instabilité génomique à travers un excès de petites insertions, de délétions et de variants structurels complexes.

Georgios Megalovasilis, Eleftherios Bochalis, Dionysios Chartoumpekis, Karen Vasquez, Ilias Georgakopoulos-Soares2026-07-20
🧬 biology

Nested spatial filters structure the multi-scale distribution of Varroa destructor in overwintering honey bee (Apis mellifera) colonies

En utilisant la cryofixation pour préserver les colonies d'abeilles mellifères en période d'hivernage dans un état quasi natif, cette étude révèle que la distribution multi-échelle de *Varroa destructor* est structurée par des filtres spatiaux imbriqués allant des zones au niveau de la colonie et des positions sur les cadres jusqu'aux sites d'attache abdominaux spécifiques sur les abeilles individuelles.

Minwoong Son, Heeji Kim, Dong Hee Lee, Sung-Kuk Kim, Su Jin Lee, Kyu-Won Kwak, Su-bae Kim, Kyeong Yong Lee, Bo-Sun Park2026-07-20
🧬 biology

When Simpler Models Win: A Calibration Benchmark of scGPT for Cell-Type Annotation

Cette étude démontre que les modèles d'apprentissage automatique classiques entraînés sur des ensembles de gènes appariés égalent ou surpassent systématiquement les pipelines basés sur scGPT, tant en termes de précision que de calibration statistique pour l'annotation des types cellulaires à travers six atlas de cellules uniques à grande échelle, remettant ainsi en question la supériorité supposée des grands modèles de langage pour le séquençage de cellules uniques sans bases de comparaison rigoureuses et appariées.

Alireza Khosravi, Arshia Khosravi, Kamil Langowski, Michal Sieczczynski, Krzysztof Pastuszak, Anna Supernat, Anna Zaczek2026-07-20
🧬 biology

From Home to Classroom: Gut Microbiome Trajectories and Infection Burden in Kindergarten Beginners

Cette étude longitudinale portant sur des enfants débutant la maternelle révèle que la transition vers l'école est associée à une charge infectieuse accrue et à un retard de restructuration du microbiote intestinal, caractérisé par un basculement vers une dominance des Proteobacteria et l'épuisement de *Bacteroides fragilis*, ce qui est corrélé à une plus grande sévérité des symptômes.

YunFeng Lu, YuQing Chen, XianTao Kong2026-07-20
🧬 biology

DHCR24 Regulates Endothelial Senescence through the SPHK2/SPNS2-S1P Axis

Cette étude révèle que la déficience en DHCR24 accélère la sénescence endothéliale en perturbant l'axe SPHK2/SPNS2-S1P, ce qui réduit les niveaux intracellulaires de sphingosine-1-phosphate et altère la production d'oxyde nitrique, établissant ainsi un lien métabolique critique entre la DHCR24 et le vieillissement vasculaire.

Wukaiyang Liang, Zhen Yang, Han Li, Hao Nie, Jie Huang, Tianyi Ji, Zixin Wan, Yucong Zhang, Yi Huang, Le Zhang, Lei Ruan (…)2026-07-20
🧬 biology

Effects of 12 Weeks of French Contrast Training on Lower-Limb Explosive Performance in Male Collegiate Basketball Players

Un programme de 12 semaines d'entraînement par contraste français s'est avéré plus efficace que l'entraînement de résistance traditionnel pour améliorer les mesures de performance explosive des membres inférieurs, notamment la hauteur de saut, la force réactive, la vitesse de sprint et la force de pointe, chez des joueurs de basket-ball universitaires masculins.

Xia Ding2026-07-20
🧬 biology

Integrated Proteomic and Phosphoproteomic Profiling Reveals Distinct Disease- and Age-Related Molecular Alterations in the Retina and Hippocampus of APP/PS1/MAPT Mice

Cette étude utilise le profilage protéomique et phosphoprotéomique synchronisé de souris APP/PS1/MAPT pour démontrer que la rétine présente des altérations moléculaires liées à la maladie d'Alzheimer plus précoces et plus larges que l'hippocampe, révélant des voies distinctes spécifiques aux tissus et des molécules dérégulées communes qui soutiennent la rétine en tant que fenêtre non invasive sur la pathologie cérébrale précoce.

Xi Mei, Wei Cui, Zheng Zhao, Majie Wang, Yutao Lin, Jiayi Xu, Conglong Qiu, Tingting Wu2026-07-20