🧬 Category

q-bio

5411 पेपर

🧬 जीव विज्ञान

Cross-Platform Evaluation of Long-Read Sequencing for DNA Methylation and Portability of Methylation Predictors

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि जबकि लॉन्ग-रीड सीक्वेंसिंग प्रौद्योगिकियां (ONT और PacBio) व्यापक मिथिलोम कवरेज प्रदान करती हैं और बड़े पैमाने के मिथाइलेशन प्रेडिक्टर्स की पोर्टेबिलिटी का समर्थन करती हैं, बढ़ी हुई सीक्वेंसिंग गहराई, अंशांकन (कैलिब्रेशन) और प्लेटफॉर्म-विशिष्ट सत्यापन के बिना, व्यक्तिगत CpG साइटों पर उनकी वर्तमान क्रॉस-प्लेटफॉर्म सहमति इलुमिना EPIC एरे के प्रत्यक्ष प्रतिस्थापन के लिए अपर्याप्त बनी हुई है।

Zongli Xu, John S. House, Joseph Breeyear, David C. Fargo, Charles P. Schmitt, Lawrence S. Kirschner, Trevor K. Archer (…)2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Divergent PML and Nucleolar Body Programs Distinguish Protected from Vulnerable Neurons in FTLD-TDP

यह अध्ययन प्रकट करता है कि FTLD-TDP में, न्यूरॉन्स दो भिन्न नाभिकीय पिंड पुनर्गठन कार्यक्रमों (nuclear body remodeling programs) का प्रदर्शन करते हैं—जहाँ सुरक्षात्मक SUMO1 नाभिकिकीय संचय (nucleolar accumulation) और PML-नाभिकीय संपर्क TDP-43 के प्रतिधारण (retention) से जुड़े होते हैं, जबकि प्रगतिशील PML नाभिकीय झिल्ली संपर्क और मैक्रो-PML पिंड TDP-43 की रिक्ति (depletion) को संचालित करते हैं—इस प्रकार चरण-पृथक्त गुणवत्ता नियंत्रण कंपार्टमेंट्स (phase-separated quality control compartments) को न्यूरोनल भेद्यता के प्रमुख निर्धारकों के रूप में पहचानते हैं।

Oseas Medina, Alissa Nana Li, Lily Talley, Stephanie E. Gaus, Joel H. Kramer, Jennifer S. Yokoyama, Howard J. Rosen, Mar (…)2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Anti-defense systems of viral communities vary with genomic traits, host immunity and environmental stress

यह अध्ययन प्रकट करता है कि वायरल एंटी-डिफेंस सिस्टम रिपर्टोइरी जीनोमिक बाधाओं, होस्ट इम्यून लैंडस्केप और पर्यावरणीय तनावों के एक जटिल परस्पर प्रभाव द्वारा आकार लेती हैं, जिससे वायरस-होस्ट इंटरैक्शन और सूक्ष्मजीव समुदायों के अनुकूलन विकास (एडेप्टिव इवोल्यूशन) प्रभावित होते हैं।

Dan Huang, Yiyan Yang, Ruonan Wu, Jose Luis Balcazar, Pedro J.J. Alvarez, Jizhong Zhou, Pingfeng Yu2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Screening bacterial isolates: Psychrobacter sp. metabolite for wastewater treatment

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि सौर पैनलों से अलग किए गए *Psychrobacter* sp. से प्राप्त एक बायोफ्लोकुलेंट, एरोबिक और एनारोबिक स्लज दोनों में उच्च फ्लोकुलेशन दक्षता प्राप्त करते हुए, सीवेज स्लज डीवाटरिंग को बढ़ाने के लिए सिंथेटिक पॉलिमर के एक प्रभावी और पर्यावरण के अनुकूल विकल्प के रूप में कार्य करता है।

Letícia Portugal do Nascimento, Maura de Almeida Bueno, Mariana Amaral Azevedo, Iolanda Cristina Silveira Duarte2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Beyond the Single Vessel: A Reproducible Comparative Analysis of Alpha Diversity Across Ex Vivo Gut Microbiota Platforms

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मल्टी-स्टेज SHIME प्लेटफॉर्म, सिंगल-स्टेज मिनी चेमोस्टेट एरेज़ की तुलना में एक्स विवो स्थिरीकरण के दौरान गट माइक्रोबायोटा अल्फा विविधता को बेहतर ढंग से संरक्षित करते हैं, जो सामुदायिक संरचना पर बायोरिएक्टर आर्किटेक्चर के महत्वपूर्ण प्रभाव को उजागर करते हुए क्रॉस-स्टडी तुलनाओं के लिए एक पुनरुत्पादक पाइपलाइन स्थापित करता है।

