316 पेपर
यह अध्ययन तीन *Dysgonomonas gadei* GH172 अरबिनोफ्यूरानोसिडेस की विशिष्ट लिंकेज विशिष्टताओं और विविध चतुर्थ संरचनाओं (quaternary structures) को अभिलक्षित करता है, साथ ही सहसंयोजक अवरोधकों (covalent inhibitors) और गतिविधि-आधारित जांचों (activity-based probes) को विकसित करता है जो उनकी उत्प्रेरक तंत्रों को प्रकट करते हैं और जटिल जैविक नमूनों में चयनात्मक प्रोफाइलिंग को सक्षम करते हैं।
रेसेमिज़ेशन (racemization) की समस्याओं को दूर करने के लिए स्टीरियोसेलेक्टिव कीमोएंजाइमेटिक संश्लेषण का उपयोग करते हुए, शोधकर्ताओं ने विशिष्ट 2,5-डाइकीटोपाइपरज़ीन स्टीरियोआइसोमर्स की पहचान की जो mTORC1 दमन से स्वतंत्र तंत्र के माध्यम से Caco-2 कोशिकाओं में ऑटोफैगी को प्रभावी ढंग से प्रेरित करते हैं, जो उनकी गतिविधि में स्टीरियोकेमिस्ट्री और अमीनो एसिड साइड-चेन गुणों की महत्वपूर्ण भूमिका को रेखांकित करता है।
यह शोध पत्र पेप्टरजेंट्स (Peptergents) को प्रस्तुत करता है, जो एक पेप्टाइड-आधारित सर्फेक्टेंट तकनीक है जो नेटिव मेम्ब्रेन प्रोटिओमिक्स के लिए एक पूर्ण डिटर्जेंट-मुक्त वर्कफ़्लो को सक्षम बनाती है, जो डाउनस्ट्रीम LC-MS/MS विश्लेषण के लिए पेप्टाइड सिग्नल तीव्रता को बढ़ाने और विशिष्ट मेटाबॉलिक नेटवर्क को समृद्ध करने के साथ-साथ मेम्ब्रेन प्रोटीन की संरचनात्मक अखंडता, कार्यात्मक विन्यास और नाजुक असेंबली को सफलतापूर्वक संरक्षित करती है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि यीस्ट वैक्यूोलर PI(3,4,5)P3, जो Vps34 द्वारा संश्लेषित होता है, वर्टेक्स असेंबली को समन्वित करने और ट्रांस-SNARE पेयरिंग को सुगम बनाने के लिए SNARE प्रोटीन Vam7 को बनाए रखने द्वारा वैक्यूओल फ्यूजन के लिए आवश्यक है।
यह अध्ययन जैव सूचनात्मक (bioinformatic), गतिज (kinetic) और संरचनात्मक विश्लेषणों के संयोजन के माध्यम से *Clostridium pasteurianum* में एक पूर्व अनोटेटेड बीजाणु निर्माण-संबद्ध प्रोटीन को एक कार्यात्मक फेरेडॉक्सिन-NADP+ रिडक्टेस के रूप में पहचानता और अभिलक्षणित करता है, जो इसकी अद्वितीय संरचनात्मक विशेषताओं, निम्न उत्प्रेरक दक्षता और एंडोस्पोर निर्माण के दौरान रेडॉक्स विनियमन में इसकी संभावित भूमिका को प्रकट करता है।
यह अध्ययन उस संरचनात्मक तंत्र को प्रकट करता है जिसके द्वारा रुबिकॉन (Rubicon), BECN1 BARA डोमेन में एक UVRAG-प्रेरित संरचनात्मक परिवर्तन के माध्यम से PI3KC3-C2 कॉम्प्लेक्स को चयनात्मक रूप से बाधित करता है, यह प्रदर्शित करते हुए कि इस विशिष्ट अंतःक्रिया को बाधित करना ऑटोफैगी और लाइसोसोमल कार्य को रुबिकॉन जीन विलोपन के स्तर के तुलनीय स्तर तक बहाल करने के लिए पर्याप्त है।
यह शोध पत्र GROMACS 2025.4 में गॉसियन एक्सेलेरेटेड मॉलिक्यूलर डायनेमिक्स (GaMD) के पहले GPU-सक्षम कार्यान्वयन को प्रस्तुत करता है, जो चार बेंचमार्क प्रणालियों में सफल मुक्त-ऊर्जा रिकवरी के माध्यम से प्रोटीन फोल्डिंग और लिगैंड बाइंडिंग के उन्नत सैंपलिंग के लिए इसकी प्रभावशीलता को प्रदर्शित करता है, जिसके लिए पूर्व-निर्धारित कलेक्टिव वेरिएबल्स की आवश्यकता नहीं है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्रेरणीय (inducible) प्रणालियों की तुलना में सुदृढ़ सह-दमनकारी (co-repressible) ट्रांसक्रिप्शनल प्रणालियों को इंजीनियर करने में कठिनाई, एलोस्टेरिक मुक्त-ऊर्जा परिदृश्यों (allosteric free-energy landscapes) पर मौलिक ऊष्मागतिक बाधाओं से उत्पन्न होती है, जो यह सुझाव देता है कि प्राकृतिक सह-दमनकारी स्कैफोल्ड्स जैसे कि PurR, लिगैंड-सक्रिय नियामकों को बनाने के लिए बेहतर आधार प्रदान करते हैं।
यह अध्ययन *Schistosoma mansoni* के STIM और ORAI प्रोटीनों के कार्यात्मक तंत्रों को अभिलक्षित करता है, जो कैल्शियम सिग्नलिंग में उनकी संरक्षित भूमिकाओं को प्रदर्शित करते हुए मानव ऑर्थोलॉग्स से विशिष्ट संरचनात्मक और औषधीय अंतरों की पहचान करता है जिन्हें चयनात्मक चिकित्सीय लक्ष्यीकरण के लिए लक्षित किया जा सकता है।
यह अध्ययन नैनोपायलट (NanoPilot) को पेश करता है, जो एक मॉड्यूलर फ्यूजन प्रोटीन प्लेटफॉर्म है जो जेनेटिक थेरेपी के कुशल, कोशिका-विशिष्ट एक्स्ट्राहेपेटिक (extrahepatic) वितरण को सक्षम करने के लिए लिपिड नैनोकणों के ApoE-मध्यस्थता वाले लिवर अपटेक को प्रतिस्पर्धी रूप से बाधित करता है।