🧬 生物学

Integrated Plasmodium falciparum Transcriptomics Reveals Coordinated Stress Adaptation and Metabolic Remodeling in Severe Malarial Anemia

本研究は、重症マラリア性貧血を呈する小児における熱帯熱マラリア原虫(*Plasmodium falciparum*)が、協調的なストレス適応、代謝再編、および強化されたプロテオスタシスを特徴とする独自の転写景観を示しており、これらが非重症マラリアを引き起こす原虫とは一線を画していることを明らかにしている。

Douglas Perkins, Clinton Onyango, Shamim Osata, Sharley Wasena, Ivy Hurwitz, Philip Seidenberg, Collins Ouma, Samuel Any (…)2026-10-16
🧬 生物学

Differential regulation of the Saccharomyces cerevisiae iron regulon by the nonsense- mediated mRNA decay pathway under iron scarcity

本研究は、ナンセンス変異依存性mRNA分解(NMD)経路が、転写因子Aft1/Aft2およびそれら下流の還元酵素標的を含む出芽酵母(*Saccharomyces cerevisiae*)の鉄レギュロンを差分的に制御することで、鉄不足時における細胞内鉄蓄積と増殖を制御していることを示している。

Jacqueline Carroll, Jana Chao, Bessie W. Kebaara2026-10-16
🧬 生物学

A Two-Population Delayed Evolutionary Game with Bayesian Learning for Cyber Defense

本論文は、検出および修復の遅延、センサーの被覆率、および学習速度がどのように相互作用してホップ分岐や再帰的なサイバー攻撃サイクルを誘発するかを分析するために、ベイズ学習を組み込んだ二集団遅延進化ゲームモデルを提案し、MicrosoftのGUIDEデータセットを用いた実証的なキャリブレーションを通じて、プーリングされたテレメトリと適度な修復ラグが許容可能な検出遅延の閾値を大幅に延長できることを示している。

Sina Keyhanian2026-10-16
🧬 生物学

Lifespan prediction in protostomes from trinucleotide composition

本研究は、保存されたゲノム領域における三塩基組成の相対頻度および観測値対期待値比を利用した機械学習モデルが、系統学的予測やゲノムサイズに基づく予測を上回る精度で、多様な前口動物種における寿命を正確に予測できることを示しており、分類群を越えた適用可能性の潜在性を示している。

Yuiki Kondo, Simon Jarman, Alyssa M. Budd2026-10-16
🧬 生物学

Host genotype and macro-chromosomal inversions influence gene expression and microbiome assembly in a complex holobiont

本研究は、ホヤの一種である*Styela plicata*において、巨大染色体逆位がゲノム全体の遺伝子発現のシフトを駆動し、特定の機能的に関連する微生物分類群の集合に影響を与えることで、ホロビオントの適応の主要な調節因子として機能することを実証している。

Carles Galià-Camps, Josep Ramoneda, Marta Pascual, Carlos Carreras, Xavier Turon, Celia Schunter, Cinta Pegueroles2026-10-16
🧬 生物学

A Proteome-Wide, Accelerated Deep Learning Framework for Structural Interactome Docking, Polygenic Disease Network Translation and Automated Druggability Assessment

本論文は、プロテオーム全体の構造予測と460基のNVIDIA H100 GPUを用いたディープラーニングによるドッキングを活用し、ヒト構造インタラクトームを迅速にマッピングし、心血管疾患のポリジェニック・ネットワークを統合し、創薬可能性を評価する、AI駆動型のハイパフォーマンス・コンピューティング・フレームワークを提示しており、数十万件もの新規な治療的タンパク質間相互作用を特定し、遡及的に検証することに成功した。

Vishwambhar Bhandare, Samadhan Khatal, Jürgen Scheele, Amit Agarwal, Ketan Sarode, Subhodeep Chatterjee, Urmi Kondhalkar (…)2026-10-16
🧬 生物学

EZPro-Fit: A Thermophile-Informed Cross-Modal Generative Framework Integrating DNA Language and Protein Structure for Enzyme Mutant Design

EZPro-Fitは、タンパク質の構造データとDNA配列、および好熱性分類学的情報を統合することで、宿主に適応した熱安定性酵素変異体の設計を行う新規なクロスモーダル生成フレームワークであり、実験的検証において融解温度と触媒活性の向上を実証的に示した。

Ran Xu, Linyan Zhao, Ronghua Pei, Yan Xu, Zhiyuan Zhou, Hongliang Duan, Leyi Wei, Liangzhen Zheng, Dongyang Liu, Jingjin (…)2026-10-16
🧬 生物学

Assessing non-invasive glymphatic MRI markers following short-term sleep loss

大規模な国際的データセットを用いた本研究は、一般的な非侵襲的MRIマーカーが単一のグリンパティック系ではなく、それぞれ異なる生理学的プロセスを反映していることを示しており、短期間の睡眠不足が主に睡眠依存的な血管周囲腔容積の変調を通じて脳の流体力学を変化させることを明らかにしている。

Masoud Tahmasian, Jorik Elberse, Daryna Apter, Daniel Aeschbach, Torbjörn Åkerstedt, Andreas Bauer, Florence Borgetto, K (…)2026-10-16
🧬 生物学

A minimal pangenome graph for Salminus brasiliensis,a freshwater migratory Neotropical flagship species: it takes two to tango

本研究は、新熱帯区の回遊魚である*Salminus brasiliensis*に関する2つの高品質な染色体レベルのコンセンサスゲノムと最小参照パンゲノムグラフを提示しており、保全、漁業管理、および進化研究を支援するための包括的なゲノムフレームワークを提供するものである。

Gabriel M. Yazbeck2026-10-16
🧬 生物学

Emergent locomotion from anatomy alone: a whole-connectome, conductance-based neuromechanical model of Caenorhabditis elegans

本研究は、学習を一切行わず、電子顕微鏡によるコネクトーム・データとコンダクタンスに基づく神経パラメータのみを用いて構築された、線虫(*C. elegans*)の個体全体を対象としたニューロメカニカル・モデルが、線虫の自然な運動能力および遺伝的摂動に対する堅牢性を再現することに成功したとともに、定量的な生物学的リアリズムを実現するためにはペプチドによるゲイン制御が必要不可欠であることを浮き彫りにしたことを示している。

Huan Li2026-10-16