FLIP2: Expanding Protein Fitness Landscape Benchmarks for Real-World Machine Learning Applications
FLIP2 は、酵素やタンパク質間相互作用など 7 つの新しいデータセットと実世界に即した評価分割を導入し、既存の転移学習手法が必ずしも優位ではなく単純なモデルが同等以上の性能を示すことを明らかにすることで、タンパク質の適応度予測における機械学習モデルの汎化能力を再評価する新しいベンチマークを提案する。