NatCodon: protein-structure-informed de novo codon sequence design for efficient protein expression
NatCodonは、タンパク質の構造情報を活用して共翻訳的フォールディングのためにコドン配列を最適化する生成モデルであり、希少コドンを戦略的に配置することで可溶性タンパク質の収量を向上させ、これまで困難であった標的の発現を可能にするという点で、既存の頻度ベースの手法を大幅に凌駕している。
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NatCodonは、タンパク質の構造情報を活用して共翻訳的フォールディングのためにコドン配列を最適化する生成モデルであり、希少コドンを戦略的に配置することで可溶性タンパク質の収量を向上させ、これまで困難であった標的の発現を可能にするという点で、既存の頻度ベースの手法を大幅に凌駕している。
本論文は、ConvNeXt-V1を利用して静止した足跡画像から動物の種を自動的に分類し、かつ足の負傷を検出する統合されたディープラーニングシステムを提示しており、12クラスの設定において高い精度を達成するとともに、負傷検出は種判別から切り離された場合に特に効果的であることを示している。
本研究は、母体の高脂肪食による過剰な肥満が、子の免疫系、腸管系、および代謝系における潜在的な性差を伴う脆弱性をプログラミングし、それが出生後の肺炎球菌(Streptococcus pneumoniae)感染によって多系統の機能不全として顕在化することを実証している。
本研究は、熱安定性[FeFe]-ヒドロゲナーゼTk HydA2の触媒バイアスが、その鉄硫黄クラスターの第一および第二配位圏における異なる摂動が、速度論的、静電的、およびレドックス・リレー効果を相乗的に調節することで、酵素の可逆的なH2相互変換を微調整するという、分散型制御モデルによって支配されていることを明らかにしている。
本研究は、METTL3-IGF2BP3 m⁶A軸がハンチントン病における変異ハンチンチン蓄積と神経変性の決定的な駆動因子であることを特定し、このエピトランスクリプトーム経路を標的とすることで、影響を受けた細胞におけるmHTTの毒性と炎症を選択的に減少させることを実証している。
本研究は、miR-217がENO1を直接標的としてダウンレギュレーションすることにより、その後のAKT1シグナル伝達経路および上皮間葉転換を抑制し、細胞増殖を抑制してアポトーシスを促進するというメカニズムを通じて、膵癌において腫瘍抑制因子として機能することを実証している。
本研究は、PTPRNの高メチル化による抑制に特徴付けられる保存されたエピジェネティック・転写軸を統合的なメカニズムとして特定しており、これが思春期由来細胞における初期の神経発達上の摂動と、成人の脳における持続的な分子変化とを結びつけている。
本研究は、空腹時の中強度ランニング中における後期血糖応答フェノタイプ(∆G)が、複数回の試行の平均値として用いた場合にのみ信頼できる指標となることを特定しており、これはレクリエーションレベルの運動実施者において骨格筋指数との相関を示す一方で、この関連性は性別および運動強度によって混同されるため、∆Gは筋肉量の直接的なバイオマーカーではないことを示している。
本研究は、メンデルランダム化解析、ネットワーク解析、および実験的検証を統合することで、糖尿病性腎症の治療における小正通絡方(Xiaozhengtongluo formula)の主要な治療標的としてAPOD、IGFBP3、およびLPLを特定・検証し、それらの因果関係と基礎となる分子メカニズムを解明するものである。
本論文は、2025年までのフロリダ州における非在来種の両生類および爬虫類の包括的な目録を更新するものであり、歴史的にはキューバからの貨物輸送によって、現在はペット取引によって、現在64の非在来分類群が定着していることを明らかにし、同時に新たな差し押さえ、定着に至らなかった導入、および分類学的改訂についても記録している。