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HiFi-ST: High-Fidelity Reconstruction of Continuous Spatial Transcriptomic Expression Fields via Conditional Neural Fields

HiFi-ST introduit un cadre de champ neural conditionnel qui reconstruit des champs d'expression transcriptomique spatiale continus en modélisant les spots comme des observations régionales et en intégrant des caractéristiques tissulaires multi-échelles, surpassant ainsi de manière significative les méthodes existantes en termes de précision et permettant des analyses en aval avancées telles que la caractérisation du microenvironnement tumoral.

Lei Tang, Wenshuai Han, Xiao Yang, Xiaozhou Chen, Huamei Li2026-07-16

🧬 biology

MaEIN2 links ethylene signaling to chlorogenic acid accumulation in mulberry leaves in response to silkworm-feeding

Cette étude démontre que le composant de signalisation de l'éthylène MaEIN2 médie l'accumulation d'acide chlorogénique induite par l'herbivorie dans les feuilles de mûrier, liant ainsi les indices de l'alimentation des vers à soie à une défense accrue de la plante et soutenant potentiellement le développement des vers à soie.

Peihong Liu, Qingxin Yao, Guang Yang, Nan Chao, Mengqi Li, Hongyan Lin, Rongjun Fang, Li Liu2026-07-16

🧬 biology

Optimized Gradient Boosting Decision Tree Ensembles for Honeybee Toxicity Prediction Using the ApisTox Dataset

Cette étude démontre qu'un ensemble d'arbres de décision de boosting de gradient optimisé, enrichi de méta-caractéristiques spécifiques au domaine et de représentations moléculaires, améliore significativement la précision de la prédiction de la toxicité pour les abeilles mellifères sur l'ensemble de données ApisTox par rapport aux références existantes.

Sedat GOLGİYAZ2026-07-16

🧬 biology

Global evolutionary pattern and distinct metabolic strategies of sulfur-cycling microorganisms across ecosystems

Cette étude introduit DiSuCy, une base de connaissances organisée de gènes du métabolisme du soufre, afin de révéler la dynamique évolutive et les stratégies métaboliques distinctes des micro-organismes cyclant le soufre à travers divers écosystèmes, incluant l'identification de nouveaux taxons et de voies non canoniques dans l'océan et l'intestin humain.

Song-Can Chen, Tomohisa Tanabe, Chengliang Sun, Jing-Ling Yan, Xin-Yue Ren, Alexander Loy2026-07-16

🧬 biology

Seasonal Dynamics of Microbial Communities, Co-occurrence Networks, and Grazing-Mediated Carbon Flow Characteristics

Cette étude révèle que les fluctuations environnementales saisonnières dans la baie de Dinghai entraînent des décalages parallèles dans la composition des communautés microbiennes, les processus d'assemblage et la structure des réseaux, tout en modifiant simultanément l'efficacité du flux de carbone médié par le broutage à partir du phytoplancton et du bactérioplancton, le phytoplancton servant systématiquement de source de carbone dominante.

Guoqiang Shen, Qianqian Liu, Peng Xiao, Lianming Zheng, Chengxu Zhou, Zhongzhou Lin, Zhuoyi Zhu, Wenjing Zhang2026-07-16

🧬 biology

WATER: A Framework for Reconstructing Temporal Gene Expression Trajectories and Detecting Molecular Heterochrony Across Development and Disease

L'article introduit WATER, un cadre de calcul qui reconstruit des trajectoires d'expression génique temporelles indépendantes pour détecter l'hétérochronie moléculaire (un décalage temporel de l'expression génique) à travers des contextes de développement et de maladie, révélant une réorganisation transcriptionnelle généralisée que les comparaisons traditionnelles par appariement de stades ignorent.

Rahul Kanadia, Saren Springer, Kevon Afriyie, Abigail Boria, Isabella Stevens, Katarina Micin, Vanessa Aguiar-Pulido2026-07-16

🧬 biology

The organizing unit of GPCR activation-switch architecture: a phylogenetic-scale census

Cette étude révèle que l'architecture de l'interrupteur d'activation des RCPG n'est pas organisée par l'identité du ligand, mais par un réseau structurel coévolué impliquant le verrou ionique, la Tyr5.58 et les résidus de la poche de sodium, lequel utilise divers mécanismes spécifiques à chaque lignée pour stabiliser l'arginine DRY conservée.

Huazhang Shen2026-07-16

🧬 biology

Integrated carrying capacity: A holistic approach towards population target setting for conflict-prone threatened wildlife

Cette étude propose un cadre de capacité de charge intégré combinant les dimensions écologiques, biologiques et sociales afin d'établir des cibles de population fondées sur des données probantes et spécifiques au contexte pour les espèces menacées sujettes aux conflits, en utilisant les éléphants d'Asie sauvages de Chine dans le Yunnan comme étude de cas pour préconiser la priorité accordée à la tolérance humaine et l'alignement des politiques d'utilisation des terres avec les objectifs de conservation.

Hao Gu2026-07-16

🧬 biology

A multi-tissue transcriptome and expression atlas of Astacus leptodactylus: assembly and annotation

Cette étude présente un atlas de haute qualité du transcriptome et de l'expression multi-tissus de l'écrevisse à griffe étroite *Astacus leptodactylus*, assemblé à partir de 37 échantillons d'ARN-seq et validé pour sa complétude fonctionnelle, établissant ainsi une ressource fondamentale pour la recherche sur les canaux ioniques et la génomique fonctionnelle chez les crustacés non modèles.

Berk Sağlam, Mehmet Akgun, Bora Ergin, Nuhan Purali2026-07-16

🧬 biology

A mechanistic framework for interspecific variation in vertebrate developmental radiosensitivity under chronic ionizing radiation

Cette étude propose un cadre mécaniste unifié expliquant la variation interspécifique de la radiosensibilité développementale des vertébrés sous irradiation ionisante chronique en intégrant des facteurs tels que la bioaccumulation de radionucléides, le taux métabolique, le blindage anatomique et la dynamique proliférative, sur la base d'une synthèse structurée de 20 études expérimentales et 9 articles.

Bogdan Dmirtievitch2026-07-16

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