502 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
本論文は、1,467 頭のミツバチ個体と 18 の亜種からなるゲノムデータを用いて、殺虫剤耐性に関与する細胞色素 P450 遺伝子群の遺伝的多様性を初めて包括的に解析し、特に CYP3 クラウン遺伝子において正の選択が働いていることを明らかにし、持続可能な受粉者管理に向けた薬剤感受性予測や耐性強化の基盤となるファーマコゲノミクス資源の構築への第一歩を示したものである。
東南アジアの酸性泥炭地黒水域に生息する、世界最小の魚を含む 4 種のシクリン形目魚類の高品質な参照ゲノムを構築し、極限環境への適応と体サイズ微小化のゲノム基盤を解明しました。
本論文は、ブタからサルへの腎臓異種移植の単細胞解析を通じて、マクロファージの種間キメラ性と上皮由来の IFN-ε が制御する免疫寛容ニッチの存在を明らかにし、異種移植の拒絶反応と適応を解明する新たな道筋を示したものである。
本研究は、新しい計算ゲノミクスフレームワークを用いて膀胱癌の稀な組織型における腫瘍間質界面でのクローン動態と微小環境相互作用を解明し、組織型ごとの異なるリ모델リング機構を明らかにするとともに、液体生検による非侵襲的追跡の可能性を示しました。
本研究は、低深度シーケンシング（Sparse-Seq）が質量分析に匹敵する精度で 5mC/5hmC を定量化し、ゲノムコンテキストを保持しながら大規模コホート研究に適した低コストかつ高精度なエピゲノム解析手法であることを理論的・実験的に確立した。
本論文は、環境変化の影響を受けるイカ（Sepia officinalis）の若齢個体（孵化直後と生後 1 ヶ月）から、重金属および高 CO2 濃度下での曝露条件を含む多様なサンプルを用いて、2 つのデノボ転写体アセンブリと機能注釈を構築し、これらがコウイカ類の環境研究における貴重なゲノム資源を提供することを報告しています。
本論文は、Oxford Nanopore によるマルチプレックスシーケンシングにおけるバーコードのクロストークを特定・定量し、特に低バイオマス試料においてその誤検出を防ぐために、ライブラリ調製段階でのポス・リゲーション・プーリング（PLP）という即座に導入可能な手法を提案しています。
本論文は、メスカンサス育種において、遺伝子型×環境相互作用を考慮した予測モデルを用いて疎な試験設計を採用することで、表現型評価コストを 5 倍削減しつつ予測精度を維持できることを示しています。
本論文は、ススキ（Miscanthus sacchariflorus）の育種において、複数の形質と環境を同時に考慮する多変量多環境ゲノム予測モデルが、特定の形質や未評価個体の予測精度向上に寄与し、育種サイクルの短縮や選抜判断の加速に有効であることを示しています。
T2T 完全ヒトゲノム参照配列とマルチモーダルエピゲノムプロファイリングを用いた本研究は、ヒトゲノムの約半分を占めるトランスポゾンが、宿主のヘテロクロマチン化（主に H3K9me3）からの逃避と CTCF 結合領域への進出という「軍拡競争」を通じて、ゲノム進化と調節機能の革新を駆動していることを明らかにしました。