🧬 biology

Analysis of a Spatio-temporal Harvested Prey-Predator Model and a Machine Learning Framework for Prediction of Pattern Regimes with Demonstration on the Model

Cet article étudie la dynamique spatio-temporelle d'un modèle proie-prédateur avec récolte et réponse fonctionnelle de type Holling II par l'analyse de stabilité analytique et de bifurcation, tout en développant et en validant simultanément un cadre d'apprentissage automatique hybride CNN-Forêt Aléatoire pour prédire les régimes de motifs et construire des diagrammes de transition à travers un espace à deux paramètres.

Ankur Paul, Amrit Bose, Uttam Ghosh2026-07-14
🧬 biology

Language-Grounded Drug Representations for Cold-Start Drug–Drug Interaction Prediction

Cet article propose un cadre multimodal qui fusionne les représentations de réseaux de neurones sur graphes des structures de médicaments avec des plongements sémantiques issus de modèles de langage biomédicaux afin de prédire efficacement les interactions médicamenteuses pour de nouveaux médicaments non vus dans des scénarios de démarrage à froid où les modèles traditionnels basés uniquement sur la structure échouent.

Aaron Ajit2026-07-14
🧬 biology

Candidate Homologs of REST-Associated Chromatin Regulatory Components in Choanoflagellates

Cette étude identifie des homologues candidats de composants clés de la régulation de la chromatine impliqués dans la répression associée à REST chez les animaux au sein des choanoflagellés, suggérant que bien que les familles de protéines individuelles soient antérieures aux animaux, leur intégration dans une voie fonctionnelle de type REST reste non confirmée.

Ajay B. Vellanki2026-07-14
🧬 biology

Afadin Loss Uncovers an Ectopic Neurogenic Niche and Reorganizes the Adult Ventricular-Subventricular Zone

Cette étude démontre que la perte développementale de la protéine de jonction adhérente Afadine réorganise le cerveau adulte en induisant une niche neurogénique ectopique et stable dans le néocortex et en perturbant la zone ventriculaire-sous-ventriculaire canonique, révélant ainsi la profonde plasticité des cellules souches neurales en réponse aux défauts d'adhésion.

Cristina Gil-Sanz, Isabel Mateos-White, Alba Marín-Garnes, Laura Veintimilla-Escot, Jaime Fabra-Beser, Laura Lázaro-Caro (…)2026-07-14
🧬 biology

Phytochemical Screening and Comparative Antimicrobial Activity of Phyllanthus niruri L. (Phyllanthaceae) against Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Candida albicans

Cette étude valide l'usage ethnomédicinal de *Phyllanthus niruri* L. du Mozambique en démontrant que son extrait de feuilles, riche en phénols, flavonoïdes et tannins, présente une activité antifongique puissante et dose-dépendante contre *Candida albicans* et *Staphylococcus aureus* (avec des CMI de 12,5 mg/mL), surpassant le fluconazole à des concentrations plus élevées, tout en ne montrant aucune efficacité contre *Escherichia coli*.

Isidora Jorge, Gisela Guibunda, Jorge Amade, Porfirio Rosa, Jaime Diogo, Geraldo Hodela, Alfredo Dique, Lázaro Cuinica (…)2026-07-14
🧬 biology

Rethinking Model Selection in Choice Behavior

Cet article plaide pour un déplacement de l'attention de la sélection de modèles de comportement de choix, passant de l'identification d'une formulation unique « correcte » à l'évaluation de la manière dont différents modèles capturent des composantes environnementales distinctes et manipulables, préconisant l'utilisation de méthodes d'ensemble telles que la moyenne de modèles bayésiens et le stacking pour intégrer ces structures complémentaires afin d'améliorer la prédiction et le contrôle. Naoki Kamiya, qui était affilié à l'Institut de mathématiques statistiques lorsque les travaux rapportés dans le manuscrit ont été réalisés et qui mène désormais des recherches via le Relations & Behavior Lab à Tokyo, Japon.

Naoki Kamiya2026-07-14
🧬 biology

Structure-Based Design of RNA Aptamers Targeting the Oncogenic KRAS G12D Variant

Cette étude emploie une approche in silico complète pour identifier et caractériser l'ARN-106, un aptamère d'ARN stable qui se lie sélectivement et inhibe le variant oncogénique KRAS G12D par des interactions spécifiques avec ses domaines Switch I et II, offrant ainsi une base prometteuse pour le développement de thérapies à base d'ARN contre les cancers induits par KRAS.

Hammam T. Elghazzaly, Mohamed H. Abuseif, Abdelkader Ammar. KW, Hassan A. Sahloul, Majdeldin E. Abdelgilil2026-07-14
🧬 biology

Brain Activity Related to Cheating Identification: A Step Towards the Study of Corruption

Cette étude a utilisé un paradigme d'IRMf avec des scénarios INDETRAE pour démontrer que différentes circonstances de tricherie suscitent des signatures neurales distinctes à travers les réseaux de mentalisation, de contrôle exécutif et de récompense, validant ainsi le paradigme pour l'étude des substrats neuraux de la corruption.

Víctor E. Olalde-Mathieu, Daniel Atilano-Barbosa, Giovanna L. Licea-Haquet, Jonatan García-Campos, Fernando A. Barrios (…)2026-07-14
🧬 biology

Chromosome-level reference genome assemblies of five Brassicaceae species inhabiting challenging ultramafic substrates

Cette étude présente des assemblages de génomes de haute qualité, au niveau chromosomique, pour cinq espèces de Brassicaceae des Balkans adaptées aux substrats ultramafiques, utilisant les technologies PacBio HiFi et Hi-C afin de fournir des ressources fondamentales pour la génomique comparative et la recherche sur l'adaptation évolutive dans ce hotspot de biodiversité sous-étudié.

Mahnaz Nezamivand-Chegini, Miloš Duchoslav, Raúl Wijfjes, Gabriela Šrámková, Jana Nosková, Vít Bureš, Tereza Koberová, T (…)2026-07-14
🧬 biology

Metastasis-associated DNA methylation alterations persist after accounting for immune and stromal cell heterogeneity in primary colorectal tumors

Cette étude identifie des altérations distinctes de la méthylation de l'ADN associées à la progression métastatique dans les tumeurs colorectales primaires qui persistent après avoir pris en compte l'hétérogénéité des cellules immunitaires et stromales, révélant des signatures épigénétiques spécifiques liées au silençage génique et de potentiels biomarqueurs de risque métastatique.

Alos B. Diallo, Sabin D. Hart, John P. Zavras, Scott M. Palisoul, Fred W. Kolling, Louis J. Vaickus, Jiaoyuan E. Sun, Lu (…)2026-07-14