Assessment of Repurposed Compounds for Antiviral Activity Against Measles Virus
本論文は、麻疹ウイルスに対する抗ウイルス活性を評価した結果、アゼラストン塩酸塩は効果を示さなかったものの、ザフィルルカスト、ケルセチン、イソケルセチン、特にアスコルビン酸存在下でケルセチンが最も強力な治療効果を有することを明らかにし、これら化合物の臨床応用への可能性を示唆しています。
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microbiology
803 件の論文
Distinct virus-specific regulation of RNA synthesis across genome segments by thogotovirus polymerases: insights from Oz virus and Dhori virus
オズウイルスとドホリウイルスのミニゲノム系を用いた研究により、チゴトウイルス属内でもゲノムセグメント間の RNA 合成調節がウイルス種によって異なり、特にオズウイルスでは遠位二重鎖の特定の塩基対（5'12/3'11）がプロモーター活性を決定するが、ドホリウイルスでは影響を受けないことが明らかになった。
Saccharomyces boulardii attenuates obesity-associated inflammation and weight gain through coordinated gut ecosystem remodeling
本論文は、マウスモデルにおける統合オミクス解析を通じて、プロバイオティクス酵母 Saccharomyces boulardii が腸内細菌叢の再編成と免疫・代謝軸の調節を介して、肥満関連炎症と体重増加を抑制することを示しています。
Pseudogenization of the cntQ permease confers distinct yersinopine-metal uptake selectivity in Yersinia species
Yersinia 属において、cntQ 遺伝子の擬遺伝子化が単一の進化事象として金属取り込みの特異性を鉄から亜鉛へと再編成し、細菌の生理機能を再構築するメカニズムを明らかにした。
DcaP-Family Porins are Required for Carboxylic Acid Utilization and Infection in Acinetobacter baumannii
本論文は、Acinetobacter baumannii において DcaP ファミリーのポリンがクエン酸などのカルボン酸利用に不可欠であり、機能重複を通じて感染時の生存に重要な役割を果たすことを示し、これらが治療標的としての可能性を有することを明らかにした。
The switch from bacterial phosphorus mineralization to arbuscular mycorrhiza in root hairless wheat during crop development
本論文は、根毛欠損コムギがリン欠乏条件下で発育段階に応じて、リン無機化細菌からアーバスキュラー菌根菌（AMF）へと栄養獲得の主要な共生パートナーを時間的に移行させることを明らかにし、根毛の欠如に対する微生物叢の補償的役割を解明したものである。
Antimicrobial Combination Effects at Sub-inhibitory Doses do not Reliably Predict Effects at Inhibitory Concentrations
本論文は、抗菌薬の相乗効果や拮抗作用を評価する際、臨床的に重要な阻害濃度における効果を予測するために、非阻害濃度での単一測定に依存するのではなく、広範な濃度範囲と混合比率における時間分解されたデータを包括的に評価する必要があることを示している。
Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome
本論文は、メタゲノムアセンブリから得られた解像度の高いデータを用いて、単一の環境サンプル内で捕食圧による頻度依存選択と周期的選択という対照的な進化戦略が同時に共存していることを初めて実証し、10 年にわたる Pelagibacter 完全ゲノムの獲得への挑戦に画期的な成果をもたらした。
Body-wrapping anterior flagella drive ultrafast swimming in bacterial zoospores
本論文は、Actinoplanes missouriensis の遊走子が、従来の後部鞭毛束とは異なり、体幹を巻き付くように配置された多数の鞭毛が同期して回転することで、微生物史上最高レベルの相対速度（約 500 体長/秒）を実現する新たな遊泳メカニズムを解明したことを報告しています。
Gardnerella fastidiominuta sp. nov. isolated from the female urinary microbiome
女性泌尿器微生物叢から単離された菌株 CCPDSM が、ゲノムおよび表現型の多角的解析に基づき、新種「Gardnerella fastidiominuta」として提案されました。
A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids
本研究は、PInc と呼ばれる実験的に裏付けられた複製開始タンパク質（RIP）に基づく分類枠組みを確立し、その保存されたウィングドヘリックス領域を用いて大規模な系統解析を行うことで、従来の宿主偏りを超えた細菌プラスミドの進化史と多様性を包括的に解明しました。
Nucleobase Methylation Enhances SARS-CoV-2 Chain Terminator Evasion of Exonuclease Proofreading
本論文は、SARS-CoV-2 の校正機能を持つエキソヌクレアーゼ nsp14 による切除を回避しつつ RNA 鎖を効果的に停止させる 5-メチル -3'-dUTP という新規ヌクレオシドアナログを同定し、その分子メカニズムを解明することで、次世代の抗ウイルス薬開発の指針を提供したことを示しています。
A Droplet Digital PCR Assay for Quantification of Bacteriophage Viral Vector Titer and Purity.
