🧬 Category

q-bio

1504 articles

🧬 biology

The Encoding Gauge of Fermionic Variational Quantum Algorithms: Classical Simulability is Encoding-Relative, Trainability is Invariant

Cet article établit que si la simulabilité classique des algorithmes quantiques variationnels fermioniques dépend de l'encodage et peut être optimisée via des transformations de jauge, leur entraînabilité est strictement invariante par rapport à l'encodage, impliquant qu'un véritable avantage quantique doit reposer sur des ressources indépendantes de l'encodage comme la dimension de l'algèbre de Lie et le non-stabilisabilité plutôt que sur des métriques spécifiques à l'encodage comme le poids de Pauli.

S. M. Yousuf Iqbal Tomal, Abdullah Al Shafin2026-07-21
🧬 biology

Discovery of Bioactive Triterpenoid Saponins and Antioxidant-Rich Tissues in the Endemic Cyclamen adzharicum from Adjara (Georgia)

Cette étude documente la grande diversité et l'endémisme de la flore éphéméroïde de l'Adzara, identifie *Cyclamen adzharicum* comme une espèce médicinale clé, et révèle que ses feuilles constituent une source supérieure de saponines triterpénoïdes riches en antioxydants par rapport à ses tubercules, soutenant ainsi les efforts de conservation et la recherche pharmacologique future.

Natela Varshanidze, Aleko Kalandia, Maia Vanidze, Nazi Turmanidze, Nana Zarnadze, Ketevan Dolidze, Inga Diasamidze, Eter (…)2026-07-21
🧬 biology

Extremophilic Adaptations Across the Archaeal Domain Are Governed by Lineage Clustering

Cette étude démontre que les incompatibilités apparentes entre les traits extrêmophiles archéens, tels que l'halophilie et la méthanogenèse, sont principalement des artefacts de regroupement de lignées et de pseudoréplication phylogénétique plutôt que des contraintes biochimiques intrinsèques, comme en témoigne la cooccurrence fréquente de ces adaptations dans des lignées autres que les Halobacteria lorsqu'elles sont analysées à l'aide de méthodes phylogénétiquement corrigées.

Ajay Vellanki2026-07-21
🧬 biology

GPCR mechanical pivots are packed closer to the membrane center than pivots in other polytopic membrane protein folds

Cette étude démontre que les pivots mécaniques des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG), définis par l'empilement atomique local le plus serré, sont significativement plus proches du centre de la membrane que ceux d'autres repliements de protéines membranaires polytopiques, indiquant que ce positionnement central est une caractéristique distinctive de la superfamille des RCPG plutôt qu'une propriété universelle des faisceaux transmembranaires.

Huazhang Shen2026-07-21
🧬 biology

Plastid codon evolution tracks phylogeny and reveals conserved CpG and TpA depletion in Platycerium

Cette étude démontre que l'évolution des codons plastidiaux chez *Platycerium* est conjointement façonnée par une large histoire phylogénétique et des contraintes de séquence à fine échelle, révélant spécifiquement une déplétion conservée de CpG et de TpA aux limites des codons chez dix-huit espèces.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-21
🧬 biology

MicroSC: A Tiny, Performant Single-Cell Foundation Model

Le papier présente MicroSC, une famille de modèles de fondation pour cellules uniques, minuscules et performants (1,5 M – 7,7 M de paramètres), qui atteignent une quasi-parité avec des modèles enseignants beaucoup plus grands de 51 M de paramètres comme scGPT grâce à une distillation de connaissances efficace, permettant un déploiement rapide et rentable sur du matériel informatique standard tout en démontrant que l'utilité pratique des modèles actuels de cellule unique est hautement compressible.

Olivia Denvis2026-07-21
🧬 biology

Differentiable subset binding: gradient-based cross-view itemset mining for heterogeneous data

Cet article introduit le Differentiable Subset Binding (DSB), une méthode basée sur le gradient et scalable qui surmonte les limitations combinatoires de la liaison de sous-ensembles traditionnelle basée sur Apriori pour identifier efficacement les ensembles d'articles cooccurrents maximaux à travers des vues de données hétérogènes, surpassant les bases de référence existantes tant dans les tests synthétiques que dans les applications biologiques réelles.

Yayoi Natsume-Kitatani2026-07-21
🧬 biology

Automatic clustering of self-defined groups to minimize false disease associations and maximize within-group genetic similarity

Le document présente HAPLOCLUST, une méthode de regroupement à l'échelle de la population et à contrainte de taille qui groupe les individus sur la base de la similitude génétique HLA afin de minimiser les fausses associations de maladies et de maximiser l'homogénéité intra-groupe, offrant ainsi une alternative robuste aux classifications ethniques autodéclarées pour améliorer la compatibilité de transplantation et les études génétiques.

Sapir Israeli, Martin Maiers, Sigal Manor, Bracha Zisser, Yoram Louzoun2026-07-21
🧬 biology

Generating and navigating single cell dynamics via a geodesic bridge between nonlinear transcriptional and linear latent manifolds

GeoBridge est un nouveau cadre qui modélise la dynamique cellulaire sous forme de trajectoires géodésiques au sein d'un espace métrique riemannien appris afin de permettre la reconstruction de programmes transcriptionnels continus et robustes au bruit, ainsi que la navigation contrôlée entre des états cellulaires distincts à partir de données de séquençage d'ARN unicellulaire éparses et non appariées.

Luonan Chen, Junchao Zhu, Zhenyi Zhang, Yuhao Sun, Hao Dai, Wen Han, Peijie Zhou2026-07-21