338 件の論文
生命の仕組みを分子レベルで解き明かすのが生化学です。DNA やタンパク質といった目に見えない小さな分子が、どのように互いに働き合い、私たちが呼吸したり考えたりする生命活動を支えているのか。この分野は、そのような生命の根源的なメカニズムを研究する領域です。
Gist.Science では、生化学に関連する最新の論文を bioRxiv から収集し、専門家の目を通じて整理しています。掲載されている全てのプレプリントに対し、専門用語を噛み砕いた平易な要約と、技術的な詳細を網羅した解説の両方を提供し、誰でも最新の知見にアクセスできるようにしています。
以下に、生化学の分野で bioRxiv から公開された最新の論文リストを掲載します。
本研究は、深層酸化還元プロテオミクスを用いて免疫関連タンパク質の酸化還元調節システインを網羅的に同定し、マクロファージの炎症反応を制御する新規酸化還元スイッチ（SHP1 の Cys102）を特定して、これを標的とした高選択的共有結合アゴニスト SCA を開発し、マウスおよびヒトマクロファージにおける炎症性サイトカイン産生を抑制する戦略を確立したことを報告しています。
本論文は、ATAD2B 複合体の構造解析において X 線結晶構造解析からクライオ電子顕微鏡へ移行する過程で直面した課題と、サンプル調製からデータ処理、モデル構築に至るまでの実践的なワークフローを詳述し、大分子複合体の構造生物学におけるクライオ EM 導入の指針を提供するものである。
この論文は、拮抗する負のフィードバックループが制御変数レベルで結合された際に、相対的なセットポイントに応じて「委任制御」や「孤立制御」などの異なる調節モードや、環境変化に応じたセットポイントの可変性（レオスタシス）が現れることを示し、シベリアンハムスターの体重調節や血糖恒常性などの生物学的現象を説明する統合モデルを提案しています。
RY785 はテトラエチルアンモニウム（TEA）が選択性フィルター付近に結合してイオン流を直接遮断するのとは異なり、Kv2 チャネルのゲート領域にオフ軸で結合して半開状態を安定化・閉塞することで、電位感受性ドメインから 3nm 離れた位置でチャネルを抑制する、という分子動力学シミュレーションに基づく新たな阻害メカニズムを解明した。
この論文は、炎症時の酸化条件下でのみ von Willebrand 因子の機能を阻害する可能性を示唆する既存薬ルマカフトールを特定し、酸化・非酸化状態の両方における VWF の血小板受容体結合を評価する簡便な高スループット ELISA 法を開発したことを報告しています。
本論文は、Xer 組換えがプラスミドの psi 部位において、4 つの負の超らせんをカテナン結合に変換する過程で、トポロジカルなリンク数の変化（ΔLk）が+4 であることを実証し、チロシン組換え酵素の反平行配列とホリデイ中間体を介した反応機構を支持するものである。
本論文は、SLC10 ファミリーに属する胆汁酸トランスポーター（ASBT および NTCP）の構造を解明し、NTCP に見られる貫通孔が ASBT には存在しないことを示すことで、このファミリーの輸送メカニズムにおける孔の普遍性を否定し、さらに膜脂質が疎水性ステロール基と相互作用することで大規模な修飾基を持つ胆汁酸の輸送を可能にしていることを明らかにした。
本研究では、複数のプロテアーゼとタンデムマスタグ（TMT）を組み合わせた新規ワークフロー「RIPUP」を開発し、ヒストン修飾のサンプル調製時間を数日から数時間に短縮するとともに、従来の手法では検出困難だったアシル化などの広範な修飾部位を高精度に同定できることを実証しました。
本研究は、オルタナティブ ORF によってコードされるマイクロタンパク質 AltSLC35A4 がアクチン・ミオシン細胞骨格と相互作用し、TFAM 発現やミトコンドリア膜電位の変化を伴わずにミトコンドリア DNA のホメオスタシスとヌクレオイドの空間的分布を調節する新たなメカニズムを明らかにした。
MERS コロナウイルス主要プロテアーゼ阻害剤の濃度反応曲線が示す二相性挙動を解析する 3 つの手法を比較した結果、酵素の二量体化とリガンド結合を考慮したモデルを用いることで、細胞内での抗ウイルス活性を最も正確に予測できることが示された。