微生物の世界は、私たちの目に見えないところで生態系や人間の健康を支える重要な役割を担っています。このカテゴリでは、細菌からウイルス、真菌まで、目に見えない微小な生命の仕組みやその影響について探求します。

Gist.Science は、bioRxiv から公開される最新の微生物学関連プレプリントを網羅的に収集し、専門的な内容を噛み砕いた平易な解説と、技術的な詳細を両方まとめて提供しています。これにより、誰でも最新の研究成果にアクセスしやすくなります。

以下に、微生物学の分野における最新のプレプリント論文リストを掲載します。

🦠 microbiology

13C flux ratio analysis with FRAPPPE reveals differences in metabolic fluxes between gut Bacteroidota and Escherichia coli

本論文は、腸内細菌叢のBacteroidotaとEscherichia coliの間における中心炭素代謝およびヌクレオシド共代謝の明確な代謝差を明らかにするための、13Cフラックス比解析を用いた機械学習ベースのワークフローであるFRAPPPEを導入するものである。

Torka, D. B., Bartmanski, B. J., Spiegelhalter, A., Herrera Gomez, I., Barcenas Rodriguez, M. N., Drotleff, B., Zimmerma (…)2026-06-19
🦠 microbiology

Divergent specificity of PatA, GabT, and IlvE defines the branched transamination of Nε-carboxymethyllysine and its metabolite Nε-carboxymethylcadaverine in Escherichia coli

本研究は、大腸菌(*Escherichia coli*)が、PatA、GabT、およびIlvEの異なる基質特異性を伴う分岐型トランスアミナーゼ・ネットワークを介して、食事由来の最終糖化生成物であるNε-カルボキシメチルリシン(CML)を、CMLおよびその脱炭酸代謝物を新規中間体へと変換することにより、どのように窒素代謝へと組み込んでいるかを解明するものである。

Vougioukas, P., Aveta, E. F., Hoffmann, V., Lassak, J. M., Hellwig, M.2026-06-16
🦠 microbiology

Hidden diversity and expanded host range of sarthroviruses, including terrestrial vertebrates

本研究は、多様なオーストラリアの宿主および環境において10種の新規かつ高度に分岐したサルトロウイルス(Sarthroviridae科)を発見することにより、同科の既知の多様性と宿主範囲を拡大し、より広い生態学的分布、複数の明確な系統、および潜在的な代替複製戦略を明らかにしている。

Mandojana, E., Lim, L., Melade, J., Rieken, J., Hall, J., Petrone, M. E., Mifsud, J. C. O., Marzinelli, E. M., Rose, K. (…)2026-06-16
🦠 microbiology

Implementing considered elements of standardisation for Time Kill Curve experiments across multiple sites: A European collaboration perspective

この欧州の共同研究は、複数の研究所におけるタイムキルカーブ実験の再現性と一貫性を向上させるための標準化されたプロトコルを確立するために、接種液の調製、培養時の撹拌、容器のサイズを含む極めて重要な技術的変数を特定し、評価するものである。

Attwood, M. L. G., Bronstrup, M., Das, S., Fuchs, H., Griffin, P., Hinkelmann, B., Hoare, L., Lebrat, J., Marchand, S. (…)2026-06-16
🦠 microbiology

Resolution of MALDI-TOF MS Compared to Whole Genome Sequencing for the Identification of Vibrio parahaemolyticus Strains Isolated from Oysters

本研究は、MALDI-TOF MSが、牡蠣から分離された腸炎ビブリオ(*Vibrio parahaemolyticus*)株の同定および追跡において全ゲノム解析に匹敵する解像度を提供し、食品安全モニタリングのための迅速かつ費用対効果の高い代替手段となることを実証している。

King, T., Pedrueza, M., Rahman, M., Oh, B., LaMontagne, M. G.2026-06-15
🦠 microbiology

Companion animals harbour globally circulating human-associated Klebsiella pneumoniae lineages and high-risk antimicrobial resistance clones

本研究は、家庭で飼育されている犬や猫が、ヒトに関連する集団と広範に重複する、世界的に循環している高リスクのクレブシエラ・ニューモニエ(肺炎桿菌)のリネージおよび薬剤耐性クローンを保有していることを明らかにしており、より広範なワンヘルスにおける薬剤耐性(AMR)の状況における、それらの重要なリザーバーとしての役割を浮き彫りにしている。

Fordham, S. M. E., Sheridan, E., Drobniewski, F.2026-06-15
🦠 microbiology

Structure of the proton-powered secretion motor at the heart of the bacterial flagellum

本研究は、完全な細菌鞭毛輸出装置の高解像度クライオ電子顕微鏡構造を提示するものであり、埋没したプロトン経路を持つ非量性FlhA複合体と、タンパク質分泌を制御するためにプロトン駆動力によって駆動される回転ゲート機構を示唆する対称性の破れたコンフォメーションを明らかにしている。

Johnson, M., Johnson, S., Deme, J. C., Bryants, O. J., Chevance, F., Hughes, K., Lea, S. M.2026-06-15
🦠 microbiology

Antibodies to influenza A virus hemagglutinin and neuraminidase limit egress and alter the physical properties of released virus particles

本研究は、A型インフルエンザウイルス特異的抗体が、成熟したビリオンを中和するだけでなく、粒子の凝集および伸長したビリオンの放出を誘導することによってウイルスの出芽を能動的に阻害し、それによって活動的な感染過程におけるウイルス集団の物理的特性および感染性を変化させることを明らかにしている。

Jaeggi-Wong, A., Santos-Peral, A., Partlow, E. A., Liu, T., Ivanovic, T.2026-06-15
🦠 microbiology

Social network cycle motifs and gut microbiome strain-sharing

ホンジュラスの18の村における菌株レベルの微生物ネットワークと友人関係ネットワークを分析した本研究は、微生物の伝播は循環的な社会グループ内で頻繁に発生するものの、社会的なサイクルと微生物のサイクルの重なりは種によって大きく異なり、多くの微生物が人間の社会的結びつきとは部分的にしか一致しない伝播経路に依存していることを明らかにしている。

Vishnempet Shridhar, S., Iosifidis, G., Charette, Y., Beghini, F., Christakis, N. A.2026-06-15
🦠 microbiology

Laboratory adaptation and complete genome assembly of a Beposo, Ghana strain of the human hookworm Necator americanus

本研究は、ガーナのベポソ由来のヒト鉤虫(*Necator americanus*)株のゴールデンシリアンハムスターへの実験室的適応成功を報告し、その遺伝的多様性、薬剤感受性、および高品質な完全ゲノムアセンブリを含む、このアフリカ株に関する初の包括的な特性解析を提示するものである。

Harrison, L. M., Herzog, K. S., Osabutey, D., Konoma, M., Allen, E., Hagadorn, K., George, S., Bungiro, R. D., Gaither (…)2026-06-11