Strain-Specific Epistasis Shapes Fitness Landscapes of APOBEC3G Antagonism By HIV-1 Vif Proteins
深変異スキャンを用いた解析により、HIV-1 Vif タンパク質が宿主の APOBEC3G を拮抗する際の適応度地形は、株特異的なエピスタシスと時間的なエピスタシスによって形成され、構造的な頑健性が適応を可能にする一方で、エピスタシスが Vif の進化に制約を課していることが明らかになりました。
498 件の論文
微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。
Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。
以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。
深変異スキャンを用いた解析により、HIV-1 Vif タンパク質が宿主の APOBEC3G を拮抗する際の適応度地形は、株特異的なエピスタシスと時間的なエピスタシスによって形成され、構造的な頑健性が適応を可能にする一方で、エピスタシスが Vif の進化に制約を課していることが明らかになりました。
この研究は、従来の単一病原体説を覆し、アメリカのシイタケ栽培における細菌性斑点病が、以前は病原性不明だった P. azotoformans を含む多様な Pseudomonas 属細菌の複合体によって引き起こされることを、ゲノム解析と表現型評価を通じて明らかにした。
本論文は、タバコホウカイガラムシ(Manduca sexta)が、細菌の病原性や宿主 - 病原体の動態を研究するための、従来のワックスガの幼虫よりも感度の高い新たなモデル宿主として有効であることを示している。
本論文は、結核菌が鉄欠乏条件下で鉄依存性酵素の機能不全を克服するため、クエン酸回路を酸化と還元の両経路に分割し、マレートを分泌することで炭素代謝の流れを維持する新たな代謝戦略を明らかにしたものである。
本論文は、南部米国で拡大中のカルバペネム耐性 Klebsiella pneumoniae 系統 CG307 が、人工尿での増殖能力やウレアーゼ活性の向上など、尿路感染症への特異的な適応特性を有していることを明らかにしたものである。
この研究は、SIV 感染および抗レトロウイルス療法を受けた非ヒト霊長類の多組織から得られた M. tuberculosis 集団の全ゲノム解析を通じて、宿主免疫状態に応じた変異軌跡の差異や脂質代謝関連遺伝子における共通変異パターンを解明し、SIV-Mtb 共感染および ART 抑制下における細菌の分散と適応メカニズムを明らかにしたものである。
本論文は、早産児の気道と腸のマイクロバイオームを解析した結果、気管吸引液および便サンプルにおいて表皮ブドウ球菌(Staphylococcus epidermidis)の増加が気管支肺異形成症(BPD)の発症と強く関連していることを明らかにしたものである。
ダウン症候群の成人では、アルツハイマー病の発症リスクや認知機能低下、血漿バイオマーカーと関連した腸内細菌叢の変化が認められ、その一部は一般のアルツハイマー病患者で報告された変化と類似していることが示された。
本論文は、植物病原菌 Ralstonia pseudosolanacearum において、SpoT 遺伝子の変異による (p)ppGpp 濃度の低下が、病原性や共生性という異なる生活様式への適応を可能にする重要な戦略であることを明らかにした。
この論文は、アルゼンチンのコルドバ州にある 2 つの酪農場のコンポスト・ベッドド・パック(CBP)システムにおいて、16S rRNA 遺伝子シーケンシングを用いて微生物群集構造を特徴づけ、管理条件の違いが細菌群集の組成に与える影響を明らかにしたものである。