Ismael Muriuki Akala2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Mode-resolved Feedback Gain Controls Spatial Symmetry Breaking in an Explicit Notch-Delta-Proneural Circuit

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एक त्रिकोणीय जाली (triangular lattice) पर एक स्पष्ट नॉच-डेल्टा-प्रोन्यूरल सर्किट में, स्थानिक समरूपता भंग (spatial symmetry breaking) मुख्य रूप से कपलिंग स्ट्रेंथ के बजाय डाउनस्ट्रीम नॉच और प्रोन्यूरल काइनेटिक्स द्वारा नियंत्रित होती है, जिसमें मोड-रिज़ॉल्व्ड फीडबैक विश्लेषण यह प्रकट करता है कि ऊतक ज्यामिति और जैव रासायनिक विनियमन द्वारा संचालित एक विशिष्ट तीन-सबलैटिस अस्थिरता, सेंडर/रिसीवर सिग्नलिंग पैटर्न के निर्माण को निर्धारित करती है।

Hyeonje Yang2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Structure-guided prioritization of divergent virulence and resistance candidates in an open pangenome clinical Escherichia coli isolate

यह अध्ययन एक एकीकृत, संरचना-निर्देशित कम्प्यूटेशनल पाइपलाइन प्रस्तुत करता है जिसने पैनजीनोमिक फ़िल्टरिंग, प्रोटीन लैंग्वेज मॉडल, संरचनात्मक भविष्यवाणी और आणविक गतिशीलता सिमुलेशन को जोड़कर, एक मल्टीड्रग-रेसिस्टेंट *एस्चेरिचिया कोली* आइसोलेट के ओपन पैनजीनोम से चार विविध विरुलेंस और एंटीमाइक्रोबियल प्रतिरोध उम्मीदवारों को सफलतापूर्वक प्राथमिकता दी है।

Sarra Benmoumou-Hosni, Atika Mekla, Ikram Haleche2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

General anesthesia reorganizes cortical morphological networks

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्रोपोफोल या सेवोफ्लुरेन के साथ सामान्य एनेस्थीसिया, ट्रांसमोडल कॉर्टेक्स में कम अंतर-क्षेत्रीय समानता और नोडल दक्षता के साथ-साथ परिवर्तित निर्देशित निर्भरताओं द्वारा चिह्नित, कॉर्टिकल रूपात्मक नेटवर्क के एक समन्वित, प्रतिवर्ती पुनर्गठन को प्रेरित करता है, जो डोपामाइन और मोनोअमीन ट्रांसपोर्टर वितरणों से जुड़े हैं।

Hang Wu, Tongyue Li, Yali Chen, Hang Cao, Junle Li, Ming Zhou, Jun Zhang, Pengmin Qin, Jinhui Wang2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

Mapping Gut Dysbiosis in Alzheimer’s using ML

यह अध्ययन दर्शाता है कि जहाँ वर्तमान में तकनीकी भिन्नता विभिन्न समूहों (cohorts) के बीच मशीन लर्निंग मॉडलों की सामान्यीकरण क्षमता को सीमित करती है, जो कि गट माइक्रोबायोम डेटा से अल्जाइमर रोग की भविष्यवाणी करने के लिए है, वहीं विशिष्ट ब्यूटिरेट-उत्पादक टैक्स (taxa), विशेष रूप से *Lachnospira*, स्वतंत्र डेटासेट में निरंतर कमी प्रदर्शित करते हैं।

Pranav Sathish Kumar2026-09-30
🧬 जीव विज्ञान

The ballon model revisited

यह शोध पत्र ग्रब के फ्लो-वॉल्यूम पावर लॉ (Grubb's flow–volume power law) पर आधारित एक क्लोज्ड-फॉर्म हेमोडायनामिक रिस्पॉन्स फंक्शन (HRF) व्युत्पन्न करने के लिए BOLD प्रभाव के बैलून मॉडल का पुनरावलोकन करता है, जो संवहनी मापदंडों को प्रारंभिक डिप (initial dip) और पोस्ट-स्टिमुलस अंडरशूट (poststimulus undershoot) जैसी प्रमुख प्रतिक्रिया विशेषताओं से स्पष्ट रूप से जोड़ता है, जिससे विभिन्न मस्तिष्क क्षेत्रों और आबादी में HRF विविधताओं की व्याख्या करने के लिए एक एकीकृत ढांचा प्रदान होता है।

John Gore, Tzu-wei Lee, Yang Jiaao, Abbe L. Knutsson, warren boschen, Muwei Li, Kurt G. Schilling, Adam W. Anderson, Zha (…)2026-09-30