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Comparative plastome genomics reveals phylogeny, biogeography, and character evolution of Primula (Primulaceae)

Cette étude utilise une analyse phylogénomique complète basée sur le plastome de 106 espèces de *Primula* pour résoudre des ambiguïtés taxonomiques de longue date, révélant que la diversification du genre a été pilotée par des événements géologiques et climatiques du Miocène au Pliocène sur le plateau Qinghai-Tibet, tandis que son trait reproductif clé, l'homostylie, a évolué indépendamment au moins huit fois comme une adaptation à la rareté des pollinisateurs en haute altitude.

Wan Tang, Shu-Bao Wang, Shi-Dong Wang, Rui Li, Kai-Yun Chen, Yuan Huang, Jia-Hui Chen2026-06-24

🧬 biology

A Predictive, Cumulative Framework for Multivalent Transcription Factor Specificity

Cette étude établit un cadre prédictif, fondé sur la biophysique, démontrant que le mode d'assemblage des facteurs de transcription multivalents — allant de la séparation de phase flexible à l'oligomérisation rigide — détermine si la spécificité génomique est régie par la densité cumulative de sites faibles ou par un espacement géométrique strict, redéfinissant ainsi la manière dont les séquences répétitives endogènes régulent l'expression génique.

Bing Li, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Wanli Yang, Yuqian Feng, Xiang Xu, Siang Lv, Mingqian Hu, Qi Zhang, Ningzhe Li, Mengy (…)2026-06-24

🧬 biology

CORA: a COrrelation-Redundancy-Aware FDR adjustment with genomic applications

CORA est une nouvelle méthode d'ajustement du FDR qui améliore la parcimonie de l'analyse de l'expression différentielle en incorporant les corrélations de paires de gènes dans le seuil de Benjamini-Hochberg afin de pénaliser les découvertes redondantes sans sacrifier la puissance statistique.

Joanna Zyprych-Walczak2026-06-24

🧬 biology

Structure-Guided Design of Therapeutic Antibodies Targeting SARS-CoV-2 Omicron Variants

Cette étude démontre qu'une stratégie de conception computationnelle guidée par la structure a permis d'optimiser avec succès l'anticorps COV2-2196 afin de restaurer et d'améliorer sa puissance de neutralisation contre les variants Omicron du SARS-CoV-2, offrant ainsi un cadre pratique pour le développement rapide de thérapeutiques largement efficaces contre les souches virales évolutives.

Jesper Pallesen, Jianqiu Du, Yuanhan Wu, Sukanya Ghosh, Kelly Bayruns, Roopak Sadeesh, David Weiner2026-06-24

🧬 biology

A simple mathematical model for the discontinuity in average nucleotide identity distributions in prokaryotes

Cet article présente un modèle mathématique de champ moyen simplifié démontrant comment l'interaction entre la mutation, la recombinaison homologue et le déclin de l'efficacité de la recombinaison avec la divergence de séquence façonne la taille, l'espacement et la position du fossé d'identité nucléotidique moyenne (ANI) qui définit les limites des espèces procaryotes.

Sebastian Silva-Solar, Rudolf Amann, Tomeu Viver, Ramon Rossello-Mora, Javier Santibañez-Molina, Luis Miguel Rodriguez (…)2026-06-24

🧬 biology

Estrogen-related receptor alpha (ERRα) promotes gastrointestinal stromal tumor progression and epithelial-mesenchymal transition through Wnt/β-catenin

Cette étude démontre que le récepteur lié à l'œstrogène alpha (ERRα) stimule la progression des tumeurs stromales gastro-intestinales (GIST) et la transition épithélio-mésenchymateuse en activant la voie de signalisation Wnt/β-caténine, suggérant l'inhibition d'ERRα comme une stratégie thérapeutique prometteuse.

Ronald DeMatteo, Taylor Hartlein, Shan Zeng, Ferdinand Rossi, Montana Morris, Jonathan Sussman, Michael Beckman, Iulia B (…)2026-06-24

🧬 biology

Assessing Latent Heterogeneity in Breast Cancer Survival: A Frailty Model Approach Using METABRIC Data

En utilisant les données de la cohorte METABRIC, cette étude confirme la valeur pronostique des sous-types PAM50 pour la récidive du cancer du sein tout en démontrant, par une modélisation de fragilité partagée, que l'hétérogénéité latente non mesurée au sein de ces sous-types est minimale.

Sherif Mohammed, Leonard Kyei, Francis Okyere, Francis Amuyao2026-06-24

🧬 biology

Using cryopreserved coral sperm for larval production at a restoration-relevant scale

Cette étude démontre que les spermatozoïdes de corail cryopréservés peuvent être utilisés pour produire des larves à des échelles pertinentes pour la restauration (jusqu'à 960 000 par litre) avec un succès de fertilisation et une survie des recrues comparables à ceux du sperme frais, permettant ainsi l'utilisation à grande échelle de ressources génétiques biobankées pour la restauration des récifs.

Jonathan Daly, Rebecca Hobbs, F. Mikaela Nordborg, Andrea Severati, Line Bay, Justine O'Brien2026-06-24

🧬 biology

Implied Motion as a Mechanism for Spontaneous Belief Computation in Humans

Cette étude démontre que le cerveau humain calcule spontanément les croyances d'autrui en les encodant comme un mouvement impliqué de l'agent vers l'objet, un mécanisme soutenu par des preuves d'EEG intracrânien montrant un traitement neural partagé dans la jonction temporo-pariétale pour le suivi des croyances et le flux visuel.

Patricia Christian, James Cahill, Adeline Fecker, Martha Paskin, Ronja Löfström, Zane Zook, Ahmed Raslan, Kelly Collins (…)2026-06-24

🧬 biology

The human limbus functions as an instructive epithelial transition zone

Cette étude redéfinit le limbe humain adulte comme une zone de transition instructive et dynamique plutôt que comme une barrière de lignage rigide, démontrant que les progéniteurs limbiques bipotents déterminent le destin cornéen ou conjonctival via un commutateur moléculaire régi par la signalisation KGF et EGF.

Natasha Frank, Yuzuru Sasamoto, Yoshiko Fukuda, Catherine Lee, Shuoshuo Wang, Sheethal Umesh, Shinri Sato, Kosei Suzuki (…)2026-06-24

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