🧬 biology
A cross-tissue single-cell and multiomics atlas of cold induced immunometabolic remodeling
本研究は、マウスにおける包括的な組織横断的シングルセル・マルチオミクス・アトラスを構築することで、寒冷曝露がいかにして組織選択的な免疫代謝のリモデリングを駆動するかを明らかにし、マルチオミクス・ノードであるChil3によって制御される肺内の特定の寒冷関連マクロファージ亜集団を浮き彫りにしている。
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q-bio
3881 件の論文
🧬 biology
Seasonal patterns in the prickly pear (Opuntioideae: Opuntia) phyllosphere microbiome: The potential for dynamic core communities
テキサス州全域におけるウチワサボテンのフィロスフィア（葉圏）マイクロバイオームに関するこの研究は、季節の変化とエコリージョンが微生物の多様性とネットワーク構造に大きく影響していることを明らかにしており、過酷な環境条件やジェネラリストとスペシャリストの分類群間の動的な相互作用により、安定した一貫したコア・コミュニティが存在しないことを示唆している。
🧬 biology
Independent Effects of APOL6 Overexpression and 5-Azacytidine on the Lipid Metabolic Landscape of Triple-Negative Breast Cancer: Parallel Transcriptomic and Lipidomic Analyses
本研究は、APOL6の過剰発現と5-アザシチジン処理の両方が、中性脂質の蓄積を促進し主要な生合成経路を抑制することによって、トリプルネガティブ乳がん細胞における脂質代謝景観を独立して再構築することを実証しており、それらの異なるメカニズムにもかかわらず、共通の代謝脆弱性を明らかにしている。
🧬 biology
Host Ontogeny Structures Gut Microbiome Composition and Pathogen-Associated Bacterial Communities in the Endangered Ethiopian Wolf (Canis simensis)
本研究は、31頭のエチオピアオオカミを用いたショットガンメタゲノム解析を利用することで、腸内細菌叢の組成および病原体負荷を決定づけるのはパックへの所属ではなく宿主の個体発生であることを明らかにし、成獣は亜成獣よりも潜在的な病原性細菌の累積存在量が高いことを示した。
🧬 biology
Fecal bacteriome in pediatric celiac disease in relation to the gluten-free diet and PFAS exposure: a multiomic study
この前向きなマルチオミクス研究は、グルテンフリー食がセリアック病児の糞便細菌叢を部分的に回復させるものの、それを完全に正常化させるには至らず、特定の細菌分類群が血清中のPFASレベルおよび疾患特異的な自己抗体と有意に相関していることを明らかにしている。
🧬 biology
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
本研究は、多様な空間トランスクリプトミクス技術および生物学的コンテキストにわたる20種類の最先端の細胞型アノテーション手法の包括的なベンチマークを提示しており、scANVI、Seurat、TACCOといったツールが全体として優れた性能を示す一方で、正確な微細な状態および動的な状態のアノテーションは依然として困難であり、かつコンテキスト依存性が高いことを明らかにしており、将来の手法にはオープンセット認識、空間的統合、および希少細胞集団へのより優れた対応が求められることを強調している。
🧬 biology
Feeding the Problem? Free-Ranging Cats and Wildlife Loss in Urban Park
本研究は、ブラジルの管理された都市公園における放し飼いの猫が、多様な野生動物に対して持続的な捕食活動を行っていることを示しており、その相互作用は人間の給餌ステーション付近に集中していることから、餌の提供が意図せずして捕食の機会を増加させている可能性があり、給餌の慣行を都市野生動物保護戦略へと統合する必要性を示唆している。
🧬 biology
A minimal Asgard archaeal ESCRT-III system remodels membranes across scales
本研究は、アスガルド古細菌由来の最小限の2サブユニットからなるESCRT-III/Vps4システムが、異なる集合モードを利用してナノスケールおよびマイクロスケールの両方の次元にわたって膜を変形・収縮させることで、真核生物様の膜リモデリング能を再現することを示している。
🧬 biology
Lineage predicts SIX effector repertoire but not Avr2 race genotype in Fusarium oxysporum isolates from Türkiye
トルコのフザリウム・オキシスパーラム（*Fusarium oxysporum*）分離株のゲノム解析によれば、SIXエフェクターのリパートリーは宿主の起源よりも系統学的系統によって強く予測される一方で、特定の*Avr2*レースの遺伝子型はコアゲノム距離や系統からは推測できないことが明らかになった。
🧬 biology
First isolation of viable Bartonella spp. from wild rodents and rodent fleas in Chile reveals circulation of a putative novel Bartonella specie
本研究は、チリにおける野生齧歯類および自然感染した*Neotyphloceras*属ノミから生存可能な*Bartonella*属細菌の分離に初めて成功したものであり、推定される新種の循環を確認するとともに、ワンヘルス（One Health）の枠組みにおけるこれらの齧歯類およびノミの宿主および媒介者としての役割を強化するものである。