🧬 biology

MiShape: 3D Mitochondrial Shape Modelling for Fluorescence Microscopy

MiShape est un nouveau cadre qui exploite un a priori de forme 3D appris, dérivé de la microscopie électronique à haute résolution, pour reconstruire avec précision la morphologie mitochondriale 3D à partir d'images uniques de microscopie de fluorescence 2D, surpassant les méthodes existantes en termes de métriques de géométrie et de topologie.

Abhinanda Punnakkal, Suyog Jadhav, Biswajoy Ghosh, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad2026-07-17
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Benchmarking Classical, Hybrid, and Quantum Annealing Workflows on a Structured Control QUBO

Cet article évalue les flux de travail de recuit classique, hybride et quantique sur un QUBO de contrôle binaire structuré dérivé de la planification des chauffages de serres, constatant que, bien que les méthodes classiques et quantiques simulées produisent systématiquement des solutions quasi optimales, le matériel quantique actuel et les solveurs hybrides ne démontrent pas encore d'avantage de performance par rapport aux références classiques.

Hamze Alavirad, Maryam Bahrami Zanjani2026-07-17
🧬 biology

Ecological constraints to mirror life

Cet article présente un cadre théorique démontrant que les formes de vie en miroir, malgré leur faisabilité moléculaire, feraient probablement face à de sévères contraintes écologiques et échoueraient à s'établir dans les écosystèmes naturels en raison de l'incompatibilité des nutriments et de l'exclusion compétitive par le biote existant.

ricard Solé, Jordi Pla-Mauri, Victor Maull, Andrea Tabi, Yelyzaveta Shpilkina, Victor de Lorenzo2026-07-17
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Case report on Variations of the Musculocutaneous Nerve

Ce rapport de cas documente trois variations anatomiques distinctes du nerf musculocutané observées dans un laboratoire d'anatomie, incluant deux cas de son absence complète avec une compensation fonctionnelle par le nerf médian et un cas de fusion avec le nerf médian après avoir innervé le coracobrachial, lesquels présentent tous des implications cliniques significatives pour le diagnostic des déficits sensoriels et moteurs du membre supérieur.

Bala Gayathri Sekar, Shakeeba Mustaan, Ayesha Iqbal, Adel Mohammed2026-07-17
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Cross-species ncRNA annotation using synteny-constrained embedding similarity

L'article présente CURIA, un nouveau pipeline qui combine l'alignement de génomes contraint par la synténie avec les plongements du modèle de fondation d'ARN RiNALMo afin d'améliorer l'annotation des ARN non codants interspécifiques en identifiant des régions localisées soutenues par les plongements qui complètent les mesures conventionnelles de conservation de séquence.

Bogdan M. Kirilenko2026-07-17
🧬 biology

A single-cell atlas of cancer-educated ecotypes across high-risk pediatric sarcomas

Cette étude présente un atlas complet, à l'échelle de la cellule unique et de l'espace, du microenvironnement tumoral à travers les sarcomes pédiatriques à haut risque, définissant des états cellulaires distincts et douze archétypes de microenvironnement tumoral afin de révéler des niches multicellulaires conservées et spécifiques à chaque entité qui fournissent un cadre pour le développement d'immunothérapies rationnelles.

Christian Seitz, Karla Catacora Castañeda, Sophia Scheuermann, Tom Fischer, Fabienne Engelmann, Anke King, Roland Imle (…)2026-07-17
🧬 biology

Unmasking the Black Box: Computational Evidence Identifying Mitochondrial ATP Synthase Subunit β as a High-Confidence Target of Glycyrrhetinic Acid Analogs Against Brugia malayi

Cette étude emploie un criblage par amarrage moléculaire inverse à l'échelle du protéome contre des modèles AlphaFold2 de haute confiance afin d'identifier la sous-unité β de l'ATP synthase mitochondriale comme une cible moléculaire de haute confiance et structurellement plausible de l'analogue de l'acide glycyrrhétinique 6a, un puissant macrofilaricide chez *Brugia malayi*, fournissant ainsi une preuve computationnelle qui comble l'écart entre son efficacité observée et son mécanisme d'action jusqu'alors inconnu.

kshitij dubey2026-07-17
🧬 biology

Diel variation in diving behaviour of rehabilitated grey seal juveniles (Halichoerus grypus) in the Baltic Sea

Cette étude démontre que les jeunes phoques gris de la Baltique réhabilités s'adaptent rapidement aux conditions locales en présentant des modes de plongée diurnes distincts, caractérisés par des plongées diurnes plus profondes et plus courtes et des plongées nocturnes plus superficielles et plus longues, ce qui suggère un ajustement comportemental post-relâcherie réussi à la distribution des proies.

Laura Kuncienė, Ursula Siebert, Žilvinas Kleiva, Dominik Nachtsheim2026-07-17
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PolySUMOylation restrains ubiquitination to protect fragile genomic loci during replication stress in fission yeast

Cette étude démontre que chez la levure fission, la polySUMOylation protège l'ADN ribosomal fragile lors du stress de réplication en inhibant la polyubiquitination liée à K63 du facteur de recombinaison homologue Rad52, empêchant ainsi son accumulation aberrante et l'instabilité génomique.

Karol Kramarz, Dorota Misiorna, Aleksandra Bogdańska, Katarzyna Markowska, Paulina Tomaszewska, Michal Tracz, Ireneusz L (…)2026-07-17
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CRISPRi loss-of-function mutations revealed through experimental evolution in Burkholderia cenocepacia

Par l'évolution expérimentale de mutants CRISPRi de *Burkholderia cenocepacia*, des chercheurs ont identifié que la réversion phénotypique vers le type sauvage de la croissance était causée par des défauts de l'absorption du rhamnose entraînant la perte de l'expression de dCas9, plutôt que par des mutations dans la machinerie CRISPRi elle-même.

Zayra Batun, Erick E. Arroyo-Pérez, A. S.M. Zisanur Rahman, Marike Palmer, Andrew M. Hogan, Sion Yi, Yves V. Brun, Silvi (…)2026-07-17