🧬 生物学
A Calibration Framework for Bridging Household-Structured Microscopic and Macroscopic Epidemic Models
本論文は、世帯内のクラスター化を考慮するための校正パラメータを導入することにより、マクロ的な流行モデルの計算効率とミクロ的なモデルの構造的正確性を橋渡しし、個体レベルのダイナミクスへの高い忠実度を維持しつつ計算時間を大幅に削減する、新しい校正フレームワークを提案するものである。
🧬 Category
q-bio
6037 件の論文
🧬 生物学
BioGraphX-Sol: A Structure-Free, Fully Interpretable Protein Solubility Predictor Exceeds AlphaFold3-Based Methods and Reveals Nine Universal Cross-Species Determinants
BioGraphX-Solは、生物物理学的な根拠に基づく配列特徴を活用することで、AlphaFold3ベースの手法を凌駕し、9つの普遍的な種横断的溶解性決定因子を特定し、高精度な溶解性モデリングにおいて明示的な3D構造予測は不要であることを実証した、構造フリーで完全に解釈可能なタンパク質溶解性予測モデルである。
🧬 生物学
Nematodes as bioindicators of ecological status in midland Irish peatlands
本研究は、アイルランドの泥炭地における再湿潤化が栄養動態を効果的に安定させ、土壌食物網の初期回復を開始させる一方で、栄養段階の複雑性の完全な回復は長期的なプロセスであり、線虫のバイオインジケーター（生物指標）が、形態学的アプローチと分子生物学的アプローチの併用によって最も適切に特徴付けられる、未撹乱、劣化、および回復した生息地間の明確なコミュニティの変化を明らかにしていることを示している。
🧬 生物学
Single-cell and Spatial Transcriptomics Reveal Cholesterol Metabolism Heterogeneity in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Identify NSDHL as a Key Regulatory Gene
単一細胞トランスクリプトミクスと空間トランスクリプトミクスを機能的検証と統合することにより、本研究は膵管腺癌におけるコレステロール代謝の不均一性を明らかにし、NSDHLが高代謝表現型および悪性進行の重要な駆動因子であることを特定した。
🧬 生物学
Grow Old, but Do It Yourself
本論文は、老化に関する自己主導的な生物学的探究が孕む倫理的な複雑性を検討し、ツールや情報へのアクセスが個人に力を与える一方で、「最適化のドリフト（最適化の逸脱）」や不平等のリスクを生じさせるため、有意義な健康上の主体性を確保するには、個人の能力と責任ある制度的支援との間のバランスが必要であることを論じるものである。
🧬 生物学
OncoDigger Prioritizes Mutation-Associated Genes in Cancer-Specific PubMed Abstracts
OncoDiggerは、がん特異的な文書検索と遺伝子名の品質管理を活用することで、プールされた対照群やCancerMineのような既存のツールと比較して既知のがんドライバーとの一致度を大幅に高めることに成功した、がん特異的な文献から変異関連遺伝子を効果的に優先順位付けする、検証済みかつ再現可能なテキストマイニングツールである。
🧬 生物学
Can interspecific competition explain the absence of saline species in freshwaters? A test using water beetles
本研究は、塩分適応型の潜水甲虫である*Nebrioporus baeticus*が淡水生息地で見られないことは、種間競争のみでは説明できないことを示しており、なぜなら当該種は淡水種の*N. clarkii*に対して競争上の不利を被っていなかったためであり、このことは捕食や寄生といった他の要因がこの分布パターンに責任を負っている可能性が高いことを示唆している。
🧬 生物学
Escalating threat of vanA vancomycin-resistant Enterococcus revealed through integrated statewide genomic surveillance in Australia
オーストラリアのビクトリア州における6年間にわたる約1,600株のバンコマイシン耐性vanA型エンテロコッカス・フェシウム（Enterococcus faecium）分離株の州規模のゲノムサーベイランスは、特定の持続的なクローンの優占、多剤耐性プラスミドを保有するリネゾリド耐性菌の最近の出現、および伝播と進化する耐性脅威を追跡するためのこのようなモニタリングの極めて高い価値を明らかにした。
🧬 生物学
Maternal progesterone signaling establishes lifelong oral homeostasis
妊娠中の母体プロゲステロンシグナル伝達は、発達中の唾液腺におけるドコサヘキサエン酸（DHA）の動員を促進することで生涯にわたる口腔恒常性を確立し、それが適切な腺の成熟と健康な口腔マイクロバイオームの維持に不可欠となり、それによって成人期における全身性の代謝機能不全を防止する。
🧬 生物学
Genetic dissection of fiber quality traits in an interspecific Gossypium barbadense × Gossypium darwinii recombinant inbred lines population
本研究は、高密度遺伝地図および種間交雑種である*Gossypium barbadense* × *Gossypium darwinii*の組換え近交系集団から得られた複数年の表現型データを利用して、安定したQTLおよび候補遺伝子*ZINC FINGER PROTEIN*を含む第D07染色体上の主要なホットスポットを含む89個の量的形質遺伝子座を特定し、それによって分子育種を通じた綿繊維の品質および収量の向上に向けた貴重な遺伝資源を提供するものである。