1250 件の論文
バイオインフォマティクスは、膨大な生物学的データをコンピュータの力で解析し、生命の謎を解き明かす分野です。ゲノム情報やタンパク質の構造といった複雑なデータから、新たな発見を引き出すための重要な橋渡し役となっています。
Gist.Science では、bioRxiv から公開される最新のプレプリントをすべて対象に、この分野の論文を網羅的に扱っています。専門的な詳細な要約に加え、難しい専門用語を避け、誰でも理解できる平易な日本語での解説も併せて提供しています。
以下に、bioRxiv から更新されたばかりのバイオインフォマティクスに関する最新論文の一覧を掲載します。
本論文は、より現実的な系統樹モデルである「クリティカル・ベータスプリッティング木」において、ハール型ウェーブレットを用いた系統共分散行列の疎性化（スパース化）が成立することを数学的に証明し、それに基づいた-多様性指標が微生物環境の組成差を捉える有効な生物学的信号であることを示しています。
本研究は、トランスクリプトミクスとシステム生物学を統合した解析により、乾癬の新たな制御メカニズムを特定するとともに、多標的作用を持つ有望な植物化学成分（フィトケミカル）を同定しました。
本研究は、鶏の消化管における生理学的・空間的特性を考慮した世界初の多区画時空間代謝モデルを構築することで、微生物叢の代謝応答を予測し、合理的な飼料介入設計を可能にするメカニズムに基づいたプラットフォームを開発したものです。
bMINTYは、次世代シーケンシング解析における解析結果とメタデータを構造化して管理し、RO-Crate形式でポータブルなデータパッケージとして出力することで、研究成果の透明性と再利用性（FAIR原則）を向上させるためのウェブアプリケーションです。
thematicGOは、g:Profilerを用いたGO濃縮解析の結果を、キーワードベースの戦略によって生物学的な「テーマ」へと集約・整理することで、冗長性を排除し、解釈性を向上させた新しい解析フレームワークです。
CoPrimeEEGは、互いに素なサブナイキストサンプリング理論と中国剰余定理（CRT）に基づく学習手法を統合することで、低電力な低サンプリングレートのEEG信号から高精度な波形再構成と特徴量抽出を同時に実現するニューラルネットワークフレームワークです。
本論文は、静的な単一細胞RNAシーケンシングデータから、細胞を意味的なコードとして表現し、自己回帰的な生成モデルを用いることで、将来の細胞状態遷移の軌跡やランドスケープを予測可能にする生成AIモデル「CellTempo」を提案しています。
本論文は、がんゲノムデータの標準化に向け、GA4GHのVRS（Variation Representation Specification）を活用して、臨床報告からゲノムシーケンシングデータまでを段階的かつスケーラブルにOMOP CDMへ統合するための手法と、VCFファイルを自動変換するパイプライン「KOIOS-VRS」を提案するものです。
本論文は、空間トランスクリプトミクスにおいて、細胞種間の局所的な共局在を効率的かつ解釈可能に定量化する、グラフの枝刈りを用いた新しい多変量指標「Neighborhood Product Co-localization (NPC) score」を提案しています。
本論文は、プロモーター中心の新しい解析手法「PEhub」を開発することで、従来のペアごとの相互作用解析では困難だった、複数のエンハンサーが協調して遺伝子発現を制御する「マルチウェイ・エンハンサー・ハブ」という高次なゲノム構造を解明し、それがヒト脳における遺伝的リスクや転写制御の階層的な仕組みを規定していることを明らかにしました。