🧬 biology
Worldwide diversity of hepatitis A and E viruses in urban wastewater
本研究は、38カ国62都市における下水メタゲノミクスを活用して、A型およびE型肝炎ウイルスの世界的な多様性をマッピングし、ネズミによる広範な人獣共通のHEV伝播を明らかにするとともに、ヒトおよび動物の肝炎株の両方を監視する上での下水サーベイランスの価値を実証した。
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q-bio
4311 件の論文
🧬 biology
Multi-locus genome-wide association study reveals the genetic architecture of kernel fat content in maize
本研究は、239系統のトウモロコシ純系を用いたマルチローカス・ゲノムワイド関連解析を通じて、子実脂肪含量の遺伝構造を解明し、200個の有意なQTNを特定するとともに、高油分トウモロコシ育種におけるマーカー選抜のための主要な候補として、プラスチド局在型キノンオキシドレダクターゼ遺伝子である*Zm00001d025166*を優先的に特定した。
🧬 biology
The first draft genome of the Amazonian manatee (Trichechus inunguis) provides insights into genome evolution and freshwater adaptation in Sirenia
本研究は、アマゾン川にのみ生息するアマゾンマナティー（*Trichechus inunguis*）の初となるドラフトゲノムを提示するものであり、そのゲノムサイズが海洋性の近縁種よりも小さいことを明らかにするとともに、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、イオンチャネル、および酸化代謝に関連する遺伝子ファミリーの拡大を特定しており、これらがアマゾンの環境への適応を支えている可能性が高いことを示している。
🧬 biology
Ellagitannin corilagin targets V-ATPase B2 to restore lysosomal Ca²⁺-AMPK metabolic axis and suppress microglia-driven neuroinflammation in aging mice
コリラギンは、V-ATPase B2を直接標的とすることでリソソームのCa²⁺-AMPK代謝軸を回復させ、それによってミクログリアの過剰活性化を抑制し神経機能を保護することにより、マウスにおける加齢に伴う認知機能低下および神経炎症を軽減する。
🧬 biology
On a Regulator-Centric Eligible Universe from Three Curated References, a Perturb-seq Edge Benchmark Has Too Few Evaluable Regulators to Resolve Direct-Edge Recovery from Matched Random
本研究は、精査された制御リファレンスと測定された遺伝子との重複が少ないことに制約されている現在のPerturb-seqベンチマークが、因果推論手法が一致するランダムなランキングから直接的な制御エッジを正常に復元できているかどうかを判別するための十分な統計的検定力を欠いていることを実証している。
🧬 biology
Class-Support Mismatch Dominates Protocol-Driven Optimism in Spatial Transcriptomics, with a Larger Residual Penalty for Graph Neural Networks
本研究は、空間トランスクリプトミクスにおけるランダム交差検証と空間交差検証の間の性能差が、空間的リークではなく主にクラス・サポートの不一致によって引き起こされることを示しており、交絡因子を厳密に制御した場合、グラフニューラルネットワークが非グラフ分類器よりも大幅に大きな真の空間外挿ペナルティを被ることを明らかにしている。
🧬 biology
An AI-Mechanistic Coagulation–Cardiovascular Framework for Reducing Arrhythmia Risk Under Vascular Stress
本研究は、血管ストレス下での不整脈リスク低減のための遺伝子導入プロトコルの安全性を予測するために、メカニスティックな常微分方程式モデルとLSTMサロゲートを組み合わせた、自己整合的かつ未検証のシミュレーションフレームワークを提示するものであり、慢性的な治療効果と急性的なエレクトロポレーションによる損傷を明示的に区別し、将来的な実験的検証の必要性を認めている。
🧬 biology
Analysis of LRRK2 G2019S carriers in the All of Us research program database
All of Usデータベースの研究は、パーキンソン病に関連するLRRK2 G2019S変異の生涯浸透率が約38%であり、家族歴が主要なリスク因子として特定され、保護的なN551K-R1398H-K1423Kハプロタイプのような特定の遺伝的修飾因子が疾患の発現に影響を与えていることを明らかにしている。
🧬 biology
Exploring the Interplay between Interoceptive Awareness and Social Cognition. A Network Analysis Study
214人の健康な成人を対象としたこのネットワーク解析研究は、内受容感覚の意識、特にその調節的および解釈的な次元が、認知的な共感と強く直接的な関連性を示す一方で、心の理論や表情認識との関連は弱く間接的であることを明らかにしており、社会認知における内受容感覚の役割が多次元的かつ差異的であることを強調している。
🧬 biology
PanoMito: mapping mitochondrial heterogeneity from morphofunctional profiling to single-mitochondrion spatial transcriptomics
本論文は、大規模なマルチモーダル・ミトコンドリア・データセットとディープラーニング・フレームワークを組み合わせた統合ツールボックスであるPanoMitoを紹介し、高精度なセグメンテーション、教師なし分類、および単一ミトコンドリア空間トランスクリプトミクスを可能にすることで、多様な種にわたるミトコンドリアの不均一性と形態・機能関係を体系的にマッピングするための包括的な枠組みを確立するものである。