338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本研究は、シアノバクテリアの ESCRT-III 超家族に属するタンパク質 IM30 が、構造的ヘアピン領域を介して液 - 液相分離を起こし、ストレス条件下で細胞質内の過飽和状態から迅速に凝縮体を形成することで、環境適応を司る新たなメカニズムを解明したことを報告しています。
本研究は、Flagellimonas taeanensis 由来の dCas12f-σE-RNAP 複合体のクライオ電子顕微鏡構造を解明し、従来のプロモーター認識とは異なるメカニズム、すなわち RNA ガイダンスによる DNA 結合がσE-RNAP のリクルートと転写開始を直接制御する新たな機構を初めて示したものである。
本論文は、ユビキチン鎖を切断するデオビキチン化酵素 Otu1（哺乳類では Yod1）が、Cdc48/p97 ATPase 複合体への基質の閉じ込めを防ぎ、プロテアソームへの転送と分解を可能にするメカニズムを、クライオ電子顕微鏡構造解析などを通じて明らかにしたものである。
本研究は、計算機による正規化を適用すれば、多くの定量プロテオミクス実験において、時間とコストを節約するためにタンパク質の定量および物理的正規化ステップを省略しても、測定変動が許容範囲内に収まることを示しています。
本論文は、サブマイクロメートル炭素粒子や大腸菌、フルボ酸の熱可塑性プラスチックへの吸着が、XDLVO 理論の予測とは異なり、粒子のサイズや表面電荷といった粒子固有の特性によって支配され、未使用のプラスチック表面自体は有機物に対して本質的に親和性が低いことを示している。
本論文は、アルギニン残基を持たないα-シヌクレイン凝集体の溶解と毒性低減において、メチル化酵素 PRMT1/Hmt1 が従来の触媒活性に依存しない非古典的な経路で機能し、酸化ストレス下で細胞質へ移行して凝集体を分解することを明らかにした。
本研究は、線虫とウイルス由来の新たなHDVリボザイムの結晶構造を解明し、C75 が一般酸として、金属イオンがルイス酸として働く独自の触媒機構を明らかにしたものである。
本研究は、ペプチディスクを用いた DIA-MS 解析により、アルツハイマー病モデルマウスの膜タンパク質プロテオームが病態により著しく再編成されることを明らかにし、M1 受容体正のアロステリックモジュレーターが野生型ではなく病態に特異的に変化させた膜ネットワークを優先的に標的とする作用機序を解明したものである。
本研究は、Pseudomonas aeruginosa の NADH:ユビキノン酸化還元酵素（NQR）を新規抗菌標的として特定し、ハイスループットスクリーニングとクライオ電子顕微鏡解析を通じて阻害剤を発見・構造解明するとともに、これらの化合物が NQR 欠損株と同様に細菌の運動性やバイオフィルム形成といった病原性因子を阻害することを実証したものである。
本論文は、AlphaFold による予測と実験的検証を組み合わせ、Shigella 菌の T3SS ソーティングプラットフォームの「ポッド」構造において、アダプター蛋白 MxiK が 2 分子の Spa33 と結合し、さらに SPOA2 ホモダイマーと相互作用するモデルを提示するとともに、低温電子トモグラフィーの知見から、より多くの Spa33 分子を含む代替モデルの可能性を指摘したものである。