🧬 biology
Dynamical stability of mutualistic meta-networks depends on the type of dispersal
本研究は、現実的な分散行動、特に交差拡散を相利共生メタネットワークモデルに組み込むことで、分散が均質な定常状態を著しく不安定化させ、それによって、これまで報告されてきた安定性と種豊度の間の正の相関関係を逆転させると同時に、連結性と単峰性の関係を確立することを明らかにしている。
🧬 Category
q-bio
1686 件の論文
🧬 biology
GREAC: An Open-source software for Genome Region Extraction and Classification
本論文は、ウイルスの変異および進化パターンを、正確かつ説明可能で、かつリファレンスに依存しない手法で分類するために、k-merベースの次元削減を利用して識別的なゲノム領域を抽出する、オープンソースの非アライメント型ソフトウェアツールであるGREACを紹介するものである。
🧬 biology
Influence of Visual and Chemical Cues on nest and bower-building behaviours of Coptodon rendalli (Boulenger, 1905) and Ooreochromis shiranus (Boulenger, 1905) in Fibre tanks
本研究は、視覚的および化学的な手がかりの両方がコプトドン・レンダリ（*Coptodon rendalli*）およびオレオクロミス・シラヌス（*Oreochromis shiranus*）の巣およびボウアー構築行動に有意な影響を与えることを示しており、オスとメスが細かいネットによって隔てられ、かつ水中に特定のレベルの土壌基質処理された手がかりが含まれる場合に最適な構造寸法が観察されることから、孵化場の繁殖条件を改善するための貴重な知見を提供している。
🧬 biology
Precursor-dependent steroid conversion sustains androgen receptor signaling and lineage-state divergence in prostate cancer
本研究は、去勢抵抗性前立腺癌が自律的な新規合成ではなく副腎ステロイド前駆体の変換に依存していることを示すことで、「腫瘍は生殖腺である」というドグマに異を唱え、アンドロゲン受容体シグナル伝達と生存リスクを決定づける代謝および系統の可塑性のスペクトラムを明らかにしている。
🧬 biology
Apparent 3D-structural variant-effect signal is explained by variant category, not structure: a category-matched evaluation across nine disease loci
本研究は、3Dクロマチン構造破壊スコア（ARCHCODE）が病原性に対して示す見かけ上の予測能は、真の構造情報によるものではなく、主に変異のカテゴリーによるアーティファクトであることを示しており、これは、CADDやphyloPといった既存の予測手法とは異なり、カテゴリーを一致させた対照群を用いて評価した場合に、その性能が偶然レベルまで崩壊することから明らかである。
🧬 biology
Nest volume shapes termitophile abundance in Constrictotermes cyphergaster colonies
本研究は、*Constrictotermes cyphergaster*のコロニーにおいて、巣の容積が初期の侵入を促進するのではなく、定着後の収容力を高めることによって、共生者の絶対的な個体数を正に予測すること、および、共生者とホストワーカーの比率がすべてのコロニーサイズにおいて一定であることを示している。
🧬 biology
PDIA6 promotes glioma malignancy by activating the IRE1α- p-HSP27 signaling axis
本研究は、PDIA6がIRE1α-p-HSP27シグナル伝達軸を活性化することで、グリオーマにおいて癌遺伝子として機能し、それによって腫瘍の進行を促進し、患者の不良な予後と相関していることを示している。
🧬 biology
Genome sequence and annotation of Botrytis cinerea UCA992 strain
本論文は、代謝的に特異なボトリティス・シネレア（*Botrytis cinerea*）UCA992株のゲノム配列、デノボ・アセンブリ（GCA_053455415.1）、および機能注釈を提示するものであり、比較ゲノミクスおよび代謝研究を推進するための公開リソースを提供するものである。
🧬 biology
Multi-omics integration provides insights into the symbiotic evolution of the mycoheterotrophic medicinal orchid Gastrodia elata
本研究は、菌従属栄養性のラン科植物である*Gastrodia elata*の染色体レベルのゲノムアセンブリおよびパンゲノム解析を提示し、光合成遺伝子の広範な退化、長期的な共生関係にもかかわらず真菌由来の水平伝播が存在しないこと、そして栄養獲得と共生恒常性のための鍵となるメカニズムとして、特定の代謝適応および拡張したGAFP遺伝子ファミリーを特定したことを明らかにしている。
🧬 biology
Missense variants in KATNA1 alter microtubule dynamics and underlie dominant macular dystrophy
本研究は、KATNA1におけるヘテロ接合型のミスセンス変異が常染色体優性黄斑ジストロフィーの新規の原因であることを特定し、これらの変異がカタニンによる微小管切断を損ない、光受容体における細胞骨格の調節不全を引き起こすことを実証している。