579 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
本研究は、H3N8 型馬インフルエンザ A ウイルスと*Streptococcus equi* subsp. *zooepidemicus*との間の直接的な物理的結合が、細胞タイプ特異的な細菌の定着を促進し、共感染時にプロ炎症性サイトカインの増加を特徴とするがインターフェロン-β発現が減少する細菌媒介性の免疫活性化を誘導することを示している。
本研究は、乾燥する唾液微小液滴の結晶化過程における浸透圧変化の速度が、呼吸器病原体の失活を予測する定量的かつ媒体に依存しない指標であることを示しており、より急激な湿度低下がより深刻な浸透圧ショックを引き起こし、呼吸器病原体の生存率の低下を招くことを明らかにしている。
台湾由来の1,490 株のサルモネラ分離株を対象としたオックスフォード・ナノポア・シーケンシングを評価したこの大規模研究は、遺伝子型耐性が一般的に表現型結果と相関する一方で、カットオフ値の定義、遺伝子発現、および未知の決定因子に起因する特定の不一致が、監視および治療ガイダンスのための従来の抗菌薬感受性試験に対する優れた代替手段として全ゲノムシーケンシングを活用する際に慎重な解釈が必要であることを示している。
本研究は、バルト海および地下水のメタゲノムから得られた208の新しい完全ゲノムを通じて、古菌門Nanobdellotaのゲノム表現を52倍に拡大し、優占する目に対して新しいSeqCode命名法を確立するとともに、Form III RuBisCOの古菌からPatescibacteriotaへの反復的な水平伝達の証拠を提供する。
本研究は、ヒトサイトメガロウイルスのウイルス粒子が運ぶタンパク質UL14が、感染時の細胞内への侵入後のエンドソームからの脱出を促進する糖鎖修飾を受けた上皮特異的トロピズム因子であることを同定し、これがワクチンおよび抗ウイルス療法の新たな標的となり得る可能性を浮き彫りにした。
本研究は、ヒトの腸内環境に関連する菌株特異的かつ文脈依存的な抗菌活性を示した6つの化合物が、抗生物質耐性性大腸菌の消化管からの除菌に向けた有望な新たな道筋として抗ウイルス薬の転用を提供することを示している。
この研究は、*Pseudomonas aeruginosa* の見かけ上の生態学的一般性が、実際には系統の深部に限られず、系統全体で繰り返し現れる特定の環境への特異的なゲノム適応という収斂的かつ隠れた特化によって駆動されていることを明らかにする。
本研究は、酸性pH下での乳酸存在下における結核菌の増殖停止が、リン酸依存性の細胞内酸性化とプロトン駆動力の消散によって引き起こされ、リン酸トランスポーターの突然変異によりSenX3/RegX3調節群がアップレギュレーションされて増殖が回復することで抑制されうることを明らかにした。
乾燥した草地土壌を再湿潤させた環境にゲノム分解安定同位体プロービングウイルスオミクス手法を適用した本研究は、最初の週に細胞外ウイルス粒子が実際に産生される割合はわずかであるものの、その大部分が急速に蘇生する細菌宿主を標的とする安定した「ウイルス種子銀行」として存続し、環境攪乱後の微生物循環および生物地球化学的循環にとって不可欠な遺伝子貯蔵庫として機能することを明らかにしている。
本論文は、オックスフォード・ナノポア長リードアンプリコンの優れた分類学的解像度を実現し、新規かつ低存在度の分類群を効果的に同定しつつ過分類を最小化するよう、複数の分類ツールを統合した堅牢なワークフローであるアンプリコンコンセンサス分類法（ACT）パイプラインおよび関連する ACT-DB 参照データベースを導入するものである。