Chiral methionine oxidation reagents reveal stereospecific proteome modifications
本研究では、キラルなオキサジリジン試薬を用いてメチオニンの酸化部位の立体特異性を網羅的に同定し、特定の立体異性体の酸化がタンパク質機能のアルロステリック調節や細胞・マウスモデルにおける酸化ストレス応答に重要な役割を果たすことを明らかにしました。
338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本研究では、キラルなオキサジリジン試薬を用いてメチオニンの酸化部位の立体特異性を網羅的に同定し、特定の立体異性体の酸化がタンパク質機能のアルロステリック調節や細胞・マウスモデルにおける酸化ストレス応答に重要な役割を果たすことを明らかにしました。
本論文は、従来の構造解析手法や AlphaFold 単独では困難であった内在性無秩序領域(IDR)を含むヒト HDAC2 クロマチンリモデリング複合体(HDAC2:MIER1:MHAP1)の立体構造を、実験的交差結合データと計算モデリングを統合したアプローチにより解明し、HDAC2 の C 末端 IDR が複合体形成において重要な役割を果たすことを示した。
本研究は、コンピュータ支援設計と進化再構築を組み合わせる多目的酵素工学アプローチにより、血栓溶解能、線維素選択性、阻害耐性を同時に向上させた新規リード変異体「Brnoteplase」を開発し、出血リスクを低減しつつ血栓溶解効果を高める新たな治療薬候補を確立しました。
本研究は、ヒト Ago2 における miRNA ガイドと標的 RNA の結合構造を解明し、CK1α による EI 領域のリン酸化と PAZ ドメインの動的な構造変化が、標的 RNA の放出と RISC 複合体の効率的なリサイクルを促進するメカニズムを明らかにしたものである。
本論文は、枯草菌の K+/H+ 逆輸送体 CpaA が c-di-AMP によって不活性化されることを、結晶構造解析と機能的なフラックスアッセイを通じて明らかにし、細菌の K+ 制御機構における c-di-AMP の役割の複雑さを再確認したものである。
本研究では、ヒト細胞フリー翻訳スクリーニングプラットフォームを開発し、約 28,000 種類の化合物をスクリーニングすることで、ヒトの 60S リボソームのペプチジル転移酵素中心に結合してタンパク質合成を阻害する新たな環境毒素 NT-2 を同定し、その分子機構を解明しました。
本研究は、1018 種類のシデロフォア構造を網羅するデータベースを用いて「シデロフォア - モノマー - 前駆体 - 代謝経路」分析フレームワークを開発し、植物病原菌に対する拮抗作用を持つ根圏細菌のシデロフォア生産を促進する特定の一次代謝前駆体を同定することで、病原菌抑制に向けた新たな代謝介入戦略を確立しました。
本論文は、線虫に存在する新たなエンドウイルス「アトラスウイルス」のクライオ電子顕微鏡構造を解明し、そのカプシドの特性を基に構造設計を行うことで、遺伝子・細胞療法におけるRNA 治療薬の組織特異的送達システムとして有望な新たなベクターを開発したことを報告しています。
本論文は、マラリア原虫の FIKK1 酵素が VAR2CSA 蛋白質をリン酸化することで胎盤への赤血球付着を促進し、胎盤性マラリアの病原性に関与していることを明らかにし、この酵素を薬剤ターゲットとする可能性を示唆しています。
この論文は、HEK293 細胞からアフィニティ精製したタンパク質サンプル中に混入していたヒトプロピオニル CoA カルボキシラーゼと PRMT5:MEP50 複合体を、クライオ電子顕微鏡データ解析と質量分析の組み合わせによって同定し、アフィニティ樹脂の特異性の重要性を再確認したものである。