本研究では、実験計画法を用いて最適化されたデジタルドロップレット PCR 法を開発し、バクテリオファージベクターの純度と力価を従来の生物活性アッセイよりも高精度かつ再現性よく定量・評価できる手法を確立しました。
Structural modeling reveals the mechanism of motor ATPase coordination during type IV pilus retraction
本論文は、アルファフォールド 3 と分子動力学シミュレーション、および細胞学的・遺伝学的アプローチを統合することで、ビブリオ・コレラにおける Type IV 繊毛の強力な収縮を駆動する 2 種類のモーター ATP 酵素（PilT と PilU）の協調メカニズムを解明し、その相互作用が多種多様な細菌で保存されていることを実証したものである。
Synergistic interactions of mobile genetic elements shape the stepwise evolution of multidrug-resistant plasmids
この論文は、インテグロン、IS26、ISCR という 3 つの可動遺伝要素の相乗的な相互作用が、多剤耐性プラスミドの段階的な進化と耐性遺伝子の蓄積を駆動する「3I」フレームワークを提唱し、その予測と監視の精度向上に寄与することを明らかにしています。
Biochar Rewires Root Exudates and the Rhizosphere Microbiome and Its Functionality
本研究は、バイオ炭が小麦の根から放出される二次代謝産物などのシグナル分子を変化させ、それによって植物成長促進根圏細菌（PGPR）を中心とした有益な微生物叢を再構築し、温室効果ガス排出の抑制や栄養循環などの機能向上をもたらすことを、マイクロ流体技術と多オミクス解析を統合して明らかにした。
A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles
本研究は、721 件の病原性レプトスピラゲノムデータと rfb 遺伝子座のプロファイルを用いた機械学習フレームワークを開発し、従来の血清学的検査に代わる高精度な血清群分類を可能にするだけでなく、より高次な分類単位として「血清クラス（seroclass）」の概念を提唱したものである。
Does Infection Progression of Mycobacterium abscessus Depend on Sex, Age, and Mouse strain?
Mycobacterium abscessus の感染進行はマウス系統、性別、年齢に依存せず、特に BALB/cJRJ 系統の 5〜6 週齢の雌が慢性感染モデルとして適していることが示されました。
A set of constitutive promoters with graded strengths for gene expression in diverse cyanobacterial strains
この論文は、モデルおよび非モデルの多様なシアノバクテリア株において、合成 PconII プロモーターの変異体から選抜された強度が段階的に異なる 25 個の直列構成プロモーターのセットを特徴づけ、バイオテクノロジー応用に向けた遺伝子発現制御の重要なリソースを提供したことを報告しています。
ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage
本論文は、気管支肺胞洗浄液における下気道感染症の病原体検出において、従来の培養法や全メタゲノムシーケンシングと比較して、高い感度・特異性を示し、追加的な病原体発見や共感染の検出を可能にする自動ハイブリッドキャプチャメタゲノムアッセイ「ONETest PathoGenome」の有効性を多コホート評価を通じて実証したものである。