Genomic consequences of admixture in an experimentally founded sand lizard population
スウェーデンの島で実施された実験的な遺伝的救済（異なる個体群の交配）は、20 年（5〜6 世代）を経て遺伝的多様性の向上と有害変異の減少をもたらし、繁殖成功率や幼体の生存率の向上という成功を示した。
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genomics
502 件の論文
ゲノミクスは、生命を構成する設計図である遺伝情報を解読し、その働きや多様性を理解するための重要な分野です。この領域では、DNA の配列から病気の原因を突き止める研究から、進化の歴史をたどる調査まで、多岐にわたる発見が生まれています。Gist.Science では、これらの最先端の知見を、専門用語に頼らず誰でも理解できる形でお届けします。
当サイトのゲノミクスカテゴリに掲載される論文はすべて、プレプリントサーバー bioRxiv から提供された最新のものであり、承認前の研究結果も含んでいます。Gist.Science は bioRxiv から届くすべての新規プレプリントを自動的に処理し、専門家が読める詳細な技術的要約と、一般の方も読める平易な解説の両方を生成して公開しています。
以下に、ゲノミクス分野における最新の論文リストを掲載します。
Over-representation of sperm-associated deleterious mutations across wild and ex situ cheetah (Acinonyx jubatus) populations
この研究は、野生および飼育下のチーター全ゲノム解析を通じて、精子機能に関連する有害変異の過剰な存在を確認しつつ、飼育プログラムが野生個体群と同等の遺伝的多様性を維持する上で効果的であることを示しました。
Systemic mutagen exposures reported by normal kidney cell genomes
単一分子デュプレックスシーケンシングを用いた大規模な正常腎臓細胞のゲノム解析により、腎尿細管細胞がアリストロキ酸などの既知の発がん性変異原や未知の全身性変異原への曝露を高い感度で記録していることが明らかになりました。
Comparative genomics of Cadophora luteo-olivacea reveals a divergent lineage, conserved functional repertoires, and strain-level variation in pathogenicity
本論文は、12 株の*Cadophora luteo-olivacea*の比較ゲノム解析を通じて、宿主や環境に由来する菌株間でゲノム構成や病原性の程度に多様性が見られるものの、植物への定着能力に関わる機能的な枠組みは保存されていること、およびその中の 1 株（CBS 266.93）は系統分類上の再検討を要する分岐した系統であることを明らかにした。
An introgressed galectin-like protein is a candidate driver of the human tropism in the intestinal parasite Cryptosporidium
西アフリカ産の Cryptosporidium parvum anthroponosum に対するゲノム解析により、C. hominis からの遺伝子導入により生じたガレクチン様タンパク質が、ヒトのインスリン分解酵素と相互作用することで、この寄生虫のヒト特異的な宿主適応を駆動している可能性が示されました。
Benchmarking SNP-Calling Accuracy Against Known Citrus Pedigrees Reveals Pangenome Advantages Over Linear References
本論文は、シトラス属の系統樹を用いたベンチマークにより、従来のリニア参照ゲノムに比べパノゲノムグラフが、特に分岐した領域におけるハプロタイプブロックの再構成精度を向上させ、遺伝子型呼び出しの信頼性を高める可能性を示したことを報告しています。
Socially regulated genes are spatially hyperconnected to enhancers in the ant brain
この論文は、ハチの脳におけるカーストの可塑性を制御する遺伝子群が、すでにワーカー段階でエンハンサーと高度に結合した 3 次元構造を形成しており、これが社会的な行動再プログラミングの基盤となっていることを明らかにしたものである。
Conditional genome-wide associations reveal novel genes
この論文は、条件付きゲノムワイド関連解析に基づく新たな手法を開発し、その実証により植物の開花時間制御に関わる未知の遺伝子を同定するとともに、農業や医療における複雑形質の遺伝子発見におけるノックオフ法フレームワークの有効性を示したものである。
Genomic indicators of gene function: A systematic assessment of the human genome
この論文は、ヒトゲノムにおける遺伝子の機能を評価する指標として、転写活性と進化的保存性が最も強く一貫した関連を示し、ヒストン修飾やクロマチン可視性などの他のゲノム特徴も機能の判断に重要であることを体系的に評価したものである。
Multimodal droplet barcoding enableshigh-throughput linking of single-cell imaging and gene expression
この論文は、単一細胞のイメージングと遺伝子発現プロファイリングを1 分間に数百細胞という高スループットでリンクさせる「マルチモーダル液滴バーコーディング」という新戦略を提案し、配列と表現型の対応関係を解明する大規模データセットの構築を可能にしたことを報告しています。