🧬 ゲノミクス
RNAPII and XPC remodel the 3D genome for UV repair
本研究は、UV照射に伴い、RNAポリメラーゼIIとXPCが、ループ押出を制限してクロマチンループを短縮させドメインを強化することにより、3Dゲノムを能動的に再構成し、それによって効率的なヌクレオチド除去修復を促進する修復許容状態を作り出すことを明らかにしている。
🧬 Category
genomics
398 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
🧬 ゲノミクス
Genome Assembly of the Endangered Patagonian Deer Hippocamelus bisulcus (huemul): The First Nuclear Genome for the Genus Hippocamelus
本研究は、絶滅危惧種であるパタゴニア・ヒュムル（*Hippocamelus bisulcus*）に関する、極めて連続性の高い染色体スケールの核ゲノムおよびミトコンドリアゲノムのアセンブリを初めて提示するものであり、この象徴的な南米産シカ類の保全管理および進化研究を推進するための不可欠なゲノム資源を提供するものである。
🧬 ゲノミクス
Gonadal remodelling in socially driven sex change is associated with novel and known sex genes, epigenetic reprogramming, and inflammation-mediated apoptosis.
本研究は、ニュージーランド産の斑点模様のあるラス（New Zealand spotted wrasse）のゲノム、トランスクリプトーム、および組織学的解析を利用することで、社会的要因による性転換が、既知および新規の性決定遺伝子の協調的な制御、エピジェネティックな再プログラミング、そして生殖腺の再構築を促進するための炎症介在性の細胞死（アポトーシス）を伴うものであることを明らかにしている。
🧬 ゲノミクス
A chromosome-scale genome assembly of the Swiss Lolium multiflorum ecotype Tremona reveals a scalable method to purge spurious duplications
本研究は、スイスの*Lolium multiflorum*（イタリアライグラス）の生態型であるTremonaの高品質な染色体スケールゲノムアセンブリを提示し、ヘテロ接合性に起因する偽の重複を効果的に除去するためのParaLiesと呼ばれるスケーラブルなツールを導入することで、この複雑な牧草種におけるアセンブリ精度を大幅に向上させるものである。
🧬 ゲノミクス
Global tree encoding of atlas-scale single-cell genomics
本論文は、大規模な単一細胞ゲノムデータセットを統一された階層的ツリー表現へと整理することで、効率的なサブサンプリングを可能にし、マルチレゾリューションな細胞関係を保持し、さらに組織、発生段階、および種を横断した統合的な解析を促進する、スケーラブルな計算フレームワークであるMILKを紹介するものである。
🧬 ゲノミクス
Visualizing and integrating linear and graph pangenomes at the Maize Genetics and Genomics Database
Maize Genetics and Genomics Database (MaizeGDB)は、JBrowse2を新たなパンゲノムビューアと統合することで解析機能を強化し、トウモロコシにおける構造変異や農学的形質の精密な特性評価を促進するために、線形およびグラフベースの両方のパンゲノムのインタラクティブな可視化を可能にしました。
🧬 ゲノミクス
Histone H3K9 methylation and Heterochromatin Protein 1 do not limit DNA accessibility in living S. pombe cells
生細胞内の銅誘導性DNAメチルトランスフェラーゼ系を用いた本研究は、真核染色質（ユークロマチン）と異質染色質（ヘテロクロマチン）の両方が生体内において全般的にアクセス可能であることを実証しており、H3K9メチル化およびHP1/Swi6系がDNAのアクセシビリティを制限していないこと、ならびに単離された核において観察されるアクセスの不全は、生物学的な抑制メカニズムではなく、密なヌクレオソーム間隔によるアーティファクトであることを明らかにしている。
🧬 ゲノミクス
Within-colony color variation in a chalice coral is associated with region-specific pigment expression and higher photoconvertible pigment transcripts
このパイロット研究は、単一のクローンであるチャリスサンゴのコロニー内における顕著な色の変化が、遺伝的な差異ではなく、領域特異的な異なる蛍光タンパク質転写産物および光変換性EosFPファミリータンパク質のアップレギュレーションによって引き起こされていることを明らかにしている。
🧬 ゲノミクス
Two evolutionary histories in one nucleus: genome remodeling and allelic regulation underlying heterosis in hybrid oil palm
本研究は、極めてヘテロ接合性の高いF1ハイブリッドのアブラヤシゲノムを完全なハプロタイプへと解読することで、相補的なゲノム再編成、古代のイントログレッション、および均衡した対立遺伝子発現が、いかにして異なる親の形質を調整しヘテロシスを駆動しているかを明らかにするものである。
🧬 ゲノミクス
The first chromosome-scale genome assembly of Blumeria graminis f. sp. avenae provides insights into genome evolution and host specialization
本研究は、*Blumeria graminis* f. sp. *avenae*における初の染色体スケールのゲノムアセンブリを提示するものであり、その宿主特異性が、大規模なゲノム再編ではなく、転移因子に富み構造的に動的なゲノム領域内における病原性遺伝子の局所的な多様化によって駆動されていることを明らかにしている。