282 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本研究は、CRAF および ARAF における RAS のリクルートと RAF の自己抑制の解除を媒介するシステインリッチドメイン（CRD）が、どのように分岐したアイソフォーム特異的メカニズムを仲介するかを解明し、MAP キナーゼ経路の活性化を支配する生物物理学的原理と KRAS 標的治療薬の影響に関する新たな知見を提供する。
本研究は、甘草（*Glycyrrhiza uralensis*）由来のイソリキリチゲニンが、その-不飽和カルボニル基を介してリポカリン型プロスタグランジン D2 合成酵素（L-PGDS）を共有結合的に阻害し、それによってプロスタグランジン D2 の産生およびインターロイキン -6 の発現を抑制することを示すことにより、イソリキリチゲニンの抗炎症メカニズムを解明した。
安定同位体支援型計算質量分析と13C 標識甘草組織における分子ネットワークを統合することで、研究者らはこの植物の根特異的代謝物を特徴づけ、新たなホモピペコール酸結合型フラボノイドアルカロイドを発見し、その構造を同定するとともに特異的な生合成経路を提案した。
本研究は mdCATH データベースからの大規模な分子動力学データを解析することにより、新たに同定されたハイブリッド I/I' 中間体を含む 6 種類の-ターンを分類し、特定のアミノ酸配列と隣接する構造的文脈がどのように協調してそれらのコンフォメーションダイナミクスと柔軟性を支配するかを明らかにする。
アリルマロネートデカルボキシラーゼ（AMDase）の疎水性ポケットを設計変更することにより、研究者たちは、立体障害のあるα-アリルおよびα-アルケニルカルボン酸の（R）-エナンチオマーをきわめて高いエナンチオ純度で合成できるように、その基質範囲を拡大することに成功した。
本研究は、BTK 阻害剤における共有結合性ウォーヘッドの化学的性質、具体的には 2-ブチンアミドとアクリルアミドとの比較が、単なる不活性な結合基として機能するのではなく、タンパク質のコンフォメーションダイナミクスとシグナル伝達効率を能動的に調節し、それによって阻害剤の性能および潜在的な耐性メカニズムに影響を及ぼすことを明らかにした。
本研究は、グルカゴンファミリーからの大幅な配列多様性にもかかわらず、分泌顆粒における機能的なフィブリル形成を可能にする条件付きスイッチとして機能するヘパリン感受性のリシン/アルギニンゲートキーパー残基によって、PACAP ペプチドファミリーにおける進化的に保存されたアミロイド凝集が厳密に制御されていることを明らかにする。
本研究は、酸化ストレスおよびEGFへの応答において、ARHGEF7のC312残基におけるS-グルタチオン化がRac1との結合および活性化を促進し、これによりRac1-PAK1-LIMK1/MEK1シグナル軸を介してがん細胞の遊走と浸潤を駆動することを明らかにした。
本研究は、プリンヌクレオチドが栄養感知を介したプリン生合成を調節するために酵素 PPAT をその阻害因子 NUDT5 に結合させる内在性代謝接着剤として機能することを明らかにし、チオプリン系化学療法薬がこのメカニズムを可適的な結合ポケット内で独特の配向をとることで増強された効力によって利用することを示している。
本研究は、栄養不足時のストレス応答および自然免疫経路を駆動するために、核内 MAT2A の蓄積およびそれに続くクロマチンリモデリングを誘発する主要な代謝シグナルとして、S-アデノシルメチオニン（SAM）の豊富さではなくメチオニンの利用可能性が機能することを示している。