Extensive longevity and DNA virus-driven adaptation in nearctic Myotis bats
本論文は、北米産のミヤオチス属コウモリにおける細胞系とゲノム解析を通じて、DNA ウイルスとの相互作用やがん経路の適応が、コウモリの驚異的な長寿とウイルス耐性の進化を駆動する共通のメカニズムであることを明らかにしたものである。
🧬 Category
genomics
502 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
Causal differential expression analysis under unmeasured confounders with causarray
この論文は、観測データにおける未測定交絡因子や選択バイアスの課題を解決し、単細胞および擬似バルクレベルのゲノムデータから因果関係を頑健に推定するための新しいフレームワーク「causarray」を提案し、自閉症リスク遺伝子やアルツハイマー病に関する実データ解析を通じてその有効性と生物学的意義を実証したものです。
Self-organization of Drosophila chromatin architecture in a cell-free system
本研究は、ショウジョウバエの細胞抽出液を用いた無細胞系において、転写を伴わずにループや TAD などの高次クロマチン構造が自発的に形成されることを実証し、特に eve 遺伝子座における TAD 形成が単純なループ抽出モデルではなく、Su(Hw) による境界要素の直接対合に依存することを明らかにしました。
Chromosome-scale genome of the woody oilseed crop sacha inchi elucidates the molecular basis of alpha-linolenic acid biosynthesis and triacylglycerol accumulation in seeds
本研究は、Illumina、PacBio、Hi-C 技術を統合してサチャインチの染色体レベルの高品質ゲノムを構築し、系統発生解析や種子発育段階におけるトランスクリプトーム解析を通じて、α-リノレン酸生合成およびトリアシルグリセロール蓄積の分子メカニズムを解明しました。
Weather Characterization for Optimizing Genomic Prediction in Miscanthus sacchariflorus
この研究は、気象データを用いて環境相関を分析することで、ススキ（Miscanthus sacchariflorus）のゲノム予測モデルの精度を維持しつつ、訓練に使用する試験地点を最大 75% 削減し、育種資源の効率的な配分を可能にすることを示しています。
Evolutionary and Deep Learning Models Highlight Deleterious Mutations Behind the History of Sugar Beet Breeding
本研究は、進化的保存性と深層学習モデルを統合して高信頼度の有害変異を同定し、サトウダイコンの育種歴における遺伝的負荷の動態を解明するとともに、将来の品種改良やゲノム編集に向けた標的を提供しました。
Dynamic genomes uncover opposite sex determination in the invasive quagga and zebra mussels
本研究は、染色体レベルのゲノム解析を用いて、外来種であるゼブラムールとクアガムールの性決定機構が、それぞれ多遺伝子性の ZZ/ZW 型と FoxL2-Y の重複に起因する局所的な XX/XY 型という、驚くほど対照的な構造を持つことを初めて解明しました。
Chromosome-level genome sequence of the C4 grass Themeda triandra reveals karyotype orthology with sorghum and genetic variation in accessions adapted to diverse environments
オーストラリア全域に分布する C4 植物 Themeda triandra のクロロソームレベルゲノム配列解読により、ソルガムとの染色体相同性が確認され、乾燥地や温帯など多様な環境に適応した個体群間で熱ショックタンパク質や開花調節に関わる遺伝子に広範な変異が存在することが明らかになりました。
Genome-wide DNA methylation profiling of the zebrafish forebrain
本研究は、オックスフォード・ナノポア社の長鎖シーケンシング技術を用いて成体ゼブラフィスの前脳を対象としたゲノムワイドな DNA メチル化プロファイリングを実施し、CpG メチル化の広範な分布や非 CpG メチル化などの詳細なエピゲノム基盤を確立したものである。
Patches: A Representation Learning framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
この論文は、欠損データや複雑な属性を持つ単一細胞トランスクリプトミクスデータにおいて、共通および条件固有の転写プログラムを解読し、創傷治癒における加齢や薬物治療の影響を明らかにする新しい表現学習フレームワーク「Patches」を提案しています。