Similarity analysis of DNA sequences through local distribution of nucleotides in strategic neighborhoods
本論文は、戦略的な近傍におけるヌクレオチドの局所的な分布に基づき、DNA配列を24次元ベクトルとして表現し、素因数分解の一意性を活用することで、効果的な系統解析のための線形時間計算量と低メモリ使用量を実現する、計算効率の高いアライメントフリーのアルゴリズムを提案する。
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本論文は、戦略的な近傍におけるヌクレオチドの局所的な分布に基づき、DNA配列を24次元ベクトルとして表現し、素因数分解の一意性を活用することで、効果的な系統解析のための線形時間計算量と低メモリ使用量を実現する、計算効率の高いアライメントフリーのアルゴリズムを提案する。
この研究は、PD-1がSHP2のホスファターゼ活性を活性化させるだけでなく、SHP2をTCRおよびCD28シグナルの凝縮体を解体するための非触媒的な生物物理学的障壁として機能する高度に開いたコンフォメーションへと再構築するという、二層的なメカニズムを通じてT細胞の活性化を抑制することを明らかにしている。
本研究は、ラットにおける生後早期の母子分離が、前頭前皮質のミトコンドリア生体エネルギー論を強化するというレジリエントな表現型を誘発し、それが成体におけるストレス誘発性のネガティブな認知バイアスに対する保護作用をもたらすことを示している。
本研究は、核およびミトコンドリアの遺伝マーカーを用いて、更新世の気候変動および地質学的イベント、特にアンデス山脈の隆起とパナマ地峡の形成が、フン虫の一種である*Canthon cyanellus*の歴史的な分岐と個体群の拡大を促進し、その結果、隠蔽種を含む可能性のあるメキシコとコロンビアにおける明確な系統をもたらしたことを実証している。
本研究は、マウスにおける二酸化炭素濃度の増加が、脳全体の神経活動および生理学的反応において明確かつ非線形なパターンを引き起こすことを示しており、10%のCO₂による不安様状態と20%のCO₂によるパニック様状態を、独自の行動、自律神経、およびネットワークレベルの神経学的特徴を通じて区別している。
地中海盆地における50のキシフィナ・ゼネラ(*Xiphinema*)個体群の多変量形態測定学とマルチローカス分子プロファイリングを統合することにより、本研究は、4つの新種の記載、2つの隠蔽種複合体の特定、および利用可能な遺伝資源の拡充を通じて、種境界を解明する。
本論文は、インドのウッタラーカンド州の混合落葉広葉樹林から得られた、コルティナリウス属(*Cortinarius*)の3つの新種(*C. umbrinatus*、*C. subochraceus*、および*C. roseolamellosus*)について、その形態学的特徴、図解、およびnrITS配列に基づく分子系統解析を記述するものである。
本研究は、ベンゾ[a]ピレンへの曝露が、酸化ストレスとコレステロール合成およびビタミンD代謝経路の破綻を結びつけることにより、ゼブラフィッシュ胚における代謝再プログラミングと発生毒性を誘発することを実証している。
職業的曝露を模したラットへの慢性的なホルムアルデヒド吸入は、パルブアルブミン陽性介在ニューロンの領域特異的な神経変性、神経炎症、および認知・運動機能障害を引き起こし、解剖実習の現場で働く個人に対する重大な神経学的リスクを浮き彫りにしている。
本論文は、熱雑音に対する機能座標の軟らかさに基づく統一的な力学的パラメータを導入することで、生物学的情報機械を集団モードへと分解し、それによって容量とエネルギーコストに関する一貫した熱力学的限界を導出し、リボソーム、イオンポンプ、およびシナプスの経験的挙動を予測することに成功した。