An End-to-End Reproducible RNA-Seq Workflow from Raw Sequencing Reads to Differential Expression, Pathway Enrichment, and Biological Interpretation
本論文は、生データの処理からパスウェイ解析に至るまでのツールを統合した、モジュール式でバージョン管理が可能かつ完全に再現可能なエンドツーエンドのRNA-seqワークフローを提示し、ESR1変異とBET阻害剤治療が主要な生物学的パスウェイにおける相反的な転写変化をどのように駆動するかを明らかにする乳がんのケーススタディを通じて、その有用性を実証するものである。